La laïcité est un principe qui fonde la mission éducative du ministère des sports, de la jeunesse, de l'éducation populaire et de la vie associative et organise son intervention. Le ministère conditionne son soutien technique et financier auprès du mouvement associatif au respect de la laïcité. Les agréments « sports » et « jeunesse/éducation populaire » constituent une marque de reconnaissance pour les acteurs associatifs qui respectent et font vivre les principes républicains dans leurs actions. Une des conditions de l'habilitation des organismes de formation conduisant aux brevets d'aptitude aux fonctions d'animateur (BAFA) et de directeur (BAFD) d'accueils collectifs de mineurs, délivrée par la ministre, porte ainsi sur l'ouverture des sessions de formation à tous les publics sans discrimination. Le cahier des charges, annexé aux textes réglementant ces brevets, élaboré par les services du ministère en concertation avec les organismes de formation, réaffirme le nécessaire fondement des projets éducatifs de ces organismes sur les principes républicains. La lutte contre le racisme et l'antisémitisme, pour l'égalité femmes-hommes, pour la liberté d'orientation sexuelle sont autant de domaines dans lesquels le ministère des sports, de la jeunesse, de l'éducation populaire et de la vie associative s'implique notamment par ses contributions au sein des comités interministériels (jeunesse, lutte contre le racisme et l'antisémitisme...), pour défendre et promouvoir les valeurs républicaines portées également par les mouvements d'éducation populaire.