Les décisions prises par le préfet ou, par délégation, par le directeur départemental des territoires ou ses collaborateurs, peuvent faire l'objet d'un recours hiérarchique, sauf si une procédure particulière de recours administratif est organisée par un texte. Le ministre auprès duquel le recours hiérarchique est formulé est celui compétent pour le domaine dans lequel la décision contestée est prise, et donc pour toutes les questions agricoles, le ministre de l'agriculture, de l'agroalimentaire et de la forêt. En tout état de cause, en application de l'article 20 de la loi du 12 avril 2000 relative aux droits des citoyens dans leurs relations avec l'administration, si un ministère est saisi à tort de ce type de recours, il doit le transmettre au ministère compétent.