雌性発生によりクローンとして繁殖することが知られている。ならびに山口県錦川より合計312個体のフナ類を得た。DNA量フローサイトメトリーあるいは赤血球径測定から倍数性判定をしたところ、全水系で36~100%の率で全雌三倍体ギンブナが出現した。これらについて、DNAフィンガープリント法によりクローン識別を行ったところ、複数個体間で遺伝的同一性が認められ、全体で16クローン系統が識別できた。個体特異的DNA型をもつギンブナを1クローンとすると、さらに56系統が存在する。クローン16系統中、6系統は2~3水系の問で共通して出現したが、残り10系統は各水系に固有であった。優占的に出現する系統は水系毎に異なっていた。同一地点でも、年級毎に優占クローンが異なった。