GRh38ヒトゲノムとHIV[統合線形pNL4-3Env-GFP]参照をFASTA形式でマージします。使用してインデックスを付けます。パラメータを使用します。ソートし、インデックスを付けます。実行して、順序付きライブラリーの後アライメント品質チェックを行います。使用して、前のステップから品質測定を収集および要約します。HIVゲノムは5’LTRおよび3’LTRに相同634bp配列を有する:SAMtoolsを用いて5’LTRから対応する3’LTR領域への再整列マルチマッピング読み取り。2.1.2)を実行します。ピークコールが遺伝子発現レベルの影響を受ける可能性があり、短いエキソンがピークと誤って呼ばれる可能性があるため、RNA-Seqデータ上で正しく機能するために、MACS2実行パラメータを慎重に選択します。したがって、入力信号は、MACS2によって日常的にDNAベースのデータに適用される平滑化を行わずに、m6A信号から差し引かれなければならない。サブコマンドに次のパラメータを適用します。呼び出す差分ピークを実行します。ファイルを入力として取ります。