주로 티아지드 계 이뇨제나 인산염이 함유된 제제를 처방한다. 하이드로크로로티아지드(티아지드 계 이뇨제)는 뼈의 칼슘을 유지하여 소변으로 배출되는 칼슘의 양을 줄여주기 때문에 칼슘 결석이 생길 확률을 줄여준다. 이런 약은 염분 섭취를 줄였을 때 제일 잘 듣는다. 알로푸리놀(제품명: 자일로프림, 알로프림)은 소변을 알카리성으로 유지하고 혈액과 소변 속 요산 수치를 낮춘다. 때로 요산 결석을 완전히 용해시키기 위해 알로푸리놀과 다른 알카리성 약제를 함께 사용한다 . 단기간 항생제를 투여하여 소변에 스트루바이트 결석의 원인이 되는 박테리아가 생기지 못 하게 한다. 보통 의사는 환자에게 항생제를 장기간 사용하고 싶어하지 않는다. 그러나 항생제를 단기간 사용하는 것은 크게 도움이 된다. 주로 카테터로 알칼리성 약제를 신장에 투여하는 치료법이다. 보통 이 치료법은 시스틴 결석을 없애는 데 효과적이며 특히 물을 밤낮으로 많이 마시면 더욱 효과적이다. 부갑상선 기능 항진증, 즉 신장 결석의 원인이 부갑상선인 경우에만 사용할 수 있는 치료법이다. 부갑상선 기능 항진증이 있으면 칼슘 결석이 생길 위험이 있다. 수술로 목에 있는 부갑상선 두 개 중 하나를 제거하면 부갑상선 기능 항진증도 치료하고 신장 결석이 생길 가능성도 차단할 수 있다.
칼슘 결석 치료제 복용하기. 의사에게 요산 결석을 완화시킬 수 있는 약을 처방 받기. 항생제로 스트루바이트 결석 치료하기. 소변을 알카리성으로 만들어 시스틴 결석 크기 줄이기. 수술로 칼슘 결석의 형성 막기.