(1)根本尊崇(こんぽんそんすう)とは、本門の本尊を修行の根本とし所依とし、最も尊崇するという意義である。仏法僧の三宝を尊崇するけれども、そのなかで根本に尊崇するのである。(2)本来尊重(ほんらいそんちよう)とは、本門の本尊が無始久遠(永遠なる過去)から、法爾として最も尊重しなければならぬ存在としてあるという意義である。(3)本有尊形(ほんぬそんぎよう)とは、本門の大曼荼羅本尊の全体が久遠の尊形であり、常住の尊相であるという意義である。これらの必要欠くべからざる意義を全部そなえているのは、本門の本尊を措いてはないことが強調されている。