Zemlje jugoistočne Europe naslijedile su brojne strukturne poteškoće na tom području, uključujući u velikoj mjeri zastarjelu istraživačku i tehnološku infrastrukturu te oskudicu industrijskih zahtjeva za primijenjena istraživanja, kombinirano s malim financijskim ulaganjima tvrtki u istraživanje i razvitak, odljevom mozgova, rascjepkanošću istraživačkog sustava i nedostatkom povezanosti između industrija i istraživačkih sektora.
Güneydoğu Avrupa ülkeleri, büyük oranda modası geçmiş araştırma ve teknoloji altyapısı ve uygulamalı bilimlere yönelik sektörel talep kıtlığının yanı sıra işletmelerin araştırma ve geliştirmeye düşük kaynak ayırmaları, beyin göçü, araştırma sisteminin parçalanması ve sanayi ile araştırma sektörleri arasında bağlantı eksikliği de dahil olmak üzere bu alanda bir çok yapısal sorun devraldılar.