Od początku prac nad konstytucją zabierał w jej sprawie głos Kościół. Episkopat wyrażał swoje postulaty. Spór co do granic politycznej aktywności Kościoła pojawił się w momencie przygotowań do referendum.Episkopat ustalił, że nie będzie wskazywać wiernym, jak mają głosować: za konstytucją czy przeciw niej. Biskupi poczęli oceniać ustawę, co przecież jest wystarczającą wskazówką. W mediach przewinęła się dyskusja, czy to agitacja.Politycznej agitacji w kościołach konsekwentnie sprzeciwia się biskup Tadeusz Pieronek. Dziwi zaostrzający się język sporu w Kościele. Biskup Pieronek przyznał, że próbuje się wciągnąć Kościół w grę polityczną, stwarzane jest wrażenie, że Kościół popiera prawicę. Kapłani nie powinni przedstawiać własnych wyborów jako jedynych prawomocnych.
Wśród samego duchowieństwa coraz bardziej widoczny jest brak zgodności co do granic politycznej aktywności Kościoła hierarchicznego. Sytuacja się zaostrza, ponieważ nałożyły się na siebie dwie kampanie – referendalna i parlamentarna. Nigdy wcześniej oficjalne stanowisko Episkopatu nie było też tak jawnie krytykowane przez niektórych duchownych. Wg nauczania Kościoła wierni świeccy działają w polityce na własną odpowiedzialność. Kościół ma dokonywać oceny moralnej zjawisk społecznych, ale nie powinien podejmować agitacji politycznej. Te same etyczne cele mogą być bowiem osiągane za pomocą różnych środków i różnych programów politycznych. Doświadczenia ostatnich lat pokazują, że nadmierne angażowanie się w politykę może Kościołowi tylko zaszkodzić.