La ministre de l'enseignement supérieur et de la recherche ne peut que déplorer les violations répétées de la confidentialité censée entourer les échanges entre la Cour des comptes et « Sciences Po » au cours de la procédure de contradiction. Elle rappelle par ailleurs que c'est à la Cour qu'il appartient de donner les suites prévues par le code des juridictions financières aux faits constatés à l'occasion de ces contrôles. Le Premier président de la Cour des comptes s'est exprimé en ce sens le 22 novembre 2012 lors de la présentation du rapport de la haute juridiction, à la presse.