Neki smatraju Ergenekon politički motiviranim slučajem koji AKP podupire u cilju slabljenja sekularista njihovim povezivanjem s ekstremizmom.
Bazı kesimler Ergenekon'u, AKP'nin laikleri aşırılık yanlılığıyla ilişkilendirerek zayıflatmak amacıyla desteklediği siyasi güdümlü bir dava olarak görüyorlar.