Qu'est-ce que l'annotation de l'ADN ?
Wat id DNA annotation?
DNA annotation or genome annotation is the process of identifying the locations of genes and all of the coding regions in a genome and determining what those genes do. An annotation (irrespective of the context) is a note added by way of explanation or commentary. Once a genome is sequenced, it needs to be annotated to make sense of it. Genes in a eukaryotic genome can be annotated using various annotation tools such as FINDER. A modern annotation pipeline can support a user-friendly web interface and software containerization such as MOSGA. Modern annotation pipelines for prokaryotic genomes are Bakta, Prokka and PGAP.

For DNA annotation, a previously unknown sequence representation of genetic material is enriched with information relating genomic position to intron-exon boundaries, regulatory sequences, repeats, gene names and protein products. This annotation is stored in genomic databases such as Mouse Genome Informatics, FlyBase, and WormBase. Educational materials on some aspects of biological annotation from the 2006 Gene Ontology annotation camp and similar events are available at the Gene Ontology website.

The National Center for Biomedical Ontology develops tools for automated annotation of database records based on the textual descriptions of those records.

As a general method, dcGO has an automated procedure for statistically inferring associations between ontology terms and protein domains or combinations of domains from the existing gene/protein-level annotations.
L'annotation de l'ADN ou l'annotation du génome est le processus qui consiste à identifier l'emplacement des gènes et de toutes les régions codantes dans un génome et à déterminer la fonction de ces gènes. Une annotation (quel que soit le contexte) est une note ajoutée en guise d'explication ou de commentaire. Une fois qu'un génome est séquencé, il faut l'annoter pour lui donner un sens. Les gènes d'un génome eucaryote peuvent être annotés à l'aide de divers outils d'annotation tels que FINDER. Un pipeline d'annotation moderne peut prendre en charge une interface web conviviale et une conteneurisation logicielle telle que MOSGA. Les pipelines d'annotation modernes pour les génomes procaryotes sont Bakta, Prokka et PGAP.

Pour l'annotation de l'ADN, une représentation séquentielle du matériel génétique précédemment inconnue est enrichie d'informations relatives à la position génomique, aux limites intron-exon, aux séquences régulatrices, aux répétitions, aux noms de gènes et aux produits protéiques. Cette annotation est stockée dans des bases de données génomiques telles que Mouse Genome Informatics, FlyBase et WormBase. Du matériel pédagogique sur certains aspects de l'annotation biologique, issu du camp d'annotation 2006 de Gene Ontology et d'autres événements similaires, est disponible sur le site web de Gene Ontology.

Le National Center for Biomedical Ontology développe des outils pour l'annotation automatique des enregistrements de bases de données sur la base des descriptions textuelles de ces enregistrements.

En tant que méthode générale, dcGO dispose d'une procédure automatisée pour déduire statistiquement les associations entre les termes de l'ontologie et les domaines protéiques ou les combinaisons de domaines à partir des annotations existantes au niveau des gènes/protéines.
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