Župljanin je, tvrde tužitelji UN-a, sudjelovao u zajedničkom kriminalnom pothvatu čiji je cilj bio "eliminiranje i trajno uklanjanje, silom ili drugim sredstvima, bosanskih Muslimana i bosanskih Hrvata s teritorija" samoproglašene Autonomne oblasti Bosanska Krajina.
Potrivit procurilor ONU, Zupljanin a participat la o acţiune criminală comună al cărei obiectiv a fost "eliminarea şi mutarea permanentă a musulmanilor bosniaci şi a croaţilor bosniaci, cu forţa sau prin alte mijloace, de pe teritoriul" Regiunii Autonome autoproclamate Krajina.