Izmijenjena optužnica u 11 točaka podignuta je u svibnju 2000-te, te je zamijenila prvobitnu, podignutu u srpnju 1995, a Karadžića optužuje za mnoštvo ratnih zločina protiv nesrpskog stanovništva, uključujući istrebljivanje, ubojstva, samovoljno ubijanje, progone, deportacije, djela protiv čovječnosti, teroriziranje i uzimanje talaca.
Temmuz 1995’teki ilk iddianamenin yerini alan Mayıs 2000 tarihli, 11 maddelik değiştirilmiş iddianamede Karadziç, Sırp olmayanları hedef alan ve aralarında imha, cinayet, kasten adam öldürme, işkence, sürgün, insanlık dışı hareketler, korkutma ve rehin alma gibi eylemlerin bulunduğu çok sayıda savaş suçu işlemekle suçlanıyor.