Đăng nhập với quyền kiểm soát đầy đủ nên được hạn chế trong sử dụng thông thường bởi khi làm vậy, ta rất dễ thực hiện những lệnh có thể khiến hệ thống không hoạt động được. Đồng thời, nó còn chứa đựng rủi ro về mặt bảo mật, đặc biệt là khi máy chủ SSH đang được chạy trên máy tính. Chỉ đăng nhập với quyền truy cập đầy đủ khi cần sửa chữa khẩn cấp, chẳng hạn như xử lý lỗi ổ đĩa hay khôi phục tài khoản bị khóa.  Sử dụng sudo hoặc su thay vì đăng nhập với quyền truy cập đầy đủ sẽ giúp ngăn ngừa những tổn hại không mong muốn trong lúc đăng nhập. Những lệnh này cho người sử dụng cơ hội cân nhắc lệnh trước khi phát sinh tổn hại nghiêm trọng. Một số phiên bản, chẳng hạn như Ubuntu, khóa tài khoản root cho đến khi bạn tự mở nó. Điều này không chỉ ngăn không để người sử dụng vô tình gây ra quá nhiều tổn hại khi sử dụng tài khoản root mà còn bảo vệ hệ thống khỏi tin tặc:  tài khoản root thường là mục tiêu đầu tiên của chúng. Khi bị khóa, tin tặc sẽ không thể chiếm được quyền truy cập với tài khoản root. Bạn có thể tham khảo hướng dẫn mở khóa tài khoản root trên Ubuntu ở phần trước. root  ở trường người sử dụng khi đăng nhập vào Linux. Nếu tài khoản root không bị khóa và nếu biết mật khẩu, bạn có thể đăng nhập với quyền truy cập root khi được yêu cầu đăng nhập thông thường. Nhập root ở trường người sử dụng khi được yêu cầu đăng nhập. Nếu cần truy cập root để thao tác một lệnh nào đó, hãy dùng phương pháp ở phần trên. Sau khi nhập root vào trường tên người sử dụng, nhập mật khẩu root khi được yêu cầu.   Trong nhiều trường hợp, mật khẩu root có thể chỉ là "password". Nếu không biết hoặc quên mật khẩu root, xem hướng dẫn đặt lại mật khẩu ở phần sau. Trong Ubuntu, tài khoản root bị khóa và không dùng được cho đến khi được mở. Có thể khi dành được quyền truy cập root, chương trình mà bạn định chạy sẽ tác động tiêu cực đến hệ thống. Thay vì đăng nhập bằng tài khoản root, sudo và su được khuyên dùng để chạy chương trình.
Cân nhắc sử dụng những phương pháp khác để có được quyền truy cập root tạm thời. Nhập . Nhập mật khẩu root ở trường mật khẩu người sử dụng. Tránh chạy chương trình phức tạp trong lúc đăng nhập bằng tài khoản root.