U martu 1996, Tuđman, koji je u to vrijeme bio predsjednik Hrvatske, imenovao je Gotovinu za šefa inspektorata Hrvatske vojske Gotovinu je 29. septembra 2000. smijenio Mesić, koji je pobijedio na predsjedničkim izborima u Hrvatskoj u februaru te godine.
U martu 1996. godine Tuđman, koji je u to vreme bio predsednik Hrvatske, postavio je Gotovinu za šefa Inspektorata Hrvatske vojske. Gotovinu je razrešio dužnosti Stipe Mesić 29. septembra 2000, koji je pobedio na predsedničkim izborima u Hrvatskoj u februaru te godine.