世界中を混乱に陥れた「災いの樹」事件から数年後――。――世界は再びの平穏を取り戻していた。「シャドウバース」は更に人々に親しまれるようになっており、プロプレイヤーを育成する施設「シャドウバース・バトル・カレッジ」、通称シャドバカレッジが設立されていた。中学2年生の天竜ライトは、ひょんなことからシャドバカレッジの創設者ウルフラム・ゼルガに導かれ、シャドバカレッジに転校することになる。スバルからの勧めで「シャドバ部」に所属することを決める。この「シャドバ部」とは、シャドウバースに真剣に取り組む生徒たちで構成された部活動であり、シャドバカレッジには7つのシャドバ部が存在していた。部を存続させるべく、ライトはセブンスフレイム部長の蜜田川イツキと、真壁スバルとともに、新たな部員を探すことを決意する。そんなライトたちを見つめる、怪しい影が一つ。それはシャドバ部「ファーストリーパー」部長、波瀬浦ハルマだった――。光り輝くスポットライト。笑顔輝くダンスに魅惑のチャームボイス。のどかなパーレル村に集った少女たち。今日食べるおやつのケーキ一つで大騒ぎ。賑やかな日々のものがたり。普通の学校生活を送り、普通のクラスに属し、普通に恋をし、意を決して告白する......そんな至極まっとうな青春を謳歌していた篠崎遥。恋をした相手だけが『普通』ではなかった――。