2021.12.22とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、論文相談バイオインフォマティクスの解析では、とても大きなファイルを取り扱うことがあります。解析後もデータを安全に長期間保存しておく必要があって、データ保存に対する悩みは尽きません。速く、より高い圧縮率でファイルを小さく圧縮できれば、それだけで取り扱いが楽になります。Zstandardは未だ広く活用されていませんが、このような方法も知っておけば役に立つかもしれません。Colletによって開発された可逆圧縮アルゴリズムである。アルゴリズムによるものと遜色ない圧縮を行うように設計されている。インストール最新版をダウンロードして、make。その後、適当なパスを通します。使うコマンドファイルを圧縮ファイルを指定して、zstdをコールするだけ。この場合の圧縮率は、gzipによる圧縮と大して変わりません。拡張子は、「.zst」になります。出力ファイル名を指定することも可能です。-oオプションを使います。時間はかかるが高圧縮ファイルを指定して、ultraオプションでコールします。時間はかかりますが、圧縮率は更に高くなります。圧縮ファイルの展開は高速です。-dオプションを指定します。bytesディレクトリを再帰的に圧縮zstandardにはアーカイブ機能がないので、フォルダ全体を圧縮したい場合はtarコマンドと併用すると良いです。ちなみに、再帰的な圧縮オプションrは、指定したフォルダ内のファイルを1つずつzstandardで圧縮します。グラフの描き方Rでグラフを描画する場合、位置やサイズを自動調整してくれるので大変便利です。カスタマイズしようと思えば、各種パラメータを調整する必要があります。綺麗なグラフに仕上げるために、軸ラベルや目盛り、余白の調整についてまとめます。インストールバイオインフォ道場、くまぞうです。今回は、SQLiteのインストールに挑戦です。SQLiteのサイトからソースコードをダウンロードして、ソースコンパイルでインストールします。ソースコードが2種類準備されています。スクリプトの書き方バイオインフォ道場、くまぞうです。ハッシュは、複数の値を管理する入れ物のようなものです。データをキーとバリューで管理します。参照や編集・追加・削除などを行うことができます。スクリプトの書き方Rの使い方として、プログラムの基本構成となる関数の作り方について。メッセージの表示や、メッセージの長さを取得する関数を作成します。私もそんな風に考える一人でした。FastqからFastaへ変換Fastq・Fastaファイルともに、バイオインフォマティクスで良く使うファイル形式です。FastqからFastaへ変換についてまとめます。当ブログで掲載している画像の著作権・肖像権等は各権利所有者に帰属致します。権利を侵害する目的ではございません。直接メールでご連絡下さい。確認後、対応させて頂きます。当ブログのコンテンツ・情報につきまして、可能な限り正確な情報を掲載するよう努めておりますが、誤情報が入り込んだり、情報が古くなっていることもございます。当ブログからリンクやバナーなどによって他のサイトに移動された場合、移動先サイトで提供される情報、サービス等について一切の責任を負いません。閲覧者が当ブログの情報を直接または間接に利用したことで被ったいかなる損害についても当サイト運営者は一切の責任を負いません。解析ツールR言語グラフ理系のサバイバルプライバシーポリシーホーム検索トップタイトルとURLをコピーしました。