ICTY je prvotnu optužnicu protiv Župljanina, 56, podignuo u prosincu 1999. godine, smatrajući tog bivšeg zapovjednika Regionalnog središta sigurnosne službe u Banja Luci odgovornim za ratne zločine čije su žrtve bili nesrbi, tijekom sukoba u BIH 1992-1995.
TPII l-a inculpat iniţial pe Zupljanin, în vârstă de 56 de ani, în decembrie 1999, învinuindu-l pe fostul comandant al Centrului Regional al Serviciilor de Securitate din Bania Luka pentru crime de război comise împotriva non-sârbilor în timpul conflictului din 1992-1995 din BiH.