Kada je 1998.godine izbio oružani sukob sa Srbijom, Rugova je potisnut od strane pobunjenika iz Oslobodilačke vojske Kosova, dok su ga brojni etnički Albanci smatrali prepasivnim.
1998 yılında Sırbistan ile silahlı çatışmalar patlak verdiğinde, isyancı Kosova Kurtuluş Ordusu Rugova'nın yanında yer alırken pek çok etnik Arnavut da onu fazla pasif buluyordu.