Việc giữ vệ sinh cho sáo là rất quan trọng và nó cũng giúp cho sáo luôn ở tình trạng tốt.  Bạn có thể rửa những chiếc sáo nhựa trong máy rửa bát hoặc bồn rửa chứa nước xà phòng ấm. Hãy tháo các bộ phận ra trước khi rửa và nhớ rửa cho hết xà phòng.  Bạn có thể chùi miệng sáo bằng một chiếc bàn chải cũ hoặc dụng cụ lau tẩu. Để cho chiếc sáo của bạn khô hoàn toàn trước khi tiếp tục chơi. Đối với những chiếc sáo dọc bằng gỗ thì hãy tháo rời sáo và dùng khăn mềm cẩn thận lau hơi ẩm phía bên trong. Giữ sáo dọc trong bao khi không sử dụng để sáo không bị vỡ hoặc bị hư hỏng lỗ hình còi phía trên, bởi vì hư hỏng ở đó có thể khiến chiếc sáo trở nên vô dụng. Bảo vệ nhạc cụ của bạn khỏi sự thay đổi nhiệt độ đột ngột và để nó tránh xa ánh mặt trời trực tiếp, và không bao giờ được để nó trong một chiếc xe ấm hoặc gần nguồn nhiệt. Lưu ý này đặc biệt quan trọng đối với những chiếc sáo dọc làm bằng gỗ, nhưng cũng cần áp dụng với bất kì nhạc cụ nào khác. Hơi nước ngưng tụ trong ống sáo có thể gây ra nghẽn. Bạn có thể giảm thiểu tắc nghẽn ở cả sáo nhựa lẫn sáo gỗ bằng cách làm nóng khớp nối ở phần đầu bằng cách dùng nhiệt toả ra từ bàn tay, dưới cánh tay hoặc trong túi trước khi chơi.  Nếu hơi nước đã tích tụ trong ống sáo thì hãy che phủ hoàn toàn lỗ ở đầu ống sáo bằng một tay và thổi ra thật mạnh vào ống sáo. Làm như vậy sẽ giúp thổi bay độ ẩm dư thừa. Nếu sáo vẫn bị nghẽn thì bạn có thể rửa sạch ống sáo bằng cách trộn một thìa canh nước làm sạch máy rửa chén với 3 thìa canh nước. Đổ dung dịch rửa này vào trong sáo qua lỗ miệng hoặc từ bên dưới và để nguyên dung dịch trong ống sáo một lúc trước khi rửa sạch. Hãy để cho sáo của bạn khô hoàn toàn trước khi tiếp tục chơi.
Lau chùi sáo của bạn sau mỗi lần sử dụng. Cất chiếc sáo của bạn trong một bao đựng. Bảo vệ chiếc sáo khỏi nhiệt độ khắc nghiệt. Học cách xử lí tắc nghẽn.