Prvi puta je primio korijene na Balkanu tijekom sukoba u Bosni i Hercegovini 1992-1995, dolaskom mudžahedinskih boraca iz muslimanskih zemalja.
Örgüt Balkanlara ilk olarak Bosna-Hersek'teki 1992-1995 ihilafı sırasında, Müslüman ülkelerden gelen mücahit savaşçılarla birlikte geldi.