執筆には、編集委員会が提供する原稿雛形を用いることが望ましい。付録はオンラインで電子ファイルとしてのみ公開する。学術情報の原稿は、原著論文と総説論文の原稿の構成から英語の要旨と英語のキーワードを省略する。基本的に和名(カタカナ)を用い、本文の初出で学名(イタリック表記)と命名者名を記す。命名者名は、動物の学名の場合と多数の学名を列挙する場合は省略することができる。単位は、MKS単位系を用いる。引用は半角括弧で閉じる。まとめて引用する文献は、セミコロンで区切り、出版年の古い順とする。著者と出版年が同じ文献は、出版年の後にアルファベットを付して区別する。著者が3名以上で第一著者と出版年が同じ文献についても同様に区別する。保全生態学研究の原稿チェックリスト付録「引用文献の記載例」を参考にする。ウェブサイトは、引用に適した文献がない場合に引用できる。発行者と発行年が判明しており、PDFファイルのように原則として逐次更新されていないウェブサイトは、文献の引用と同様に引用する。発行年が不明の場合や逐次更新されている場合は、本文中にURLと最終確認年月日を記述する。発行者が不明の場合は、原則として引用を避ける。2004年2月23日、環境保全の基本的施策に関する件)。ボランティアがハチ退治」2004年5月14日)。