În 2003, Limaj a fost inculpat de Tribunalul Penal Internaţional pentru fosta Iugoslavie (TPII) pentru crime de război în legătură cu presupusele abuzuri de la alt lagăr de detenţie al KLA, din Lapushnik.
Në vitin 2003, Limaj u padit nga Gjykata Ndërkombëtare për Krime në ish-Jugosllavi me akuza për krime lufte që rrjedhin nga abuzime të dyshuara në një kamp tjetër burgimi të UÇK-së, në Lapushnik.