プログラムは、既成の分野では包括できない広範囲なカリキュラム、スポーツ医科学に関する諸科学を基盤として、スポーツ選手の健康管理やコンディショニング、スポーツ傷害の予防・治療・リハビリテーション、さらに老化や生活習慣病等の予防と運動療法に関し、自立して研究活動を行うために必要な高度の研究能力およびその基盤となる豊かな学識を養う。標準は3年であるが、特に優れた学生の場合には、1年を限度として3年未満でも学位が授与される。プログラムには3つの研究分野(メディカルコンディショニング研究分野、アスレティックトレーニング研究分野、スポーツトランスレーショナル研究分野)があり、学生はこの中からいずれか一つの研究分野を選択する。履修方法3年次終了までに5単位以上を履修すること。I(1単位)の計3単位を必修とする。2.選択科目より2科目以上履修する(2単位以上)。スポーツ医学概論Iスポーツ医学に必要な身体の構造と機能および異常に関する基礎的事項について学習する。運動、スポーツ障害等に対する対処法、理学療法などのスポーツ医学の応用的事項について解説する。【専門科目】スポーツ医学セミナーIスポーツ医学概論Iで学んだ事項について、各指導教員のもとで研究デザインや研究手法などの基礎を実習する。スポーツ医学セミナーIIスポーツ医学概論IIで学んだ事項について、各指導教員のもとで研究デザインや研究手法などの基礎を実習する。スポーツ医学セミナーIIIスポーツ医学分野で最先端の研究を行っている外部講師から最近の知見を学び、専任教員を含めて討論を行う。I博士論文の研究計画について、指導教員が研究指導を行う。III博士論文の作成について、指導教員が論文指導を中心に行う。