高密度に配置し、固定したものである。よって高感度に検出する。RNA、もしくは、それを調製した試料である。チップは、近年の技術的進歩によって、基礎研究用のみならず、あらゆる疾患の検査・診断や各種薬剤感受性の検査などに利用されるようになってきており、新たなジャンルの次世代医療機器として期待されている。チップは信頼性や再現性、標準化など臨床現場に広く導入するにはまだ問題も多い。チップ及び関連機器の開発の促進・活性化を目的に、その指標となるためのガイドラインを策定する。治療効果モニタリングなどが考えられる。チップを用いる場合、得られるデータの高い信頼性や再現性が重要であり、判定ミスや判定の曖昧さを極力排除しなければならない。不安定な物質であるため、検体の保管・運搬及び前処理を含めた取り扱いにおける質保証、さらに再現性や信頼性の確保など様々な問題点がある。この点については後に項目別に述べる。チップは専用の測定装置とともに使用され、複数遺伝子の測定値をアルゴリズムに基づいて解析し、医療情報として提供する。チップおよび関連装置の開発の促進には、高性能な測定装置の開発だけでなく、データの互換性や精度や再現性の向上のための標準化も必要であり、またチップや装置の評価法についても指針が必要と思われる。つの項目にわけて記述する。チップの研究・開発を円滑に進めるうえで有用と考えられる事項を掲げたものであり、製品化に当たって、これらの事項のすべてが必要となるとは限らず、また、これら以外の事項が必要となる可能性があることに留意すること。パラフィン包埋標品などが考えられる。生材料の採取にはその迅速性、適切な保存処理がその後の解析に決定的な影響を与えると考えられ、そのプロトコルの標準化が重要な問題である。薬剤効果のモニターなどの参考となる。検体の採取には侵襲を伴うため、その負担とリスクを軽減する工夫や事故の補償に配慮すべきである。解析対象であってもそこから一部のゲノム情報も得ることができるため、遺伝子型解析と同様に個人情報保護に注意する必要がある。あり、本邦でも保険適用外ではあるが一部医療機関で用いられつつある。システムとして一体化したものとして扱うことが必要であろう。チップとこれを解析する装置は、一体化した状態での性能を規定し、その信頼性を評価するかたちが求められる。検出方式、装置で検出する出力信号を生み出す機構について詳細に検討する。チップを構成する主要素の仕様や形状・サイズ・構造などについて検討すること。temperature)値、GC(グアニン・シトシン)比、配列の特異性や長さなど、プローブ設計の要件について検討すること。人工核酸を用いる場合はその化学的性質についても検討すること。装置に関しては、装置本体の構成、装置を構成する各構成要素の仕様、機能の概略などについて検討すること。装置に導入する前工程、チップ・装置へのセッティング、装置での処理手順(処理条件)、信号から判定を導く工程等について技術的に詳細に検討すること。装置での処理は、マニュアル操作と自動操作の区別も明記し、操作におけるリスクについても評価すること。各機構の動作、性能、役割を技術的に評価すること。標準物質を用いて測定装置の評価や基準光源などの基準信号源による測定装置自体の校正を行うことが望ましい。チップの特異性を検討すること。プローブの選定プロセスを詳細に説明すること。目的遺伝子以外と交差反応する可能性がある場合は、そのリスクについても検討すること。用いて、検出系の検出限界濃度やダイナミックレンジを検討すること。チップと検出装置、反応プロトコル、検出条件などを明記すること。チップ、および検査システムによって得られるデータの再現性は十分に検証すること。再現性試験は、以下の項目について行うこと。設け、各種対照の意義、それらの結果がもたらす管理項目について技術的に検討すること。検査機器の設定条件に対するモニタリング方法及びフィードバック方法を検討し、所定の条件で検査が実施されていることをどのように管理されているか説明すること。各コントロール、モニタリング、フィードバックにより得られる情報から、異常データとその管理方法を想定すること。ついて技術的に検討し、また、交差汚染を評価するための試験を実施しその結果を残すこと。チップでの検出に干渉する場合もある。したがって、干渉物質が検出性能に及ぼす影響について特性評価をすること。定量に対する安定性について検討すること。得る検体の種類(例えば血液、組織)およびその採取方法、採取量について検討すること。検体の管理・保管方法については検討すること。抽出・精製する方法について検討すること。品質基準を設定すること。なんらかの増幅法で増幅した上で用いる場合には、その増幅法と使用する試薬について検討すること。標識した上で後段の反応に使用する場合には、その処理法と使用する試薬について検討すること。RNA、といったすべての段階のサンプルについて、保管法及び輸送法について検討すること。保管・輸送に適した温度と性能を維持できる期間について明記すること。抽出・検査など各工程で使用される試薬について、その種類・濃度などに関して検討すること。対する試薬の影響について、プロセスの各段階で検証した結果を残すこと。品質と量を評価するための方法・仕様を技術的に検討すること。反応に使用される試薬の保管法・輸送法についても検討すること。各工程で使用される試薬の安全性、および安全な取り扱いに必要な注意事項を検討すること。自動操作サンプル調製に関して人為的要因による差異、施設間の差異を回避するために、自動化の導入が考えられる。分解酵素等の汚染物質の混入を防止できる構造であること、トレーサビリティを確保可能な機構であること、人的過誤を回避するための工夫が施され、作業者への安全性が確保できること等を考慮すること。自動化が導入された場合も、その結果の再現性等、妥当性を確認すること。装置のソフトウェア構成、その機能、関係性について技術的に検討すること。その際、ユーザが直接操作する部分、機器を制御する部分、データの解析を行う部分、データの管理を行う部分等について、項目に分けて文書化されていること。データの処理、解析ソフトウェアについては、詳細を記した説明書を作成すること。動作等、正規の操作・動作以外の状況発生時の対応についても検討すること。62304:2006)などを参照すること。種類、各プローブの重複数、判定に用いる測定値の定義、各プローブの測定値から判定を行うためのアルゴリズム、判定に必要な基準値の定義とその設定における統計学的な根拠、最終的な判定結果とその信頼度が十分な詳しさで文書化されていること。チップ及び試薬ロット、検査プロトコル、測定装置の対応が付けられるようにデータ管理されていること。品質管理について検討すること。GMP/QMS(ISO13485)などの製造管理/品質管理体制を検討すること。GMP/QMS(ISO13485)などの製造管理/品質管理体制に関して、検討すること。チップの評価法としては、以下の項目を含むこと。チップの評価にあたっては、他の遺伝子発現の解析法と比較検討すること。鋳型にして定量する方法により行い、両者の一致率を遺伝子ごとに検討すること。チップ等を用いることができる。データ解析、解析ソフト解析ソフトについては、用途に対して十分であることを適切に妥当性が検討され、同一データから同一の結果が得られること。その再現性を保証するためには、アルゴリズムを明確に表現すること。具体的には正規化の手法、データ補正の方法、マーカー遺伝子の抽出方法、判定の方法などを数式等で表し、数値化したデータに基づき判定されること。妥当性の検討にあたっては、各方法の良否の確定に用いる手法は、コスト、リスクおよび技術的可能性のバランスを十分に検討し、次の事項のうちの一つ、またはそれらの組合せであり、客観的な結果を残すこと。影響する要因の系統的な評価・方法の原理の科学的理解および実際の経験に基づいた有意性の評価また失敗事例(判定不能、器具の故障、試薬の不具合等に起因するもの)に関しても分析すること。号通知別添2「RNAプロファイリングに基づく診断装置の評価指標」を参照のこと。号通知別添2「RNAプロファイリングに基づく診断装置の評価指標」を参照のこと。調製法あるいは起源、試料の使用目的(特異性など)の記録を残すこと。最終的な結果の出力だけではなく、結果出力前の画像ファイルや数値データ等を保存すること。信号の検出・分析、データ保存については、プライバシーとセキュリティを十分に確保すること。結果に疑問が生じた場合には、データ処理段階毎に確認が可能となること。交差汚染を評価するための試験を実施して結果を残すとともに、判定に失敗した場合、あるいは判定結果の解釈に失敗した場合のリスクも評価し、その際に用いたリスク分析手法についても検討すること。該開発品を用いた遺伝子発現解析データなどの信頼性を向上させることを目的とする。これらには測定結果のトレーサビリティの確認にも適用可能な性能が求められる。従って該開発品製造における標準物質の選定に当たっては以下の方法論的課題を考慮すべきである。当該開発品が検出対象とする遺伝子と遺伝子発現量の相対比較に使用される塩基配列を含むサンプルによる評価が求められる。これらの被検対象への値付けや当該開発品の校正を行うため、測定対象標品には対象遺伝子を含む複数のヒトRNAサンプルや遺伝子発現量の相対比較に使用される内在遺伝子や人工的な対照塩基配列を含むサンプルを使用することを推奨する。測定対象と同じ塩基配列を有する上位の標準物質(認証標準物質など)を用いて被検対象の値付けをすることによって、測定結果のトレーサビリティを確認することもできる。対象遺伝子や人工的な非遺伝子塩基配列のうち、ヒト染色体遺伝子よりも安定性に優れ、増産が可能である合成RNAやcDNA或いはその鋳型となるプラスミドDNAが適用され、当該開発品の性能評価が可能な部分の遺伝子配列或いは任意の非遺伝子塩基配列が含まれていれば良い。関する品質管理方法及びRNAの標準処理手順マニュアル)が設定されるべきである。標準物質は選定時にDNAシークエンシング等の方法によって配列を確認すること。標準物質を酵素合成等によって複製する場合は、複製ロット毎に遺伝子配列の確認を行うことによって相同性を担保する。酵素合成法による複製を経て使用されるが、複製を行う場合には適切な頻度で遺伝子配列が確認されなければならない。複製の鋳型などに用いるDNAの合成については、ホスホロアミダイト法等の一般的な方法を行い、目的とした遺伝子配列が合成されていることをDNAシークエンシング法、質量分析(TOF‐MS)、HPLCや電気泳動法によって確認する。標準物質を感度試験に用いる場合には、核酸定量法によって求められた既知濃度の標準物質を用いて希釈検体を作製し、検出感度の検定を行う。吸収を持つ不純物が含まれていないことを確認する必要がある。可能な場合、濃度値が付与された認証標準物質によって値付けした標準物質を用いることで、トレーサビリティの確認を行うこともできる。医学研究所を通じて入手し、保存及び管理を行い、当該開発品の機能評価を受託業務として実施するので、それらを利用することができる。頒布するトレーサビリティが確立された認証標準物質を利用することができる。(GeT-RM)は、遺伝子検査におけるQC、研究、検定試験や測定データの検証に適した参照物質を研究者が利用できるよう、CDC主導の基に設立された綱領である。