日本語メタデータの階層構造とID付けのルールMetabolonoteでは、メタボロミクスのメタデータを主に4つの階層構造に分けて管理しており、その階層構造に従ってメタデータのID付けをしています。メタデータは、「SE1:/S01/M01/D01」という名前のWikiページに記載されており、下記のURLでアクセスできます。階層構造Metabolonoteでは、実験データセットのメタデータを下記のような階層構造で管理しています。これは、私たちが定めた統合メタボロームデータフォーマット(TogoMD)に従っています。(化合物アノテーションの詳細情報)※各情報において記述すべき項目もTogoDMに従っています。一つのサンプルセットには複数のサンプルが、一つのサンプルには複数の分析情報が、また一つの分析データには複数のデータ解析情報が含まれることが想定されます。研究の目的に応じた実験データのまとまりについての情報。どのサンプルをどのコントロールと比較するべきか等、データの解釈・取り扱いに関する情報を含む。データ解析の結果取得された化合物ピークに関する情報。(ピーク情報を保持するデータベース用に定義した区分であり、Metabolonoteでは使われていません。複数のサンプルに共通に適用した調整方法の詳細情報。生体サンプルなら、どのような成育をさせたか、どんな薬剤処理をしたか、どの部位をサンプリングしたか、などを含む。S(サンプル情報)で参照されます。複数の分析実験に共通に適用した分析手法の詳細情報。どのような装置をどのような設定で用いたか、などを含む。M(分析情報)で参照されます。複数のデータ解析に共通して適用したデータ解析手法の詳細情報。どのようなソフトウェアをどのようなパラメーターで解析したかなどを含む。D(データ解析情報)で参照されます。どのような基準でピークのアノテーションをつけたかという情報。P(ピーク情報)で参照されます。ID付けのルール各階層のIDラベル(上の表を参照)の後に数字をつけ、それを階層構造に従って、アンダーバーで連結したものが、各メタデータのIDになります。サンプルS01を分析した情報。分析で得られた生データ情報は、このメタデータにひもづく。M01で得られた分析データを解析した情報。分析ピークを集積するデータベースでは、各ピーク情報がこのメタデータにひもづく。数字部分の付け方SEについてはシステム管理者がデータ公開時に発行します(データ構築時には、代わりに任意の仮IDが使用されます)。それ以外の区分については、同じ階層で重複しなければ、ユーザーが任意につけることが可能です。数字は、ゼロフィルをしても構いませんが、例えばM01とM1は別のものとして区別されます。MetabolonoteでのID表記ページタイトルMetabolonoteでは、MediaWikiページの構成上、ページタイトルが以下のように表記されます。例)SE1:/S01/M01/D01URLを以下のように記述することで、対応するページへのリンクを作ることができます。http://metabolonote.kazusa.or.jp/SE1:/S01/M01/D01APIでのID指定APIを用いてメタデータ情報を取得する場合は、アンダーバーで連結されたIDを用いて以下のように記載します。http://metabolonote.kazusa.or.jp/mnapi.php?action=getDataByMetadataID&id=SE1_S01_M01&output=xmlhttp://metabolonote.kazusa.or.jp/mnapi.php?action=getDataByMetadataID&id=SE1_S01_M01_D01&output=txtAPIについての詳細はこちらをご覧ください。MetabolonoteDisclaimers。