U optužnici ICTY-a navodi se da je Rajić zapovijedao operativnom skupinom Hrvatskog vijeća obrane (HVO), oružanih snaga samoproglašene Hrvatske zajednice Herceg-Bosne te da je 23. listopada 1993. godine postrojba pod njegovim zapovjedništvom napala i uništila selo Stupni Dol.
ICTY'nin suçlamalarında, Rajiç'in, kendi kendine ilan edilen Bosna-Hersek Hırvat Topluluğunun silahlı kuvvetleri olan Hırvat Savunma Konseyinin (HVO) bir harekat grubuna komuta ettiği ve komutası altındaki silahlı kuvvetlerin 23 Ekim 1993 tarihinde Stupni Dol'a saldırdığı ve yağmaladığı one suruluyor.