În vara anului 2004, TPII l-a inculpat pe Hadzic pentru crime împotriva umanităţii şi încălcarea legilor sau cutumelor de război pentru presupusa sa implicare în persecuţii, exterminare, crimă, închidere în închisoare, tortură, acte inumane, tratament crud, deportare, distrugere voită şi jefuirea proprietăţii publice sau private.
Në verën e 2004-trës, ICTY e akuzoi Haxhiçin për krime kundër njerëzimit dhe shkelje të ligjeve e zakoneve të luftës për përfshirjen e dyshuar të tij në persekutime, shfarosje, vrasje, burgosje, tortura, akte shnjerëzorë, dëbime, shkatërrimin me dashje dhe grabitjen e pronës publike apo private.