În timpul atacurilor aeriene ale NATO îndreptate împotriva Iugoslaviei, Djukanovic a declarat că Muntenegrul nu este implicat în conflict -- o poziţie care a adus republicii sprijinul financiar al Uniunii Europene şi Statelor Unite.
Gjatë goditjeve ajrore të NATO-s kundër Jugosllavisë, Gjukanoviç tha se Mali i Zi nuk ishte një palë në konflikt, një qëndrim që i solli republikës mbështetje financiare nga BE dhe Shtetet e Bashkuara.