Înainte de începerea negocierilor legate de aderare, în octombrie 2006, autorităţile turce au semnat un protocol care a extins acordul vamal al acestei ţări cu toate statele membre UE, inclusiv cu Ciprul.
Përpara se të fillonin bisedimet e hyrjes, në tetor të vitit 2006, autoritetet turke nënshkruan një protokoll duke shtrirë marrëveshjen e bashkimit të doganave të vitit 1963 me BE tek të gjithë anëtarët e rinj, duke përfshirë Qipron.