Kada je 2004. godine ovaj štab prvobitno uspostavljen, to je značilo supredsjedavanje Komisijom za reformu odbrane u cilju ukidanja entitetskih vojski, stvaranje jedinstvenih oružanih snaga na nivou države pod demokratskim civilnim nadzorom, te projektiranje vojne strukture koja je ispunjavala realne potrebe i kapacitete BiH.
Kada je ovo sedište uspostavljeno 2004. godine, to je podrazumevalo kopredsedavanje Komisijom za odbrambene reforme, kako bi se ukinule entitetske vojske, stvorile jedinstvene oružane snage pod demokratskim civilnim nadzorom i napravila vojna struktura koja odgovara realnim potrebama i mogućnostima BiH.