Les résultats au diplôme national du brevet des collèges des élèves fréquentant des établissements de l'Yonne sont inférieurs à ceux de l'ensemble de la France. Alors qu'en 2007, cet écart n'était que d'un point, celui-ci est désormais de presque 7 points. Cet écart s'est donc accru sur les dernières années. Les taux de réussite des élèves fréquentant des établissements scolaires ou préparant le baccalauréat par apprentissage dans l'Yonne quel que soit le type de baccalauréat général, technologique ou professionnel sont légèrement inférieurs sur les dernières années à ceux de la moyenne française. Les écarts sont cependant beaucoup moins importants que pour le DNB et varient selon les années de moins d'un point (2009, 2010) à un peu moins de trois points en 2012. Entre 2004 et 2008, ils ont été supérieurs à ceux de la France entière. Pour les examens professionnels, sur les cinq dernières années dont les résultats sont connus, les résultats au CAP des candidats fréquentant des établissements de l'Yonne sont légèrement inférieurs à ceux de la France entière (-2,8 points en 2011, -1,3 en 2010) ainsi qu'au BEP (-5,3 points en 2011, -2,4 points en 2010).