Se presupune că motivul crimei a fost faptul că Djindjic dorea să trimită la Haga câţiva dintre membrii unităţii de elită Beretele Roşii, după care intenţiona să desfiinţeze unitatea.
Motivi për vrasjen supozohet të ishte se Gjinxhiç donte të dërgonte disa anëtarë të njësisë elite Beretat e Kuqe në Hagë -- pas kësaj ai planifikonte t'a shpërbënte njësinë.