Le contrôle de la sécurité des installations nucléaires repose sur une répartition claire des rôles et des responsabilités de l'État et des exploitants nucléaires. Ainsi, le rôle de l'État est de définir les menaces de référence auxquelles les installations peuvent faire face, via des directives nationales de sécurité qui sont des documents classifiés, et de les notifier aux exploitants. Les exploitants sont ensuite tenus de démontrer, dans des études de sécurité remises aux services du ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie, comment ils s'organisent pour assurer y résister. Pour des raisons évidentes de sécurité, il n'est pas possible de rendre public le contenu des directives nationales de sécurité, et en particulier celle s'appliquant au secteur nucléaire. Il a cependant été indiqué, notamment lors de l'audition publique organisée par l'Office parlementaire d'évaluation des choix scientifiques et technologiques, que la menace présentée par les drones était couverte par les menaces de référence auxquelles doivent faire face les installations, notamment dans le cas d'une chute d'aéronefs. Préserver un haut niveau de sécurité pour les installations nucléaires mobilise de nombreux acteurs, dont l'État : renseignement, couverture aérienne et maritime, moyens d'intervention anti-terroriste, etc. Le traitement de la menace aérienne vis-à-vis des installations nucléaires relève de cette logique et s'inscrit, en particulier mais pas seulement, dans le cadre plus vaste de la protection de l'espace aérien national. S'inspirant des recommandations du Livre blanc de la défense nationale, le Gouvernement a installé fin 2013 un comité de filière des industries de sécurité (CoFIS). Le ministère de l'écologie, du développement durable et de l'énergie apporte un soutien actif à ce projet pour plusieurs secteurs d'activité entrant dans son champ de compétences. Les services du ministère participent, notamment, au groupe chargé d'expliciter les besoins prioritaires en recherche et développement dans les domaines de la sécurité, et notamment la sécurité des installations d'importance vitale. La production de ce groupe de travail est intégrée dans les outils programmatiques nationaux de recherche et développement, par exemple : les appels à projets de l'Agence nationale de la recherche (ANR). L'appel à projets flash lancé par l'ANR le 18 décembre 2014 sur la protection vis-à-vis du survol des drones civils est le résultat direct de ce travail interministériel.