În cursul mărturiei depuse în luna septembrie în procesul celor doi foşti comandaţi de armată ai săi, Vidoje Blagojevic şi Dragan Jokic, Nikolic a declarat că masacrul de la Srebrenica a fost ordonat de conducerea politică şi militară sârbo-bosniacă.
Gjatë dëshmisë në shtator në gjyqin e dy ish komandantëve të tij, Vidoje Blagojeviç dhe Dragan Jokiç, Nikoliç tha se masakra e Srebrenicës ishte urdhëruar nga krerët serbë boshnjakë të politikës dhe ushtrisë.