UP!マメ知識シーケンサーMiSeqとNextSeq1000(イルミナ社)の比較マメ知識MiSeqとNextSeq1000(イルミナ社)の比較シーケンサーNextSeq1000でも同じ結果が得られる?600サイクルキットはMiSeqでのラン試薬のみの販売でしたが、2022年にNextSeq1000/2000に対応した600サイクルキットがリリースされました。菌叢解析は継続研究が多いので、両機種で同等の結果が得られるのかが気になるところです。bpの条件でシーケンシングを行いました。(Illumina)データ解析:菌叢解析用パイプラインQiimeを用いて、系統推定を行いました。bpの条件でシーケンシングを行った結果も比較しました。1000およびDNBSEQ-G99のどのシーケンサーを用いた場合でも、系統推定結果に違いは認められませんでした。(PCoA)の結果サンプルごとに色分けされており、各色3点(MiSeq、NextSeq1000、DNBSEQ-G99の結果)が近距離にあり差異が少ないことがわかります。Categoryの欄でTreatment1(サンプルで群分け)またはTreatment2(シーケンサーで群分け)を選んでいただくとわかりやすいかと思います)。https://gikenbio.com/data/NextSeq_Weighted_unifrac/index.html生データや系統推定結果含む全データのダウンロードはこちらからこの結果を受け、弊社では2024年8月よりNextSeq1000を本格稼働させました。ショートリードのアンプリコンシーケンス解析は、MiSeqとの2機種体制になります。各種ダウンロードお見積依頼お問合せログインログイン情報を記憶するパスワードを忘れた場合CLOSEパスワード再設定メールアドレスを入力してください。入力されたメールアドレスにパスワード再発行のメールをお送りします。