La salmonellose est une zoonose, une maladie ou une infection pouvant se transmettre directement ou indirectement entre les animaux et les humains. Le dépistage des infections Salmonella des troupeaux de poulets de chair et de dindes est obligatoire et indispensable vue l'importance de l'impact sur la santé publique. Les plans de lutte actuels contre les salmonelles résultent de textes européens dont l'application est obligatoire pour tous les États membres, en particulier le règlement CE no 2160/2003 relatif au contrôle des salmonelles et autres agents zoonotiques présents dans la chaîne alimentaire. En effet, il est nécessaire de détecter et d'exclure de la chaîne alimentaire les viandes de volailles potentiellement contaminées par Salmonella Enteritidis ou Salmonella Typhinurium. Il est exact que ce dispositif réglementaire représente un coût pour les éleveurs fermiers, ainsi que des contraintes particulières en cas de dépistage positif. Un seuil d'exemption au dépistage obligatoire, fixé à 250 unités de volailles, s'applique ainsi aux exploitations dont la production est limitée au marché local (sous forme d'autoconsommation, de vente directe au consommateur final ou d'approvisionnement d'un commerce de détail local). Par ailleurs, afin de prendre en compte les problèmes auxquels sont confrontés les élevages de plus de 250 volailles abattant en continu et composés de plusieurs unités d'âges différents, l'arrêté ministériel du 24 avril 2013 actuellement en vigueur introduit une possibilité de dérogation (point VI de l'article 5 de l'arrêté du 24 avril 2013) dite « dérogation en continu » applicable aux élevages constitués d'une surface de bâtiment inférieure à 750 m2. La dérogation en continu permet la limitation du dépistage à un seul prélèvement toutes les huit semaines, ce qui représente une économie considérable par rapport à l'obligation de prélever chaque lot dans les trois semaines précédant l'abattage. Pour les exploitations constituées d'un nombre élevé de petits bâtiments ou enclos, ce type de dérogation permet de réduire le nombre de prélèvements obligatoires à seulement sept au maximum par an, soit sept analyses, au lieu de plusieurs dizaines d'analyses en l'absence de dérogation. En cas d'arrêté préfectoral de mise sous surveillance (APMS) ou d'arrêté préfectoral d'infection (APDI), ceux-ci pourront être levés par anticipation en fonction de l'appréciation des directions départementales de la cohésion sociale et de la protection des populations, qui disposent de la connaissance de terrain indispensable. En particulier, un groupe de bâtiments déjà vidés et désinfectés d'un site sous APMS ou APDI pourra bénéficier d'une levée des mesures de séquestration sous réserve que l'exploitant présente les garanties nécessaires en termes de respect des mesures de biosécurité élémentaires sur l'ensemble du site. Cette adaptation de la réglementation permet aux exploitations bénéficiant d'une dérogation en continu de repeupler une partie de leur site de production avant la levée totale de l'APMS ou APDI et ainsi éviter une interruption prolongée de leur production.