Također je hvaljen za svoju ulogu u postizanju mirovnog sporazuma 2005. godine između separatističkog pokreta Slobodni Aceh i vlade Indonezije kojim je okončan skoro 30-godišnji sukob. Uz to bio je uključen i u korake na okončanju sukoba u Sjevernoj Irskoj.
Ahtisaari, ayrılıkçı Özgür Aceh Hareketi ile Endonezya hükümeti arasındaki yaklaşık 30 yıllık savaşı sona erdiren 2005 barış anlaşmasındaki arabuluculuk rolünden ötürü de övgü aldı.