Međunarodni kazneni tribunal za bivšu Jugosllaviju (ICTY) optužio ga je u svezi sa sukobom u Bosni i Hercegovini (BiH) 1992-1995 u kojem je oko 200.000 ljudi izgubilo život, dok je dva milijuna izbjeglo.
Eski Yugoslavya Uluslararası Ceza Mahkemesi (ICTY) Karaciç'i yaklaşık 200 bin kişinin ölümü ve iki milyon kişinin iltica etmesiyle sonuçlanan Bosna-Hersek'teki (BH) 1992-1995 ihtilafıyla ilgili olarak suçladı.