EU NAVFOR operira pod mandatom UN-a, a njegovi konkretni zadaci su između ostalih zaštita brodova Svjetskog programa hrane, kao i trgovačkih brodova koji plove u blizini somalijske obale.
Konkretni zadaci misije EU NAVFOR koja deluje pod mandatom UN-a uključuju zaštitu brodova Svetskog programa hrane, kao i trgovačkih brodova koji prolaze pored somalijske obale.