Skupina Ergenekon navodno je održavala konkakte s drugim terorističkim skupinama, kao što su Marksističko-lenjinistički PKK i islamistički turski Hizbullah.
Ergenekon se presupune că avea legături şi cu alte grupări teroriste, cum ar fi gruparea marxist-leninistă PKK şi gruparea turco-islamistă Hezbollah.