U tom svojstvu imao je de jure i de facto zapovjedništvo i nadzor nad svim hrvatskim snagama raspoređenim u sklopu operacije Oluja u južnom dijelu područja Krajine, ustvrdili su tužitelji UN u dopunjenoj optužnici protiv Gotovine, koja je objavljena u ožujku 2004. godine.
BM savcıları Mart 2004'te kamuoyuna açıkladıkları iddianamede Gotovina'yı bu sıfatla Fırtına Operasyonu kapsamında Krajina bölgesinin güney kısmına gönderilen tüm Hırvat kuvvetlerinin meşru ve fiili kumanda ve kontrolünü elinde tuttuğunu öne sürüyorlardı.