Gotovina, 49, nestao je u lipnju 2001. godine, ubrzo nakon što je ICTY podignuo optužnicu protiv njega zbog navodnih ratnih zločina koje su koncem sukoba u Hrvatskoj, koji je trajao od 1991. do 1995. godine, počinile snage pod njegovim zapovjedništvom.
49 yaşındaki Gotovina, ICTY'nin kendisini Hırvatistan'daki 1991-1995 ihtilafının sonlarına doğru komutası altındaki askerlerin işlemiş olduğu savaş suçlarında rol oynadığı iddiasıyla suçlamasından kısa bir süre sonra, Haziran 2001'de ortadan kayboldu.