Dans le cadre de la participation du bâtiment d'essais et de mesures Monge à « l'Armada », rassemblement de navires qui s'est déroulé à Rouen du 6 au 16 juin 2013, un strict dispositif de sécurité a été mis en place par la marine nationale. Les personnes admises à bord ont ainsi dû préalablement franchir un portique équipé d'un détecteur de métal et faire vérifier, le cas échéant, le contenu de leur sac. Par ailleurs, le circuit de la visite a été soigneusement balisé et limité à un espace restreint (pont des aériens, passerelle, central opération vidé de sa documentation et toutes consoles éteintes, carré du commandant). En outre, des marins ont été postés sur l'ensemble du parcours et dans chaque local accueillant du public. Les lieux sensibles ont pour leur part été protégés au moyen d'un système de verrouillage électronique des voies d'accès dont la désactivation nécessitait l'emploi d'un passe spécifique. De plus, des rondes ont été effectuées par l'équipage avant et après chaque ouverture du bâtiment à la visite afin de vérifier la bonne application des mesures de sécurité et de s'assurer de l'absence de toute anomalie. Enfin, des consignes adaptées au contexte particulier de cette manifestation culturelle d'envergure ont été transmises à la totalité des marins du Monge préalablement à leur arrivée à Rouen et rappelées, chaque jour, aux membres des équipes chargées de surveiller le navire et d'accueillir le public.