U Bosni i Hercegovini, mudžahedinski borci povezani s al-Qaedom priključili su se bosanskoj vojsci u borbi protiv snaga bosanskih Srba.
Bosna-Hersek'te, Kaide ile bağlantılı mücahit savaşçılar Bosnalı Sırp kuvvetlerine karşı savaşta Bosna Ordusu yanında yer aldılar.