EULEX ima jedan lanac zapovijedanja koji vodi do Brusselsa, a radi u okviru Rezolucije 1244 Vijeća sigurnosti UN-a.
EULEX deţine un lanţ de conducere ierarhic unificat, este condusă de la Bruxelles şi îşi desfăşoară activitatea în cadrul Rezoluţiei 1244 a Consiliului de Securitate al ONU.