Kada je sjedište uspostavljeno 2004. godine, to je podrazumijevalo supredsjedanje Povjerenstvom za obrambene reforme za ukidanje entitetskih vojski, ustroj jedinstvenih državnih oružanih snaga pod demokratskim civilnim nadzorom i kreiranje vojne strukuture koja ispunjava realne potrebe i sposobnosti BiH.
În 2004, când a fost înfiinţat Cartierul General, acest lucru a însemnat co-prezidarea Comisiei pentru Reforma Apărării pentru eliminarea armatelor entităţilor, creându-se forţele armate ale unui singur stat, aflate sub control civil democratic, precum şi crearea unei structuri militare care a întrunit cerinţele şi capacităţile realiste ale BiH.