1:265日に台風3号が最接近した沖縄・南大東島で、竜巻とみられる突風が吹いていたことがわかった。沖縄気象台によると、竜巻とみられる突風が吹いたのは南大東島が暴風域に巻き込まれる約6時間前の5日午前3時頃。突風が吹いた一帯では、軽乗用車が横転したり、民家のトタン屋根が飛ばされたりする被害が出ており、風の強さは6段階の藤田スケールで一番下の「F0」とみられている。気象庁の機動調査班が6日に現地調査を行い、被害が帯状に分布していることや、被害の痕跡から浮かぶ風向きが一定していないことなどから竜巻と推定した。