Scopul misiunii conduse de UE este de a se ingriji de procesul de pace in Macedonia, dar si de a ajuta tara sa isi indeplineasca obligatiile in cadrul Acordului de pace de la Ohrid si sa implementeze reformele economice aflate pe agenda Procesului de Stabilizare si Aderare negociat cu UE.
Qëllimi i misionit të udhëhequr nga BE është nxitja e procesit të paqes në Maqedoni, si dhe të ndihmojë që vendi të përmbushë detyrimet e tij sipas marrëveshjes kornizë të Ohrit më 2001 dhe të zbatojë reformat ekonomike në programin e Procesit të Stabilizimit dhe Shoqërizimit të tij me BE-në.