Tijekom svjedočenja u rujnu u sudskom procesu dvojici svojih bivših vojnih zapovjednika, Vidoju Blagojeviću i Draganu Jokiću, Nikolić je kazao kako je najviši vojni i politički vrh bosanskih Srba naredio pokolj u Srebrenici. On je zločine doveo u vezu s najtraženijim optuženicima ICTY-a, Radovanom Karadžićem i Ratkom Mladićem.
Eylül ayında iki eski komutanı Vidoje Blagojeviç ve Dragan Jokiç'in duruşmasında verdiği ifadede Nikoliç, Srebrenica katliamı emrinin üst düzey Bosnalı Sırp siyasi ve askeri yönetimi tarafından verildiğini söylemiş, katliamların ICTY'nin aranan zanlılar listesinin başında yer alan Radovan Karadziç ve Ratko Mladiç'le bağlantılı olduğunu açıklamıştı.