अगर आप अपने मेगा स्टोरेज के किसी खास फोल्डर में एक फ़ाइल को अपलोड करना चाहते हैं, तो पहले उस फोल्डर पर डबल-क्लिक करके, उसे खोलें। इस ऑप्शन को आप पेज के अपर-राइट साइड में पाएंगे। अगर आप एक पूरे फोल्डर को अपलोड करना चाहते हैं, तो फिर Folder Upload क्लिक करें। अपने कंप्यूटर पर फ़ाइल की लोकेशन पर चले जाएँ, फिर आपके द्वारा अपलोड किए जाने वाली फ़ाइल को एक बार क्लिक करें। एक-साथ काफी सारी फाइल्स को एक बार में सिलेक्ट करने के लिए, यूज किए जाने वाली हर एक फ़ाइल को क्लिक करते हुए, या तो Ctrl (विंडोज) या फिर ⌘ Command (मैक) को दबाकर रखें। ये विंडो के बॉटम-राइट कॉर्नर में होगा। आपके द्वारा चुनी हुई फाइल्स मेगा पर अपलोड होना शुरू हो जाएंगी। अगर आप एक पूरे फोल्डर को अपलोड कर रहे हैं, तो आप Upload को क्लिक करेंगे। इसमें कुछ सेकंड्स से लेकर कई घंटों तक का वक़्त लग सकता है, जो कि पूरी तरह से आपके इंटरनेट की स्ट्रेंथ पर और फ़ाइल (फाइल्स) के साइज़ पर डिपेंड करता है। अगर आप मेगा से फाइल्स को हटाना चाहते हैं, तो आप उन्हें Rubbish Bin में मूव कर सकते हैं:  अपने माऊस कर्सर से फ़ाइल को सिलेक्ट करें। फ़ाइल के लोअर-राइट कॉर्नर में ⋯ क्लिक करें। सामने आने वाले ड्रॉप-डाउन मेन्यू में Remove क्लिक करें। प्रॉम्प्ट होने पर Yes क्लिक करें। "Rubbish Bin" आइकॉन, जो कि विंडो के बॉटम-लेफ्ट कॉर्नर पर, एरो (तीर) से बने हुए ट्राएंगल की तरह नजर आता है, को क्लिक करें, पेज के अपर-राइट साइड में Clear the rubbish bin क्लिक करें और फिर पूछे जाने पर Empty क्लिक करें।
अगर जरूरत हो, तो एक फोल्डर को खोलें: File Upload क्लिक करें: अपलोड करने के लिए एक फ़ाइल को सिलेक्ट करें: Open क्लिक करें: अपनी फ़ाइल के अपलोड होने का इंतज़ार करें: जरूरत के हिसाब से फाइल्स को हटा दें: Rubbish Bin को एंप्टी (खाली) कर दें: