CEI-a surađuje s međunarodnim organizacijama i institucijama kao što su Organizacija za gospodarsku suradnju i razvitak, Vijeće Europe, OESS, Europska banka za obnovu i razvitak i Svjetska banka, i različite regionalne strukture, kao što su Jadransko-jonska inicijativa, Proces dunavske suradnje i Pakt o stabilnosti.
CEI Ekonomik İşbirliği ve Kalkınma Örgütü, Avrupa Konseyi, AGİT, Avrupa Yeniden Yapılanma ve Kalkınma Bankası ve Dünya Bankası gibi uluslararası örgüt ve kurumlar ve Adriyatik-İyon İnisiyatifi, Tuna İşbirliği Süreci ve İstikrar Paktı gibi farklı bölgesel yapılarla işbirliği yapıyor.