Međutim, islamski korijeni AKP-a izazvali su sumnju među moćnom vojskom zemlje, koja sebe smatra jamcem sekularnog uređenja Turske, iako su Erdogan i ostali čelnici stranke u više navrata isticali kako nemaju prikrivene vjerske ciljeve.
Ancak Erdoğan ve diğer parti yöneticilerinin gizli bir gündeme sahip olmadıklarını sürekli olarak belirtmelerine karşın, AKP'nin İslamcı kökleri kendisini Türkiye'de laik düzenin bekçisi olarak gören güçlü ordu içinde şüphelere yol açtı.