Afin de réduire l'inadéquation entre le nombre d'internes et les capacités d'accueil en post-internat et permettre ainsi à des internes d'accéder au post-internat pour terminer leur cursus de formation, 200 postes d'assistants spécialistes sont offerts chaque année depuis 2009. Ils sont répartis dans les régions ayant subi la plus forte augmentation de leur nombre d'internes et présentant des difficultés d'accès au post-internat. Ces postes, financés par des crédits d'assurance maladie (missions d'intérêt général et d'aide à la contractualisation - MIGAC), doivent permettre à de jeunes médecins d'approfondir leur formation spécialisée et de contribuer à l'encadrement des internes. En lien avec la conférence des doyens de médecine, le calendrier de répartition de ces postes a peu à peu évolué pour être calqué sur le calendrier de recrutement des chefs de clinique. En 2012, la répartition des postes de chefs de clinique et d'assistants spécialistes a été publiée et notifiée aux directeurs généraux des agences régionales de santé (ARS) début juillet. De plus, ces postes sont dorénavant financés pour deux ans (2012-2013) de façon à donner aux ARS, ainsi qu'aux autorités universitaires et aux internes, une meilleure visibilité pluriannuelle. Sauf réajustement à la marge sollicité par une ARS, cette répartition a vocation à devenir pérenne.