Was ist GeneBass?
What is GeneBass?
GeneBass is a CRISPR-Cas9 screening platform for the high-throughput functional analysis of genes in mammalian cells. The GeneBass platform allows researchers to systematically activate or repress genes of interest and study their effects on cellular processes such as cell proliferation, differentiation, and survival. The system uses a pooled lentiviral library of guide RNAs targeting every gene in the human or mouse genome, which can be introduced into cells using viral transduction. The guide RNAs are designed to target specific regions of the genome adjacent to the transcription start sites of each gene, allowing for specific and efficient gene activation or repression. GeneBass experiments typically involve the transduction of large numbers of cells, followed by selection or sorting of cells based on specific phenotypes of interest. High-throughput sequencing of the guide RNA library before and after selection can be used to identify genes that are essential for specific cellular processes or that are involved in disease pathways.
GeneBass ist eine CRISPR-Cas9-Screening-Plattform für die funktionelle Hochdurchsatzanalyse von Genen in Säugetierzellen. Mit der GeneBass-Plattform können Forscher systematisch Gene von Interesse aktivieren oder unterdrücken und ihre Auswirkungen auf zelluläre Prozesse wie Zellproliferation, Differenzierung und Überleben untersuchen. Das System verwendet eine gepoolte lentivirale Bibliothek mit guide RNAs, die auf jedes Gen im Genom von Mensch oder Maus abzielen und durch virale Transduktion in die Zellen eingebracht werden können. Die Leit-RNAs sind so konzipiert, dass sie auf bestimmte Regionen des Genoms in der Nähe der Transkriptionsstartstellen jedes Gens abzielen und so eine spezifische und effiziente Aktivierung oder Unterdrückung der Gene ermöglichen. Bei GeneBass-Experimenten wird in der Regel eine große Anzahl von Zellen transduziert und anschließend werden die Zellen nach bestimmten Phänotypen ausgewählt oder sortiert. Die Hochdurchsatz-Sequenzierung der Guide-RNA-Bibliothek vor und nach der Selektion kann genutzt werden, um Gene zu identifizieren, die für bestimmte zelluläre Prozesse essentiell sind oder die an Krankheitsverläufen beteiligt sind.
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