Tijekom dva mandata Gligorova na mjestu predsjednika, između 1991. i 1999. godine, Makedonija je postala članica Ujedinjenih naroda pod privremenim nazivom "Bivša Jugoslavenska Republika Makedonija", prihvaćenim Privremenim sporazumom s Grčkom 1995. godine te je pokrenula prijepornu gospodarsku tranziciju.
În timpul celor două mandate ale lui Gligorov în funcţia de preşedinte, între 1991 şi 1999, Macedonia a devenit membră a ONU sub referinţa temporară de "fosta Republică Iugoslavă a Macedoniei", a acceptat Acordul Interimar din 1995 cu Grecia şi a trecut printr-o tranziţie economică controversată.