La commission nationale de présélection des pôles d’excellence rurale a été créée par le décret no 2006-429 du 12 avril 2006 relatif aux pôles d’excellence rurale. Son unique objet est de donner son avis pour la sélection des pôles d’excellence rurale (PER). Elle est donc appelée à se réunir uniquement lors de chaque sélection des PER. Ainsi, depuis 2011, date de la deuxième et dernière génération de PER, elle ne s’est plus réunie. Elle ne dispose pas de budget spécifique et n’a aucun coût. En conséquence, la commission nationale de présélection des pôles d’excellence rurale est au nombre des instances consultatives dont la suppression est prévue en application des conclusions du comité interministériel pour la modernisation de l’action publique du 18 décembre 2012.