Ministarstvo vanjskih poslova također je oformilo poseban sektor za dokumentiranje i podršku nacionalnim manjinama u Makedoniji kod međunarodnih institucija i putem sporazumima o bilateralnoj zaštiti nacionalnih manjina.
Ministarstvo inostranih poslova takođe je osnovalo posebno odeljenje za dokumentovanje i podršku makedonskim nacionalnim manjinama, u međunarodnim institucijama i kroz bilateralne sporazume o zaštiti nacionalnih manjina.