Les effectifs des élèves sont connus de manière fiable depuis 2002/2003, année de la mise en place du système d'information MAGE à l'Agence pour l'enseignement français à l'étranger. Entre l'année 2002/2003 et l'année 2014/2015, le nombre d'élèves français aux Philippines bénéficiaires d'une bourse scolaire AEFE est passé de 38 (pour un montant de 164 933 euros) à 67 (pour 504 151 euros). Il était de 44 en 2003/2004, 41 en 2004/2005, 39 en 2005/2006, 42 en 2006/2007, 52 en 2007/2008, 46 en 2008/2009, 48 en 2009/2010, 53 en 2010/2011, 68 en 2011/2012, 67 en 2012/2013 et 58 en 2013/2014. Cette évolution est à mettre en regard du nombre d'enfants français scolarisés - passé de 148 à 209 sur la même période - au lycée français de Manille. Le pourcentage d'élèves français ayant disposé d'une bourse aux Philippines est passé de 25,6 % en 2002/2003 à 32 % en 2014/2015, avec l'évolution suivante : 26,2 % en 2003/2004, 28 % en 2004/2005, 24,7 % en 2005/2006, 28,4 % en 2006/2007, 35,6 % en 2007/2008, 25,4 % en 2008/2009, 26 % en 2009/2010, 28,8 % en 2010/2011, 30,6 % en 2011/2012, 31 % en 2012/2013 et 29,3 % en 2013/2014. Le pourcentage d'élèves français boursiers aux Philippines est au-dessus du pourcentage enregistré en moyenne mondiale (21 %).