Cambiar el agua ayuda a eliminar las algas vivas y previene la acumulación en el sistema de bombeo. Vacía completamente el agua de la fuente y deja que se seque al aire antes de llenarla. Si es posible, lava la fuente eliminando cualquier acumulación o residuo de la superficie y limpia cualquier elemento decorativo, como las piedras, antes de volver a llenarla. La bomba es la responsable de hacer circular el agua a través de la fuente, reduciendo la capacidad de crecimiento de las algas. Frota las piezas de la bomba con una esponja o un cepillo de dientes de cerdas firmes y agua destilada. Si necesitas abrir la bomba para llegar a las partes interiores, sigue las instrucciones del fabricante. Cada bomba es diferente y lo que funciona en una puede no hacerlo en otra. La bomba no puede funcionar a menos que esté completamente sumergida. Mantenla así para garantizar la circulación el agua y evitar que las algas se acumulen y crezcan en la superficie. Es común tener que añadir agua a la fuente durante los primeros días después de ponerla en funcionamiento para asegurarse de que la bomba permanezca sumergida. La fuente debe recibir una limpieza profunda cada dos meses. Apágala, drénala y límpiala con una solución limpiadora para fuentes, que puede estar disponible en una tienda especializada o en línea, o con un detergente lavaplatos.  Opta por el lavaplatos si quieres un producto que sea amigable con los animales, como las aves y los pequeños mamíferos que pueden hacer uso de la fuente. Pasa un cepillo de dientes por encima de la fuente para eliminar las algas y otras materias orgánicas. Asegúrate de enjuagar bien la fuente después de usar el detergente, ya que puede dañarla si se deja en su superficie. Limpia los interiores de los tubos de la fuente usando unos limpiapipas como los que se pueden encontrar en cualquier ferretería o tienda de artesanías.
Cambia el agua de la fuente mensualmente. Limpia la bomba de agua. Sumerge la bomba. Limpia profundamente la fuente.