指定箇所に設置しなければならない。格納庫はカタパルトのある艦船にのみ設置でき、艦載機を搭載可能になる。整備庫は艦載機の発着の速度などに影響がある。貨物の搭載ができるようになる貨物室が搭載できる。長距離航海すると、入港時に資金が入手できる。スペースの許す限りいくらでも設置できる。乗組員を搭載する乗員船室、食堂などがある。乗員数は最低稼働人数を超えていなければならず、乗員船室がゼロだと下回ることが多いため最低でも最低稼働だけは満たす必要があるが、上限はないためスペースの許す限りはいくらでも設置できる。白兵戦時に活用できるが、沢山載せ過ぎると居住性が悪くなり、疲労もたまりやすくなる。旗艦にのみ効果がある艦長室・メインクルー食堂もあり、搭載すると名声が一時的に上昇する。医療いわゆる医務室であり、居住性や乗組員の回復速度に影響がある。訓練シミュレーションなどによる訓練が行える訓練室である。これを搭載したまま航海することによって対応する能力が上昇する。科学技術による艦船の強化速度が早まる。白兵戦時の攻撃力の上がる保安局、経費が削減される主計局がある。ともに居住性が上がる。娯楽スポーツドームや自然室、シップショップなど、居住性などが上昇する。攻撃力や防御力・耐久力などを上げる、最低稼働人数を減らすなど特殊効果を持ったモジュールである。設計図によって決められており、艦船によって1つから最大5つの兵装を持つ。変更可能な兵装の数も異り、変更できない固定兵装を装備している艦船もある。変更できる場合なにも装備しないことも可能である。兵装にはサイズがSからLLまで定められており、可変の場合でもサイズが同じ武器しか取り付けられない。強力な装備はゲームが進むと自動で入手できるほか、一部イベント入手できる。兵装には大きく分けて対空・対艦装備があり、更に対艦装備は実体弾と光学兵器、プラズマに分類される。対空兵器は敵艦載機による対艦攻撃を迎撃するための兵装であり、敵艦載機が直接攻撃してきたときのみ効果を発揮する。対艦兵装は光学兵器については攻撃力・防御力を増加させるモジュールが存在するほか、複数回攻撃できる連装兵器も存在する。終盤では敵も光学兵器対策をしてくるうえ複数回攻撃する武器は減衰が著しくスペック通りのダメージを与えられるとは限らない。実体弾は命中率が低いことが多いが、その分光学兵器に比べ高く安定した攻撃力を誇り対光学兵器モジュールで減衰しない。プラズマは固定兵装であるが極めて強力である。対艦兵装は更に単体向けと全体攻撃できる兵器が存在する。全体攻撃できる武器は命中率も高く、選択していない敵も含め敵全体が攻撃できる。他にも固定兵装で特殊攻撃用兵器があり、コマンド形式で戦闘中に用いる武器も存在する。射程がや威力が極めて強力であるが、使用後は一定時間行動不能になる、敵が回避機動をとっていると命中率が著しく落ちるなどのデメリットがある。内装モジュールの一種「格納庫」を、カタパルトのある艦船に設置することにより初めて搭載可能となる。格納庫はカタパルトに1マスでも隣接していれば設置可能である。空母に搭載するものと思われがちだが、戦艦など別の艦種であってもカタパルトがついていれば格納庫を設置することによって艦載機を搭載することができる。コマンドを指示してから実際に発進するまでに掛かる時間は艦ごとによって異なる。艦載機搭載船を複数運用した場合、発進までの時間が最も長い艦に艦隊全体が合わせて固定される。艦載機には対艦に特化した攻撃機タイプの機体や、対艦載機に特化した戦闘機タイプの機体、バランス型の汎用機タイプの機体など固有の性能がある。艦船1隻に付き搭載できる艦載機は1種類のみであり、サイズ1の艦載機は最大60機まで搭載できる。サイズが増えると1/2、1/3になる。艦載機の積載可能数は搭載できる格納庫で決まっており、これを超えて搭載することもできるもののもちろんそれ以上は出撃できない。搭載できる格納庫の数や設置スペースによって実質的な艦載機の積載上限が定まるというわけである。説明書には人型戦闘機も紹介されているが、実際に使用出来るのは二周目以降である。艦船の能力[編集]艦船のパラメータについて述べる。耐久力いわゆるヒットポイント。戦闘中にもスキルで回復できる。ゼロになった艦は撃沈し、ほかの宇宙港に入港するまで復活できない。装甲いわゆる防御力である。実体弾に対する防御を得るには、装甲を上げるしかない。