CEI-a surađuje s međunarodnim organizacijama i institucijama kao što su Organizacija za gospodarsku suradnju i razvitak, Vijeće Europe, OESS, Europska banka za obnovu i razvitak i Svjetska banka, i različite regionalne strukture, kao što su Jadransko-jonska inicijativa, Proces dunavske suradnje i Pakt o stabilnosti.
CEI cooperează cu organizaţii şi instituţii internaţionale, precum Organizaţia pentru Cooperare şi Dezvoltare Economică, Consiliul Europei, OSCE, Banca Europeană pentru Reconstrucţie şi Dezvoltare şi Banca Mondială, şi cu diferite structuri regionale, precum Iniţiativa Adriatică-Ionică, Procesul de Cooperare Dunăreană şi Pactul de Stabilitate.