南阿蘇鉄道のJR豊肥本線への乗り入れ計画の支援として1億3300万円を新規計上した。列車は肥後大津駅まで乗り入れる。3億5200万円、車庫改良などに3100万円かかることが想定されている。車庫改良などの費用も熊本県が2分の1を負担し、残り2分の1は2町村が負担する。事業期間は2022年度。南阿蘇鉄道は立野~中松~高森間17.7kmの高森線を運営する第三セクター。2016年の熊本地震で橋りょうが変形するなど甚大な被害が発生し、いまも立野~中松間10.5kmが運休中だ。2023年夏頃の全線復旧を目指して工事が進められている。この復旧計画を機に、南阿蘇鉄道の列車を豊肥本線の肥後大津駅まで乗り入れさせ、利便性向上や観光客誘致を図る構想が浮上。昨年2021年10月にJR九州と南阿蘇鉄道が設計に着手した。当初は沿線の2町村が乗り入れにかかる費用を負担することが考えられていたが、南阿蘇鉄道がコロナ禍で経営が悪化し、2町村がそれに対する支援を行っているため費用負担が難しくなった。2町村の負担を大幅に軽減するため財政支援を行う方針を明らかにしていた。