Kao i njegov vojni zapovjednik iz razdoblja rata Ratko Mladić, Karadžić je nestao nekoliko mjeseci nakon što je 1995. godine Međunarodni kazneni sud za bivšu Jugoslaviju (ICTY) podignuo prve optužnice protiv njih.
Karadzic, împreună cu comandantul său militar din timpul războiului, Ratko Mladic, a dispărut la câteva luni după ce, în 1995, Tribunalul Penal Internaţional pentru Fosta Iugoslavie (ICTY) a emis actele iniţiale de inculpare împotriva acestora.