Neki smatraju kako bi protokol mogao staviti tužiteljstvo BiH u inferioran položaj, čineći ga -- u stvari -- ogrankom srpskog tužiteljstva.
Bazıları protokolün BH savcılığını alt konuma indirgeyerek onu uygulamada Sırp savcılığının bir şubesi haline getireceğini düşünüyor.