高校2年生の真夏ダイチは、夏休みが始まる前の晩にテレビで、種子島上空に突如として不思議な丸い虹が浮かぶのを目にする。激しい胸騒ぎに突き動かされ、ひとり種子島へと向かうダイチ。幼き頃出会った不思議な少年少女との記憶。複雑な思いを胸に島に降り立ったダイチは、とある施設で鳴り響く警報の中、“アースエンジン”と出会う。「君はキャプテンか――」その力が問われるダイチ。天王星の衛星軌道から来襲する、謎の完全機械生命体“キルトガング”の目的とは。満天の星が輝くとき、彼らの戦いが今、幕を開ける――。