Au cours de l'entretien que leur a accordé le ministre du redressement productif, le 2 juillet 2012, les dirigeants du groupe Sanofi l'ont informé de leur projet de réorganisation de la partie française du groupe et, en particulier, de ses activités de recherche, de vaccins et de ses fonctions support. Bien que les dirigeants du groupe aient exclu tout recours à des procédures de licenciement, ce plan est susceptible de conduire à un nombre important de départs indemnisés de salariés. Le ministre a exprimé clairement sa vive désapprobation de ce plan, ce qui a conduit le groupe Sanofi à modifier très largement ses intentions initiales : dans la version présentée aux salariés au mois de septembre 2012, les pertes d'emplois seraient de l'ordre de 900 alors que les premières estimations relatives aux intentions initiales du groupe Sanofi faisaient état de plus de 2 000 suppressions d'emplois. De plus, le groupe travaille aujourd'hui sur des hypothèses de maintien de l'activité sur les sites de Toulouse et de Montpellier. L'annulation mi mars en appel du plan de réorganisation de la recherche a démontré que ce plan devait être amélioré et présenté en aval aux syndicats pour une discussion fructueuse sur l'avenir de la recherche du groupe Sanofi en France. Le ministre a missioné M. Saintouil sur le site de Toulouse pour étudier toutes les pistes avec la direction de Sanofi et l'ensemble des salariés.