概要cfDNAを材料とし、ThruPLEX技術によりライブラリーを作製した後にキャプチャー濃縮技術により消化器がん関連遺伝子の変異を超高感度で検出します。任意の遺伝子について新規構築も可能で、遺伝子を絞り込むことにより多検体を低コストで検出可能です。前田大地特任教授(常勤)らのグループとの共同研究の成果を活用して実施します。■チラシをご覧ください。Assayサービス内容cfDNAまたはゲノムDNAをお預かりし、ThruPLEX技術を用いてライブラリー作製を行い、キャプチャー濃縮技術により標的領域の遺伝子を濃縮します。イルミナ社シーケンサーNovaSeqにより次世代シーケンスを行い、消化器がん関連遺伝子の変異を検出します。オプションにて血漿、組織等からのDNA抽出作業も可能です。解析結果は、変異候補を一覧にまとめたファイルをエクセル形式、テキスト形式で納品いたします。分子バーコードが含まれるStem-Loop構造のアダプターを使用することで、アダプター同士のライゲーションが抑えられ、より多くのcfDNAに分子バーコードを付加することができ、高感度、高精度な変異検出が可能になります。ターゲット濃縮キャプチャー濃縮技術により、標的とする28のターゲット遺伝子を濃縮します。※COSMIC、CIViCなど公共データベースに登録された消化器がんで代表的な遺伝子を対象としています。価格・納期ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。・依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。※WEB会員にログインした状態で依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。(Excel)※弊社「個人情報としてのゲノムデータの取り扱い」の詳細はこちらをご参照ください。臨床検体又は供与細胞に関する情報提供用紙(Excel)※臨床検体・細胞を送付いただく場合は、受託サービスをお申込みいただく前に、「臨床検体又は供与細胞に関する情報提供用紙」にご記入の上、弊社へお送りください。弊社にてご提供いただいた情報を元にお取り扱いの可否を判断して折り返しご連絡いたします。「臨床検体のお取り扱いについて」の詳細はこちらをご参照ください。・解析サンプルならびに依頼書を下記サンプル送付先へご送付ください。・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。・送付サンプルがDNAの場合には-20°Cの状態の冷凍便でお送りください。受入サンプルDNA、血液、組織など以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。pH8.0に溶解してください。濃度測定は蛍光定量(Qubit等)を推奨します。上記基準に満たない場合は別途お問合せ下さい。冷凍(-80°C)EDTA/2K採血管にて採血してください。※EDTA/2Na等、他の凝固剤はご使用にならないでください。ml遠心管にて-80°Cで保管してください。血漿の分離は下記条件で実施してください。※採血後2時間以内に血漿の分離を実施してください。採血後、時間の経過とともに血球由来のゲノムDNAの量が増加し、解析結果に大きく影響を及ぼします。採血から血漿の分離までの時間は厳密に管理してください。※中間層にあるバフィーコートを吸わないように細心の注意を払って操作してください。バフィーコートの混入は解析結果に大きな影響を及ぼします。※可能な場合は、上記1回目の遠心分離後に下記条件にて2回目の遠心分離をお勧めいたします。ml以上ご提供いただいた場合でも、充分なcfDNAを得られない可能性がございますのでご注意ください。mm角片に刻んでください。mg以下となるようにしてください。採取後速やかに耐凍チューブなどに入れ、-80°Cにて保存してください。正常部位や壊死部分を除去したサンプルにてご依頼ください。上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。供与核酸の品質によっては再提供をお願いすることがあります。ヒト試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。詳しくは、「ヒト試料・情報の取り扱いについて」をお読みください。お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。