JAPANが第二次戦国時代に突入。新しい戦国大名が生まれ各地で戦が繰り広げられたが、最終的には平氏と源氏と2大勢力になり、互いに相手を征服したり復興したりを繰り返した。ルーカ・ルーン(M・M・ルーン)、魔法バイオメタル(メタルマミー)を生み出す。ルーカ・ルーン、24人の魔法使いたちと魔教団を結成。魔教団、当時最強の軍事国家バルシン王国に宣戦布告(鉄兵戦争)。3日で圧勝し、バルシン王国の跡地に魔都デトナ・ルーカを建設。JAPANが魔教団により征服される。聖魔戦争(魔人戦争)勃発。蛮人たち(魔法を使えない人)、魔物たちと戦うことに耐えられなくなり、聖魔教団に反旗をひるがえす。このことを知ったM・M・ルーンは発狂。残存している闘神都市に蛮人抹殺命令を出す。闘神都市Υ、とある王国を壊滅させる。その際死亡したミスリー姫をその兄が闘将レプリカ・ミスリーへと作り替える。魔人レキシントン、闘神落としをするため闘神都市Υに来襲。闘将たちとの戦闘中に現れた魔人ノスに倒されてしまう。フリークとハンティ、魔法を無効化する体を持つレプリカ・ミスリーの協力を得て、M・M・ルーンを倒すことに成功する。ガイは魔人たちに撤退命令を出す。聖魔教団が力を失ったため、JAPANの各地に多数の戦国大名が生まれ、第3次戦国時代となる。AL教団が聖魔教団の技術を禁止する。足利尊氏がJAPANを統一し、三種の神器により帝の力も手に入れ、JAPANに安定政権が出来る。JAPANにて参勤交代がスタート。大陸から切り離された衝撃によりJAPAN各地に生まれてしまった、地獄に通じる穴をふさぐ事業が北条家によって始められる。魔人ザビエルが2度目の復活を果たす。4人の使徒と共に天志教を壊滅寸前まで追い込む。魔人ザビエルの使徒、玄武が武家の娘、和華に一目惚れ。異空間を作りだし和華をそこに住まわせさんざん尽くしたが、和華は玄武には全くなびかなかった。聖刀日光を携えた勇者が現れ天志教と共にザビエルと戦う。勇者は戦闘中に勇者の期限が切れて死んでしまったが、天志教がなんとかザビエルを封印することに成功する。ザビエルは八分割されて特殊な瓢箪に封じ込まれ、足利家の重臣となる戦国大名に預けられる。ザナゲス・ヘルマン、各国の王に領土を賭けた一騎打ちを次々と挑み、62連勝して61の地域を制圧し、ヘルマン共和国を建国する。ザナゲス・ヘルマン、無理な連戦により体を壊し死亡する。ヘルマン共和国で反乱発生。反乱軍のリーダー、グロス・リーザスがリーザス王国を建国する。ヘルマン共和国がリーザス王国に侵攻。ヘルマンが圧勝するものの征服には至らず。ヘルマンがリーザスに再び侵攻。10年に1度のお祭り戦争が始まる。ヘルマンが遊び半分でリーザスを蹂躙。甘く見たヘルマンがリーザスの奇策により撃退される。ヘルマンが再びリーザスに攻め込むが撃退され、和平条約を結ぶ。足利家によりオロチの起こす地震の影響を抑えるために巫女機関が設立される。JAPANで大暴れする。なっていた(と思われる)魔人バボラ蘇る。南部の小国のダラス国探索隊が闘神都市Υを探検するが、魔物によって帰る手段を無くしてしまい、以後カサドの街を作りそこに住み着くことになる。それぞれの勢力にリーザス、ヘルマン、魔人が後押しする。パセリ一派が3勢力を追い出し、ゼス王国が建国される。ゼス王国、モエモエ王国を併合する。ケイブリスダーク発生。ケイブリスが3ヶ月にわたりゼス王国を荒らし回る。第1次メディウサダーク発生。メディウサが1年にわたりゼス王国を荒らし回る。ゼス王国では今後の魔軍への対策として、マーゼルラインの建築計画が立てられる。ヘルマン共和国、中央大地を横断してゼス王国に侵攻。ゼス王国は禁断の魔法を使い、中央大地を砂漠化、ヘルマン共和国の侵入を防いだ。ゼス王国、マーゼルラインを完成させる。第2次メディウサダーク発生。ゼス王国、マーゼルラインにより魔軍の侵攻を防ぐ。ガイと人間の間にホーネットが生まれる。ホーネットが魔人となる。