Nếu cần phải cách ly cá, bạn cũng sẽ cần khử trùng bể cá để ngăn ngừa bệnh lây lan cho những con cá khác. Bạn cũng nên khử trùng bể cá trước khi thả cá trở lại bể. Đổ hết nước bể cá và lấy tất các vật dụng trong bể ra ngoài. Những cây này không khử trùng được, do đó tốt nhất là nên mua cây mới, dù là cây thật hay cây giả bán ở cửa hàng. Nếu dưới đáy bể cá có lớp sỏi tự nhiên, bạn cần lấy hết sỏi trong bể ra và nướng trong khay làm bánh ở nhiệt độ 232 độ C trong 1 tiếng, sau đó để nguội hẳn. Không nướng sỏi có phủ bất cứ vật liệu nào bên ngoài, vì lớp phủ có thể bị chảy ra. Trong trường hợp này, có lẽ tốt hơn là bạn nên vứt bỏ sỏi cũ và mua sỏi mới. Pha 1 phần thuốc tẩy với 9 phần nước máy sạch trong bình xịt. Dùng loại thuốc tẩy gia dụng không chứa các chất tẩy rửa khác. Đừng bao giờ dùng thuốc tẩy khi cá còn trong bể, vì như vậy cá sẽ chết. Xịt dung dịch thuốc tẩy vào trong bể. Để yên trong 10 – 15 phút. Bạn cần rửa thật sạch thuốc tẩy để nước không bị ô nhiễm khi thả cá trở lại bể. Rửa nhiều lần, sau đó rửa thêm một lần nữa để đảm bảo an toàn. Dùng khăn giấy lau khô bể cá. Ngâm khoảng 10 phút, sau đó rửa lại nhiều lần bằng nước trước khi cho lại vào bể.
Tháo cạn nước bể cá. Vứt bỏ cây thủy sinh trong bể. Xử lý sỏi trong bể cá. Pha dung dịch thuốc tẩy và nước. Rửa bể cá nhiều lần. Bỏ tất cả các vật khác trong bể cá (bộ lọc, cây nhựa, v.v…) vào xô hoặc bát đựng thuốc tẩy.