分子機能シミュレーション研究チーム細胞内分子混雑と液液相分離(理研・杉田)細胞質は多くの生体分子で混み合った環境であり、この環境における蛋白質の構造・ダイナミクス・機能の関係を調べる。蛋白質と基質の相互作用がターゲット以外の蛋白質が存在する場合にどのように変化するか、また、ATPなどの基質が存在することで凝集を防ぐ分子機構を解明する。蛋白質と核酸が含まれる液液相分離の問題に取り組む第一歩として、粗視化分子を用いた三次元構造モデルを構築し、CafeMolを用いた粗視化分子動力学によって構造と安定性を調べる。連携研究者である東工大・北尾と協力して細菌べん毛のモデリングを行う。