Door het water te verversen help je om levende algen te vernietigen en voorkom je meer aangroei in het pompsysteem van de fontein. Laat de fontein volledig leeglopen en aan de lucht drogen voordat je opnieuw opvult. Indien mogelijk moet je de fontein afspoelen en alle resten van het oppervlak van de fontein verwijderen. Doe dit ook bij decoratieve zaken zoals steentjes voordat je opnieuw met water opvult. De pomp is verantwoordelijk voor het stuwen van water door de fontein, waardoor algen minder kans krijgen om te groeien. Schrob de onderdelen van de pomp met een spons of een harde tandenborstel schoon en gebruik hiervoor gedistilleerd water. Indien je de pomp moet openmaken om bepaalde onderdelen te kunnen bereiken, volg dan de richtlijnen van de fabrikant. Alle pompen zijn anders en wat voor de ene werkt, werkt daarom niet voor de andere. De pomp zal niet functioneren tenzij deze volledig onder water staat. Houd daarom de pomp onder water zodat het water in beweging blijft. Hierdoor zal je de aangroei van algen op het oppervlak van de pomp helpen te vermijden. Het komt vaak voor dat je tijdens de eerste paar dagen na het plaatsen van een fontein water moet toevoegen zodat de pomp onder water blijft staan. Je moet je fontein elke twee maanden grondig reinigen. Schakel de fontein uit, laat deze leeglopen en wrijf het oppervlak af met een oplossing speciaal bedoeld voor het reinigen van fonteinen. Deze kun je online of in een gespecialiseerde winkel vinden. Ook afwasmiddel kan hiervoor dienen.  Kies voor afwasmiddel als je een product wilt gebruiken dat veilig is voor de dieren die je fontein misschien gebruiken. Dit kunnen vogels of kleine zoogdieren zijn. Gebruik een tandenborstel om alle algen en organische materie van de fontein af te schrobben. Spoel de fontein zeker af nadat je zeep hebt gebruikt, want anders kan dit na verloop van tijd het oppervlak van de fontein beschadigen. Reinig de leidingen van de fontein met behulp van leidingreinigers. Deze kun je in gespecialiseerde woon- en tuincentra vinden. Gebruik ze om de binnenkant van de leidingen te schrobben.
Ververs het water van je fontein maandelijks. Reinig de waterpomp. Zorg ervoor dat de pomp onder water staat. Reinig de fontein grondig.