Neki smatraju da je Ergenekon politički motiviran slučaj koji AKP podržava u cilju slabljenja sekularista, njihovim povezivanjem za ekstremizam.
Neki smatraju da je slučaj Ergenekon politički motivisano suđenje u režiji AKP, sa ciljem slabljenja socijalista, koje su tako povezali sa ekstremizmom.