नियमित रूप से इस्तेमाल करने के लिए रूट से लॉगिन करने की सलाह नहीं दी जाती, क्योंकि रूट के द्वारा किसी भी कमांड को बहुत आसानी से रन किया जा सकता है और हो सकता है कि कोई ऐसी कमांड रन हो जाए, जो आपके सिस्टम की कार्यप्रणाली को ही रोक दे और यदि आप आपकी मशीन पर SSH सर्वर इस्तेमाल करते हैं, तो ये आपके सिस्टम की सुरक्षा को भी भंग कर सकती है। केवल तभी रूट से लॉगिन किया करें, जब आप आपातकालीन स्थिति में सिस्टम पर सुधार कार्य कर रहे हों, जैसे कि डिस्क फ़ैल होना या फिर लॉक अकाउंट को रीस्टोर करना।  रूट की तरह लॉगिन करने के लिए sudo या su का इस्तेमाल करना, आपको रूट पर लॉगिन करके जबरदस्ती में होने वाले नुकसान से बचाकर रखेगा। इस तरह की कमांड्स का इस्तेमाल करते हुए, यूजर के पास किसी कमांड के बारे में ज्यादा अच्छी तरह से सोच-विचार करने का मौका रहता है और इस तरह से वो सिस्टम में होने वाले नुकसान को होने से रोक सकता है। कुछ डिस्ट्रीब्यूशन, जैसे कि, उबुन्टु (Ubuntu) रूट अकाउंट को तब तक लॉक ही रखता है, जब तक कि आप इसे मैन्युअली अनलॉक नहीं कर लेते। ये ना सिर्फ आपके सिस्टम को यूजर्स के द्वारा रूट अकाउंट पर रहते हुए, अनजाने में हुई किसी गलती से होने वाले नुकसान से बचाता है, साथ ही ये आपके सिस्टम को संभावित हैकर्स की नजरों से भी बचाकर रखेगा, क्योंकि रूट अकाउंट पर ही हैकर्स की पैनी नजर होती है। यदि रूट अकाउंट लॉक रहता है, तो हैकर इस पर एक्सेस नहीं पा सकेंगे। रूट को उबुन्टु पर अनलॉक करने की जानकारी पाने के लिए इस लेख का पहले वाला भाग पढ़ें। root एंटर करें: यदि रूट अकाउंट अनलॉक है और आपको इसका पासवर्ड भी पता है, तो जब आपसे इस यूजर अकाउंट से रूट अकाउंट पर लॉगिन करने का कहा जाए, तो आप लॉगिन कर सकते हैं। जब लॉगिन करने को कहा जाए, तब यूजर की जगह पर root एंटर करें। यदि आपको कमांड रन करने के लिए, रूट पर एक्सेस की जरूरत है, तो पहले वाले भाग में दी हुई विधि का इस्तेमाल करें। root को यूजरनेम की तरह एंटर करने के बाद, पूछे जाने पर, रूट पासवर्ड एंटर करें।  ज्यादातर मामलों में, "password" ही रूट पासवर्ड होता है। यदि आपको रूट पासवर्ड नहीं पता है, या आप भूल चुके हैं, तो इसे रीसेट करने के लिए, अगले भाग को पढ़ें। उबुन्टु में, रूट अकाउंट लॉक रहता है, और इसे तब तक इस्तेमाल नहीं किया जा सकता, जब तक ये अनलॉक ना हो जाए। हो सकता है कि रूट एक्सेस किये हुए, आप जिस प्रोग्राम को रन करना चाह रहे हैं, उसका आपके सिस्टम पर कुछ खतरनाक प्रभाव पड़ने वाला हो। इसलिए रूट पर लॉगिन ना करने की और प्रोग्राम को रन करने के लिए sudo या su इस्तेमाल करने की सलाह दी जाती है।
अस्थायी रूप से रूट एक्सेस पाने के लिए अन्य विधियों का इस्तेमाल करें: लिनक्स पर लॉगिन करते वक्त, एक यूजर की तरह . यूजर पासवर्ड की जगह पर रूट पासवर्ड एंटर करें: रूट की तरह लॉगिन किये हुए किसी भी जटिल प्रोग्राम को रन करने से बचें: