O que é a sequência de DNA?
Em bioinformática, a montagem de sequência refere-se ao alinhamento e fusão de fragmentos de uma sequência de DNA mais longa, a fim de reconstruir a sequência original. Isso é necessário, pois a tecnologia de sequenciamento de DNA pode não ser capaz de "ler" genomas inteiros de uma só vez, mas sim lê pequenos pedaços de entre 20 e 30.000 bases, dependendo da tecnologia usada. Normalmente, os fragmentos curtos (leia) resultam de sequenciamento de DNA genômico, ou transcrição genética (ESTs). O problema da montagem de sequência pode ser comparado a tirar muitas cópias de um livro, passando cada um deles através de um triturador com um cortador diferente, e juntar o texto do livro apenas olhando para as peças trituradas. Além da dificuldade óbvia desta tarefa, há algumas questões práticas extras: o original pode ter muitos parágrafos repetidos, e alguns fragmentos podem ser modificados durante a trituração para ter excertos de outro livro. Alguns fragmentos também podem ser adicionados e podem ser completamente irreconhecíveis.