RNAよりRNA-Seq用ライブラリを作製し、網羅的なシーケンスを行うことで、試料中に存在する微生物の種類や機能遺伝子の発現状況を明らかにします。RNAの除去し、効率的な解析が行えます。12Gb単位の2パターンを標準プランとしていますが、1Gb単位で任意変更可能です。ご希望がございましたら事前にお問い合わせください。Controlを行い、有効データに変換します。ReconstructionNCBIの配列情報を利用してrRNAやtRNAなどの非目的RNAを除去し、残ったリードをTrinityソフトウェアを使用してアセンブルします。その後、CD-HIT-ESTソフトウェアを使用して冗長性(重複した配列や類似した配列)を削除することで、一意の遺伝子セット(unigene)を取得します。Annotationunigeneをバクテリア、真菌、古細菌、ウイルスの配列に比較し、フィルタリングによって生物学的に意義のあるアライメント結果を取得します。遺伝子の豊度情報と組み合わせ、サンプルの各分類レベルごとの情報を視覚化します。CAZy)unigeneがどのような機能を持つかを推定します。既存のデータベース(GO、KEGG、eggNOG、CAZy)内の配列との類似性を評価します。AnalysisTrinityによって構築したトランスクリプトームをリファレンスにリードのマッピングを行い、遺伝子の発現量を算出します。行い、発現変動遺伝子を抽出します。KEGG)発現変動遺伝子群に対し、既存のデータベース(GO、KEGG)内の遺伝子との関連性を評価します。