Carlo;MCMC)法がよく用いられる。これは基本的な乱択アルゴリズムの一種で、最も単純なモンテカルロ法は、パラメータの候補として乱数を発生し、その乱数に対応する確率(積分)を計算するものだが、このような総当たり的な手法では、パラメータの数が増えると爆発的に計算量が増え効率的でないのに対して、完全にランダムではなく、ひとつ前の乱数を元に少しずつ確率の大きな値を探索(マルコフ確率場の探索)しつつ次の乱数次の乱数を発生するアルゴリズムとなる。Carlo;MCMC)法を参照のこと。このMCMCを計算するためのフレームワークとして著名なものにSTANがある。STANはアンドリュー・ゲルマンらによってC++で開発され2012年に初版が提供されたものとなる。このStanに関してはR言語との統合であるRStan、Pythonとの統合であるPyStan、コマンドライン実行可能ファイルであるCmdStan、Clojureとの統合であるclj-stan等のさまざまな言語でのインターフェースを持つ。以前、Rstanについては紹介したが、PythonでのMCMCの実装としてはPystan、PyMC3がある。Rstanは2020年から更新されておらず、StanチームもCmdStanを奨励しているらしいことから、今回はCmdStanのrのラッパーであるCmdStanrと同様にCmdStanのシンプルなラッパーであるclj-stanについて述べてみたいと思う。Rを使ったCmdStanの実行まずCmdStanrについて。Rのツールを起動させてCmdStanrをインストールする。getOption("repos")))さらにその他の必要ライブラリをインストールする。TRUE)>library(posterior)>library(bayesplot)>color_scheme_set("brightblue")CmdStanをインストールする。>install_cmdstan(cores=2)ダウンロードが完了したら、パスとバージョンを確認してみる。>cmdstan_path()>cmdstan_version()両方とも無事に出て来ればインストールは完了となる。次に、Stanライブラリに入っているサンプルモデルを使ってみる。cmdstan_model(file)内容は$print()メソッドで確認できる。bernoulli(theta);}上記のモデルでのdata、parametert、modelに関しては、RでのSTANを使ったベイズ推定を参照のこと。MCMCを動作させてみる。iters)モデルもシンプルで、データ点数も少ないため、即座に計算は終了する。seconds.結果をサマライズするには、posteriorパッケージのsummarise_draws()を呼び出したsummary()メソッドを使う。これは最初の引数で要約する変数を指定し、それ以降の引数はposterior::summarise_draws()に渡され、どの要約を計算するか、マルチコアを使うか、などを指定することができる。前述したClojisrを利用する。環境設定までは”ClojureとRの連携による統計的学習”を参照のこと。project.cljファイルは以下の通り。["-Dclojure.tools.logging.factory=clojure.tools.logging.impl/jul-factory"])src/core.cljファイルは以下のようになる。‘[cmdstanr])となる以外は全てr関数でRのコードをそのまま評価することで、同じ動作を行えることが確認できる。以前述べた”ClojureとPythonの連携と機械学習”で既存のpythonライブラリをClojure上で利用することもできるので、これらを使ってR⇄Clojure⇄Pythonの豊富なライブラリ処理をClojure上で組み合わせて全て利用することが可能となる。ベイズ推論の応用モデルとしてのロジスティック回帰このコンテンツはパスワードで保護されています。閲覧するには以下にパスワードを入力してください。Programming)“でも述べている確率的プログラミングは、確率モデルを記述するための高水準のプログラミング言語を使用してモデルを定義し、モデルの事後分布を推定する手法となる。”マルコフ連鎖モンテカルロ(MCMC)モデルのStanを使ったRとClojureによる解析“にも述べているStanやPyroなどのライブラリが確率的プログラミングのために利用される。コメントをキャンセルメールアドレスが公開されることはありません。※サイト次回のコメントで使用するためブラウザーに自分の名前、メールアドレス、サイトを保存する。作成者hummingbirdAI/IT技術全般およびそれらを使ったビジネス立案に関してアドバイスいたします。作成者hummingbirdAI/IT技術全般およびそれらを使ったビジネス立案に関してアドバイスいたします。お困りごとがあればご連絡くださいhummingbirdをフォローするモバイルバージョンに移動タイトルとURLをコピーしました。