Branković nije komentirao razloge svoje odluke, ali su koncem ožujka tužitelji pokrenuli istragu protiv njega zbog navodne zloporabe vlasti i pronevjere u svezi sa stjecanjem luksuznog stana u Sarajevu. (Fena, BHRT, Onasa, Dnevni avaz, Pincom, BHRT - 26/05/09)
Brankoviç istifa kararının nedenleri konusunda yorum yapmamakla birlikte, Mart ayı sonlarında savcılar Saraybosna'da lüks bir apartman dairesi satın alınmasıyla ilgili olarak kendisi hakkında görevi kötüye kullanma ve zimmete para geçirme soruşturması başlatmışlardı. (Fena, BHRT, Onasa, Dnevni avaz, Pincom, BHRT - 26/05/09)