Wat id DNA annotation?
Wat id DNA annotation?
DNA annotation or genome annotation is the process of identifying the locations of genes and all of the coding regions in a genome and determining what those genes do. An annotation (irrespective of the context) is a note added by way of explanation or commentary. Once a genome is sequenced, it needs to be annotated to make sense of it. Genes in a eukaryotic genome can be annotated using various annotation tools such as FINDER. A modern annotation pipeline can support a user-friendly web interface and software containerization such as MOSGA. Modern annotation pipelines for prokaryotic genomes are Bakta, Prokka and PGAP.

For DNA annotation, a previously unknown sequence representation of genetic material is enriched with information relating genomic position to intron-exon boundaries, regulatory sequences, repeats, gene names and protein products. This annotation is stored in genomic databases such as Mouse Genome Informatics, FlyBase, and WormBase. Educational materials on some aspects of biological annotation from the 2006 Gene Ontology annotation camp and similar events are available at the Gene Ontology website.

The National Center for Biomedical Ontology develops tools for automated annotation of database records based on the textual descriptions of those records.

As a general method, dcGO has an automated procedure for statistically inferring associations between ontology terms and protein domains or combinations of domains from the existing gene/protein-level annotations.
Bei der DNA-Annotation oder Genom-Annotation geht es darum, die Positionen der Gene und aller kodierenden Regionen in einem Genom zu identifizieren und zu bestimmen, was diese Gene tun. Eine Annotation (unabhängig vom Kontext) ist eine Anmerkung, die als Erklärung oder Kommentar hinzugefügt wird. Sobald ein Genom sequenziert ist, muss es annotiert werden, damit es einen Sinn ergibt. Die Gene in einem eukaryotischen Genom können mit verschiedenen Annotationswerkzeugen wie FINDER annotiert werden. Eine moderne Annotationspipeline kann eine benutzerfreundliche Weboberfläche und eine Software-Containerisierung wie MOSGA unterstützen. Moderne Annotationspipelines für prokaryotische Genome sind Bakta, Prokka und PGAP.

Bei der DNA-Annotation wird eine bisher unbekannte Sequenzdarstellung des genetischen Materials mit Informationen angereichert, die die Position des Genoms mit Intron-Exon-Grenzen, regulatorischen Sequenzen, Wiederholungen, Gennamen und Proteinprodukten in Verbindung bringen. Diese Annotation wird in genomischen Datenbanken wie Mouse Genome Informatics, FlyBase und WormBase gespeichert. Bildungsmaterialien zu einigen Aspekten der biologischen Annotation, die auf dem Gene Ontology Annotation Camp 2006 und ähnlichen Veranstaltungen entstanden sind, sind auf der Gene Ontology Website verfügbar.

Das National Center for Biomedical Ontology entwickelt Tools für die automatische Annotation von Datenbankeinträgen auf der Grundlage der textlichen Beschreibungen dieser Einträge.

Als allgemeine Methode verfügt dcGO über ein automatisiertes Verfahren zur statistischen Ableitung von Assoziationen zwischen Ontologiebegriffen und Proteindomänen oder Kombinationen von Domänen aus den vorhandenen Annotationen auf Gen-/Proteinebene.
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