În timpul războiului Karadzic era Preşedintele Republicii Sârbo-Bosniace şi al Consiliului Naţional de Securitate al acesteia, precum şi comandant suprem al forţelor armate sârbo-bosniace şi liderul Partidului Sârb Democrat.
Gjatë luftës, Karaxhiç ishte president i republikës serbe të Bosnjës dhe i Këshillit Kombëtar të Sigurisë së saj, si dhe komandant suprem i forcave të armatosura serbe të Bosnjës dhe udhëheqës i Partisë Demokratike Serbe.