La ligne d'équilibre du territoire Bordeaux-Lyon présente deux variantes de parcours dans la partie centrale entre Périgueux et Saint-Germain-des-Fossés : un itinéraire nord passant par Limoges et Montluçon avec un aller retour quotidien, un itinéraire sud via Brive et Clermont-Ferrand, exploité lors des pointes hebdomadaires et saisonnières en deux tronçons en correspondance à Clermont-Ferrand, Clermont-Ferrand-Lyon étant une desserte mixte TET - TER Rhône-Alpes. Ces deux itinéraires intègrent un arrêt à Roanne. Cependant, en 2013, la desserte par l'itinéraire nord a été affectée par la réalisation des travaux liés au plan rail Auvergne et par ceux de rénovation de la portion concernée de l'axe Paris-Limoges-Toulouse, empruntée par les trains Bordeaux-Lyon. Ces travaux ont entraîné la limitation de la desserte ferroviaire par l'itinéraire nord à la section Bordeaux-Limoges, tronçon le plus fréquenté de la desserte. L'État est conscient des désagréments occasionnés par les conséquences des travaux opérés mais insiste sur leur importance pour assurer sur le long terme la pérennité d'une desserte ferroviaire de qualité sur les différentes portions du réseau. Des substitutions routières entre Limoges et Montluçon et entre Vichy et Montluçon ont été instaurées. Les travaux sur la ligne Paris-Limoges-Toulouse se poursuivent durant l'année 2014 et pourraient se prolonger jusqu'en 2016 selon les données actuelles. Durant cette période de travaux, l'itinéraire nord via Limoges continuera à être limité à la section Bordeaux-Limoges. Afin d'assurer l'offre de transport, la SNCF a poursuivi la substitution routière. Celle-ci a été cependant modifiée puisqu'il s'agit, depuis le début du service 2014, d'une circulation entre Limoges et Roanne via Montluçon. Pendant cette période de travaux sur l'itinéraire nord, la gare de Roanne reste desservie par la desserte Clermont-Ferrand-Lyon de la ligne Bordeaux-Lyon par l'itinéraire sud.