L'AEFE met en oeuvre ses missions telles qu'elles figurent dans la loi (article L. 452-2 du code de l'éducation) : « l'agence a pour objet en tenant compte des capacités d'accueil des établissements : d'assurer, en faveur des enfants français établis hors de France, les missions de service public relatives à l'éducation ; (. . ) de contribuer, notamment par l'accueil d'élèves étrangers, au rayonnement de la langue et de la culture françaises ». Cet équilibre entre les deux missions se traduit dans les faits : les 488 établissements du réseau scolarisent en moyenne mondiale 1/3 d'élèves français et 2/3 d'élèves étrangers (locaux ou tiers). Cet équilibre est très variable selon les établissements et les pays. L'enseignement français permet à de nombreux élèves étrangers d'acquérir la maîtrise de la langue et de la culture françaises, et la présence de ces mêmes élèves étrangers apporte aux élèves français une plus grande ouverture culturelle et l'apprentissage de la différence. Suite à la concertation sur l'avenir de l'enseignement français à l'étranger confiée à la ministre déléguée chargée des Français de l'étranger par le ministre des affaires étrangères, la stratégie d'ensemble sera examinée lors d'une rencontre interministérielle présidée par le ministre. Elle prendra en compte le nécessaire équilibre entre les deux missions.