Nakon toga, između 1996. i 1998. bila je u Gradskom vijeću Skoplja. Šekerinska je bila parlamentarna zastupnica između 1998. i 2002. godine, a potpredsjednica vlade postala je nakon što je SDSM pobijedio na parlamentarnim izborima 2002. godine.
Bundan sonra, 1996-1998 arasında Üsküp İl Meclisinde yer aldı. 1998-2002 yılları arasında milletvekilliği yaparak SDSM'nin 2002 parlamento seçimlerini kazanması sonrasında başbakan yardımcısı oldu.