S'agissant des liaisons transversales auto-train, l'entreprise publique a été amenée, depuis 2010, à recentrer son activité auto-train sur les relations et les périodes les plus fréquentées. Cependant, elle a parallèlement engagé un plan d'action pour renforcer l'accessibilité et l'attractivité de son offre : information en ligne sur les heures de chargement et de déchargement du véhicule, création d'un service voiturier, permettant au voyageur de ne pas se déplacer pour déposer ou récupérer son véhicule, etc. La politique tarifaire a également été réorientée : le prix moyen est plus bas et la gamme est élargie, en fonction du jour de son départ et de l'anticipation de son achat, alors qu'auparavant, il était uniquement proposé un tarif en basse saison et un autre en haute saison. L'ensemble de ces mesures a contribué à l'accroissement du trafic auto-train qui a progressé de 14 % entre 2008 et 2011. Attaché au développement du service auto-train, le Gouvernement sera attentif à ce que ce mode de transport écologique réponde au plus près des attentes et des besoins des usagers et qu'il en soit fait une exploitation équilibrée et de qualité par l'entreprise publique.