Optužen je i za dvije instance genocida vezano uz 43-mjesečnu opsadu Sarajeva i masakr u Srebrenici 1995. godine.
Karadziç ayrıca 43 ay süren Saraybosna kuşatması ve 1995 Srebrenica katliamıyla ilgili olarak iki de soykırım suçlamasıyla karşı karşıya bulunuyor.