センターなどの公的な研究機関から産地,品種判別のための種々のマニュアルが公開されています。産地判別には無機元素分析(ICP発光分析計),品種判別には種々DNA多型解析法が採用されています。品種判別に用いられるDNA多型解析には,アガロースゲル電気泳動,DNAシーケンサまたはポリアクリドアミドゲル電気泳動によるフラグメント解析,DNAシーケンス解析が挙げられます。アガロースゲル電気泳動はより高性能なマイクロチップ電気泳動によって置き換えができます。ここでは(ICP発光分析計)による産地判別,マイクロチップ電気泳動(DNA/RNA分析用マイクロチップ電気泳動)による品種判別の分析事例を紹介します。DNA多型解析法(マイクロチップ電気泳動,アガロースゲル電気泳動)食品に含まれる遺伝子(DNA配列)の出現パターンと既存の判別パターンとを照合することにより判別。魚類判別はDNAシーケンサを併用することあり。マニュアルのない食品についても,判別したいという要望が高まっており,多く判別法の開発が行われています。以下のような新しい分析法による判別法も知られています。