L'expérimentation du DMP sur clé USB appelle un certain nombre de réserves pour répondre aux besoins des patients et des professionnels de santé en matière de partage d'information et de coordination des soins. La CNIL, consultée en avril 2012 sur le projet de décret donnant un cadre à ce type d'expérimentation, avait émis de fortes réserves sur le choix de ce support mobile en raison de ses limites techniques touchant particulièrement à la protection des données et des risques qu'il présente (de perte ou de vol, notamment), susceptibles de constituer un obstacle à la confiance des patients et des professionnels. L'utilisation d'un support mobile pour transporter et rendre disponible des données personnelles de santé pourrait présenter un intérêt pour des personnes familières des nouvelles technologies de l'information et de la communication, mais ne saurait constituer l'outil privilégié d'un système d'information partagé de santé garantissant une véritable égalité d'accès aux informations médicales. Défavorable à la prolongation des délais permettant la mise en oeuvre de telles expérimentations, la ministre des affaires sociales et de la santé considère, en revanche, qu'il y a un enjeu majeur à favoriser le partage des données de santé entre les professionnels pour une meilleure coordination des soins, tout en donnant la possibilité aux patients d'accéder à ces informations et d'en assurer la maîtrise des accès. C'est pourquoi la ministre s'est engagée à ce que soit rapidement mis en oeuvre un programme permettant d'aboutir à un système d'information intégré et prévoyant notamment qu'un DMP de seconde génération puisse donner un accès hautement sécurisé à l'ensemble des professionnels de santé aux informations concernant leur patient, dès lors que celui-ci en a donné l'accord. Ce DMP2, conçu dans la concertation par et pour les professionnels, devra répondre à leurs besoins ainsi qu'aux attentes des patients. Mis en oeuvre pragmatiquement et progressivement, dans le cadre d'une nouvelle gouvernance, il sera articulé avec les projets en cours (dossier pharmaceutique, dossier de cancérologie communicant, messageries sécurisées santé...) et bénéficiera en priorité, dans un premier temps, aux personnes atteintes de maladies chroniques.