Tužitelji UN-a podignuli su 2001. godine optužnicu protiv njega tereteći ga za navodnu ulogu u zločinima počinjenim 1995. godine tijekom ofenzive Hrvatske vojske protiv srpskih separatista u području Krajine.
Procurorii ONU l-au inculpat pe Gotovina în 2001 în legătură cu presupusul rol jucat în atrocităţile comise în timpul ofensivei Armatei Croate din anul 1995 împotriva separatiştilor sârbi din zona Krajina.