細胞の変化や多様性を調べたい。RNA-seq解析です。今回は全長RNAのシーケンシング・解析についてご紹介します。一般的な、UMIを用いた方法では、RNAの3'または5'末端側に限定してシーケンスすることで、PCRバイアスに影響されずに細胞ごとの遺伝子発現量を調べることができます。DNA自体に着目した解析が注目されています。(実際には逆転写してcDNAになりますが)のシーケンシング・解析です。シーケンスについてSmart-seqなどによりシングルセルのライブラリを作成し、シーケンスします。実際に、シングルセルRNA-Seqでアイソフォームの解析を行いアイソフォームの発現パターンが異なる細胞群があったという報告も見られます。molecule方式のロングリードに分けられます。バーコーディングにより、ショートリードでもアイソフォームの分類が可能です。moleculeの場合、シーケンスエラーの問題がありますが、アイソフォームの全長を読むことができます。筆者は違うけど、勝手に以前のブログ↓の続編を書きました。用いたユニークなシーケンス手法でした。staffblog.amelieff.jpいろいろ書き並べましたが私は、素直に現代のシーケンス関連技術に感心しました。細胞1こ1こに分けた上に、RNAを1本も捨てないかのような精密さ。RNA-seqでできる解析が、どんどんシングルセルRNA-seqでできるようになっているなと思います。5はてなブログをはじめよう!amelieffさんは、はてなブログを使っています。ブログを報告する引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。