Numit de Slobodan Milosevic, Pavkovic a condus fortele sarbe in campania din 1998-1999 din Kosovo si a detinut postul de sef al armatei pana la sfarsitul lui iunie 2002.
Pavkoviç, i emëruar nga Sllobodan Millosheviç, udhëhoqi forcat serbe gjatë fushatës së viteve 1998-1999 në Kosovë dhe mbajti funksionin e tij si shefi i ushtrisë deri në fund të qershorit 2002.