Motiv za ubojstvo je navodno bio taj što je Đinđić htio poslati više članova elitne postrojbe Crvene beretke u Haag, nakon čega je planirao rasformirati postrojbu.
Se presupune că motivul crimei a fost faptul că Djindjic dorea să trimită la Haga câţiva dintre membrii unităţii de elită Beretele Roşii, după care intenţiona să desfiinţeze unitatea.