高密度に配置し、固定したものである。よって高感度に検出する。RNA、もしくは、それを調製した試料である。チップは、近年の技術的進歩によって、基礎研究用のみならず、あらゆる疾患の検査・診断や各種薬剤感受性の検査などに利用されるようになってきており、新たなジャンルの次世代医療機器として期待されている。チップは信頼性や再現性、標準化など臨床現場に広く導入するにはまだ問題も多い。治療効果モニタリングなどが考えられる。チップを用いる場合、得られるデータの高い信頼性や再現性が重要であり、判定ミスや判定の曖昧さを極力排除しなければならない。不安定な物質であるため、検体の保管・運搬及び前処理を含めた取り扱いにおける質保証、さらに再現性や信頼性の確保など様々な問題点がある。この点については後に項目別に述べる。チップは専用の測定装置とともに使用され、複数遺伝子の測定値をアルゴリズムに基づいて解析し、医療情報として提供する。チップおよび関連装置の開発の促進には、高性能な測定装置の開発だけでなく、データの互換性や精度や再現性の向上のための標準化も必要であり、またチップや装置の評価法についても指針が必要と思われる。つの項目にわけて記述する。パラフィン包埋標品などが考えられる。生材料の採取にはその迅速性、適切な保存処理がその後の解析に決定的な影響を与えると考えられ、そのプロトコルの標準化が重要な問題である。薬剤効果のモニターなどの参考となる。検体の採取には侵襲を伴うため、その負担とリスクを軽減する工夫や事故の補償に配慮すべきである。解析対象であってもそこから一部のゲノム情報も得ることができるため、遺伝子型解析と同様に個人情報保護に注意する必要がある。あり、本邦でも保険適用外ではあるが一部医療機関で用いられつつある。検出方式、装置で検出する出力信号を生み出す機構について詳細に検討する。チップを構成する主要素の仕様や形状・サイズ・構造などについて検討すること。temperature)値、GC(グアニン・シトシン)比、配列の特異性や長さなど、プローブ設計の要件について検討すること。人工核酸を用いる場合はその化学的性質についても検討することが望ましい。装置に関しては、装置本体の構成、装置を構成する各構成要素の仕様、機能の概略などについて検討すること。装置に導入する前工程、チップ・装置へのセッティング、装置での処理手順(処理条件)、信号から判定を導く工程等について技術的に詳細に検討すること。装置での処理は、マニュアル操作と自動操作の区別も明記し、操作におけるリスクについても評価することが望ましい。各機構の動作、性能、役割を技術的に評価すること。標準物質を用いて測定装置の評価や基準光源などの基準信号源による測定装置自体の校正を行うことが望ましい。チップの特異性を検討すること。プローブの選定プロセスを詳細に説明することが望ましい。目的遺伝子以外と交差反応する可能性がある場合は、そのリスクについても検討することが望ましい。用いて、検出系の検出限界濃度やダイナミックレンジを検討すること。チップと検出装置、反応プロトコル、検出条件などを明記することが望ましい。チップ、および検査システムによって得られるデータの再現性は十分に検証すること。再現性試験は、以下の項目について行うことが望ましい。設け、各種対照の意義、それらの結果がもたらす管理項目について技術的に検討すること。検査機器の設定条件に対するモニタリング方法及びフィードバック方法を検討し、所定の条件で検査が実施されていることをどのように管理されているか説明すること。各コントロール、モニタリング、フィードバックにより得られる情報から、異常データとその管理方法を想定することが望ましい。ついて技術的に検討し、また、交差汚染を評価するための試験を実施しその結果を残すことが望ましい。チップでの検出に干渉する場合もある。したがって、干渉物質が検出性能に及ぼす影響について特性評価をすることが望ましい。定量に対する安定性について検討すること。得る検体の種類(例えば血液、組織)およびその採取方法、採取量について検討すること。検体の管理・保管方法については検討することが望ましい。抽出・精製する方法について検討すること。品質基準を設定すること。なんらかの増幅法で増幅した上で用いる場合には、その増幅法と使用する試薬について検討すること。標識した上で後段の反応に使用する場合には、その処理法と使用する試薬について検討すること。RNA、といったすべての段階のサンプルについて、保管法及び輸送法を検討すること。保管・輸送に適した温度と性能を維持できる期間について明記すること。抽出・検査など各工程で使用される試薬について、その種類・濃度などに関して検討することが望ましい。対する試薬の影響について、プロセスの各段階で検証した結果を残すことが望ましい。品質と量を評価するための方法・仕様を技術的に検討すること。反応に使用される試薬の保管法・輸送法についても検討すること。各工程で使用される試薬の安全性、および安全な取り扱いに必要な注意事項を検討することが望ましい。装置のソフトウェア構成、その機能、関係性について技術的に検討すること。その際、ユーザが直接操作する部分、機器を制御する部分、データの解析を行う部分、データの管理を行う部分等について、項目に分けて記述すること。正規の操作・動作以外の状況発生時の対応についても検討することが望ましい。判定アルゴリズムについて検討すること。種類、各プローブの重複数、判定に用いる測定値の定義、各プローブの測定値から判定を行うためのアルゴリズム、判定に必要な基準値の定義とその設定における統計学的な根拠、最終的な判定結果とその信頼度を検証すること。チップ及び試薬ロット、検査プロトコル、測定装置の対応が付けられるようにデータ管理されていること。品質管理について検討すること。GMP/QMS(ISO13485)などの製造管理/品質管理体制を検討することが望ましい。GMP/QMS(ISO13485)などの製造管理/品質管理体制に関して、検討することが望ましい。チップの評価法としては、以下の項目を含むことが望ましい。チップの評価にあたっては、他の遺伝子発現の解析法と比較検討すること。調製法あるいは起源、試料の使用目的(特異性など)等の記録を残すことが望ましい。鋳型にして定量する方法により行い、両者の一致率を遺伝子ごとに検討することが望ましい。チップ等を用いることができる。データ解析、解析ソフトについて解析ソフトについては、同一データから同一の結果が得られること。その再現性を保証するためには、アルゴリズムを明確に表現すること。具体的には正規化の手法、データ補正の方法、マーカー遺伝子の抽出方法、判定の方法などを数式等で表し、数値化したデータに基づき判定されることが望ましい。有意性の検定データの解析法、解析評価に用いたソフトウェア、および統計分析に関して検討することが望ましい。データの処理、解析ソフトウェアについては、詳細を記した説明書を作成すること。失敗事例(判定不能、器具の故障、試薬の不具合等に起因するもの)に関しても分析することが望ましい。一致率の基準としては、他の診断薬が存在する場合は正答率を一応の目安とする。分析間の再現性を特徴付けられるような試験を設計し、その結果を検討すること。その際に、以下の点に留意することが望ましい。チップを用いた診断においては、複数遺伝子の発現パターンよりアルゴリズムで判定を行う。アルゴリズム作成に必要な検体数について規定はないが、アルゴリズムの検証のための臨床性能試験は、一般の既存の体外診断薬に関する基準に基づき、複数施設から収集したサンプルを用いた統計的有意差を示すデータの提出が要求される。患者数が限られている場合や、より少ない症例数で有効性が十分に示される場合は、その科学的根拠に基づいて説明すること。データの管理について最終的な結果の出力だけではなく、結果出力前の画像ファイルや数値データ等を保存すること。信号の検出・分析、データ保存については、プライバシーとセキュリティを十分に確保することが望ましい。結果に疑問が生じた場合には、データ処理段階毎に確認が可能となることが望ましい。安全性について交差汚染を評価するための試験を実施して結果を残すとともに、判定に失敗した場合、あるいは判定結果の解釈に失敗した場合のリスクも評価し、その際に用いたリスク分析手法についても検討すること。例数と複数機関において検討されたデータから臨床上の有効性を確認すること。トレーサビリティの確認や日常検査における精度管理に用いる二次標準物質とする。し、二次標準物質を設定し、これを用いて性能の確認を行う。適合する品質システムに基づいて生産された認証標準物質であり、国家計量機関や公的研究機関から頒布されたものとする。二次標準物質には、対象遺伝子と遺伝子発現量の相対比較に使用されるコントロール配列を含むものとする。チップの互換性、校正にも使用できる。対象遺伝子およびコントロール配列については、感染症や疾病に関与するものや識別に用いられる遺伝子配列であり、安定性に優れ、増産が可能である配列が適用され、当該開発品の性能評価が可能な部分の遺伝子配列が含まれていれば良いものとする。標準処理手順マニュアル)が設定されることが望ましい。シークエンシングなどの方法により配列を確認する。同様に、一次標準物質を酵素合成などにより複製する場合は、開発する機関において複製ロットごとに遺伝子配列の確認を行うことにより相同性を担保するものとする。一次標準物質を使用する際は、認証書等に記載された内容に従って、取り扱うものとする。二次標準物質の複製を行う場合には、適切な頻度で遺伝子配列を確認する。同様に複製ロットごとに遺伝子配列を確認する。HPLC、電気泳動法により確認する。二次標準物質の設定時には、用いる一次標準測定法に応じて、対象となる測定物質がバックグラウンドとしてどの程度含まれているか確認する。用いて溶液に含まれる核酸の質量あるいは物質量の濃度として認証されることが望ましい。法などを用いたコピー数を参考情報として表記することが望ましい。外部標準物質を感度試験に用いる場合には、核酸定量法により求められた既知濃度(理論値)の標準物質を用いて希釈検体を作製し、検出感度の検定を行う。核酸定量は、吸光度法(OD260)以上の精度を有する測定法により実施することが望ましい。Exploitation)コンソーシアムと業界関連団体が検討を進めており、データベースとの連携をするコンソーシアムも存在する。連携して該開発品の機能評価を受託業務として実施する。ヒトゲノムサンプルの保存中または培養による後天的変異を監視するための定期的な検査も管理業務に含めるものとする。