関連のインフォマティクス情報についてまとめています。AugustusannotationAugustusはblast2goでも使われているeukaryotesのアノテーションツール。既存の他の手法と比較しても精度が高い手法と述べられている(検証リンク)。高速なwebサーバー版と、RNA-seqのbamファイルを指定してexon-intron情報を与え、予測精度を上げるlocal版がある。このbamによる支援機能はblast2goにも取り込まれている。local版はbinaryのみ提供されている。unixマシンやunixサーバーを用意する必要がある。(README.TXT)http://bioinf.uni-greifswald.de/augustus/binaries/README.TXT近縁なゲノムであれば使えるらしい。哺乳類であればヒトのトレーニングデータを使えると書かれている。bamはtophatなどで作る。Labはてなブログをはじめよう!kazumaxneoさんは、はてなブログを使っています。ブログを報告する引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。