În 1995, ICTY a emis o inculpare comună împotriva lui Karadzic şi fostului său comandant militar, Ratko Mladic, acuzându-i pe aceştia de crime de război pentru presupusele roluri jucate în diversele atrocităţi din timpul războiului din 1992-1995 din Bosnia şi Herţegovina (BiH).
Në 1995, ICTY lëshoi një padi të përbashkët kundër Karaxhiçit dhe komandantit të tij ushtarak, Ratko Mlladiç, duke i akuzuar ata për krime të luftës për rolin e tyre të dyshuar në mizori të ndryshme gjatë luftës në Bosnje e Herzegovinë (BiH), 1992-1995.