¿Qué es la genómica comparativa?
What is comparative genomics?
The core of comparative genome analysis is the establishment of the correspondence between genes (orthology analysis) or other genomic features in different organisms. It is these intergenomic maps that make it possible to trace the evolutionary processes responsible for the divergence of two genomes. A multitude of evolutionary events acting at various organizational levels shape genome evolution. At the lowest level, point mutations affect individual nucleotides. At a higher level, large chromosomal segments undergo duplication, lateral transfer, inversion, transposition, deletion and insertion.[28] Ultimately, whole genomes are involved in processes of hybridization, polyploidization and endosymbiosis, often leading to rapid speciation. The complexity of genome evolution poses many exciting challenges to developers of mathematical models and algorithms, who have recourse to a spectrum of algorithmic, statistical and mathematical techniques, ranging from exact, heuristics, fixed parameter and approximation algorithms for problems based on parsimony models to Markov chain Monte Carlo algorithms for Bayesian analysis of problems based on probabilistic models.

Many of these studies are based on the detection of sequence homology to assign sequences to protein families.
El núcleo del análisis genómico comparativo es el establecimiento de la correspondencia entre genes (análisis ortológico) u otras características genómicas en distintos organismos. Son estos mapas intergenómicos los que permiten rastrear los procesos evolutivos responsables de la divergencia de dos genomas. Una multitud de acontecimientos evolutivos que actúan a distintos niveles organizativos conforman la evolución del genoma. En el nivel más bajo, las mutaciones puntuales afectan a nucleótidos individuales. En un nivel superior, grandes segmentos cromosómicos sufren duplicación, transferencia lateral, inversión, transposición, deleción e inserción. En última instancia, genomas enteros participan en procesos de hibridación, poliploidización y endosimbiosis, que a menudo conducen a una rápida especiación. La complejidad de la evolución del genoma plantea muchos retos apasionantes a los desarrolladores de modelos matemáticos y algoritmos, que recurren a un espectro de técnicas algorítmicas, estadísticas y matemáticas, que van desde algoritmos exactos, heurísticos, de parámetro fijo y de aproximación para problemas basados en modelos de parsimonia, hasta algoritmos de Monte Carlo con cadena de Markov para el análisis bayesiano de problemas basados en modelos probabilísticos.

Muchos de estos estudios se basan en la detección de homología de secuencias para asignar secuencias a familias de proteínas.
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