TPII l-a inculpat iniţial pe Zupljanin, în vârstă de 56 de ani, în decembrie 1999, învinuindu-l pe fostul comandant al Centrului Regional al Serviciilor de Securitate din Bania Luka pentru crime de război comise împotriva non-sârbilor în timpul conflictului din 1992-1995 din BiH.
ICTY lëshoi padinë e parë kundër Zupljanin, 56 vjeç, në dhjetor 1999, duke e bërë ish komandantin e Qendrës Rajonale të Shërbimeve të Sigurisë në Banja Luka, përgjegjës për krime të luftës që viktimizuan jo-serbët gjatë konfliktit 1992-1995 në BiH.