Jedini preostali suradnik Slobodana Miloševića koji je zadržao svoju visoku funkciju nakon rušenja s vlasti bivšeg jugoslavenskog čelnika u listopadu 2000. godine, Milutinović se trenutačno nalazi u pritvoru tribunala UN-a za ratne zločine u Haagu gdje čeka početak suđenja zbog navodne umiješanosti u zločine počinjene tijekom sukoba na Kosovu koji je trajao od 1998. do 1999. godine.
Slobodan Miloseviç'in Ekim 2000'de devrilmesinden bu yana eski Yugoslav cumhurbaşkanının yerini dolduracak yandaşlarından sonuncusu olan Milutinoviç, şu anda 1998-1999 yıllarında Kosova'da işlenen zulümlerde rolü olduğu iddialarıyla hakkında açılan davada mahkeme gününü beklemek üzere Lahey'deki BM savaş suçları mahkemesinde tutuklu bulunuyor.