Kritičari GAP-a kažu kako povećanjem iskorištavanja ovih rijeka u Turskoj smanjuju količinu vode koja stiže nizvodno do Sirije i Iraka. Pitanje protoka voda stvorilo je niz političkih poteškoća među ovim državama.
GAP'ı eleştirenlere göre ise, Türkiye bu nehirlerden ne denli faydalanırsa, nehir yataklarının aşağı bölümünde kalan Suriye ve Irak'a o kadar az su akacak, ki bu sorun, bugüne kadar üç ülke arasında sık sık siyasi sorunlar yaşanmasına neden oldu.