MEGA 저장 공간의 특정한 폴더에 파일을 업로드해야 한다면, 가장 먼저 폴더를 더블클릭해서 열어보자. 페이지의 우측 상단 면에서 이 옵션을 찾아볼 수 있다. 폴더 전체를 업로드하고 싶다면, 대신 폴더 업로드를 클릭한다. 컴퓨터의 파일 위치에 가서 업로드하고자 하는 파일을 한 번 클릭한다. 여러 파일을 한 번에 선택하려면, Ctrl (윈도우) 혹은 ⌘ Command (맥)을 누르고 업로드하고 싶은 파일을 각각 클릭한다. 창의 우측 하단 코너에 있으며, 클릭하면 선택한 파일이 MEGA에 업로드되기 시작한다. 폴더 전체를 업로드하려면, 대신 업로드를 클릭한다. 인터넷 속도와 파일 용량에 따라 몇 초에서 몇 시간까지도 소요될 수 있다. MEGA에서 삭제하고 싶은 파일이 있다면, 쓰레기통으로 옮겨보자:  마우스 커서로 파일을 선택한다. 파일의 우측 하단 코너에 있는 ⋯를 클릭한다. 나타나는 드롭다운 메뉴에서 제거를 클릭한다. 메시지가 나타나면 예를 클릭한다. 창의 우측 하단 코너에 있는 세모 화살표 모양과 비슷한 "쓰레기통" 아이콘을 클릭하고, 페이지의 우측 상단 면에 있는 쓰레기통 비우기를 클릭한다. 그리고 메시지가 나타나면 비우기를 클릭해보자.
필요할 경우 폴더를 열기. 파일 업로드 클릭하기. 업로드할 파일 선택하기. 열기 클릭하기. 파일 업로드가 완료될 때까지 기다리기. 파일 삭제하기. 쓰레기통 비우기.