■実験の背景・目的ゲノムの働き方を包括的に理解するためには、ゲノムDNAのどこに転写因子やヒストンなどのタンパク質が結合しているかを網羅的に明らかにする必要がある。これまで用いられてきたゲノムフットプリンティングというアプローチでは、細胞から単離した核に対してDNA分解酵素を働かせる方法などが用いられてきた。それらの方法は操作が難しく、核を単離する過程でタンパク質とDNAの相互作用が変化あるいは消失する危険性があった。そこで、我々は細胞膜透過性のDNAメチル化試薬であるジメチル硫酸(DMS)に着目し、新規のインビボフットプリント法であるDMS-Seq法の開発に取り組んでいる。Kitを用いたライブラリー化を行った。S288C(R64-1-1)にマッピングワークフローの詳細は下記文献を参照ください。Kitを用いることで従来よりも短い断片を含むライブラリーが調製できた。Kitを用いることで、従来観察されなかったシャープなピークが周期的に表れる領域を見出すことができた。Kitを用いることで、従来見過ごしていた小さなフラグメントのシーケンスを得ることができるようになり、これまでよりも網羅性の高い解析を行うことが可能となった。Kitを使ったことがない方へのコメント簡便な操作でライブラリーを作製することができ、チューブも色分けされていてわかりやすい構成になっているため、ライブラリー作製に慣れていない方にもお勧めします。