¿Qué es la pangenómica?
What is pan genomics?
Pan genomics is a concept introduced in 2005 by Tettelin and Medini which eventually took root in bioinformatics. Pan genome is the complete gene repertoire of a particular taxonomic group: although initially applied to closely related strains of a species, it can be applied to a larger context like genus, phylum, etc. It is divided in two parts- The Core genome: Set of genes common to all the genomes under study (These are often housekeeping genes vital for survival) and The Dispensable/Flexible Genome: Set of genes not present in all but one or some genomes under study. A bioinformatics tool BPGA can be used to characterize the Pan Genome of bacterial species.
La pangenómica es un concepto introducido en 2005 por Tettelin y Medini que acabó arraigando en la bioinformática. El pangenoma es el repertorio génico completo de un grupo taxonómico concreto: aunque inicialmente se aplicó a cepas estrechamente relacionadas de una especie, puede aplicarse a un contexto más amplio como el género, el filo, etc. Se divide en dos partes: el Genoma central: conjunto de genes comunes a todos los genomas estudiados (a menudo son genes domésticos vitales para la supervivencia) y el Genoma prescindible/flexible: conjunto de genes no presentes en todos los genomas estudiados, excepto en uno o algunos. Se puede utilizar una herramienta bioinformática BPGA para caracterizar el Pangenoma de las especies bacterianas.
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