Zemlje jugoistočne Evrope naslijedile su mnoge strukturalne probleme na terenu, uključujući u velikoj mjeri zastarjelu istraživačku i tehnološku infrastrukturu i ogromnu industrijsku potražnju za primijenjenim istraživanjima, uz malu potrošnju na istraživanja i razvoj od strane preduzeća, odliv mozgova, iscjepkanost istraživačkog sistema i nepovezanost između industrijskog i istraživačkog sektora.
Güneydoğu Avrupa ülkeleri, büyük oranda modası geçmiş araştırma ve teknoloji altyapısı ve uygulamalı bilimlere yönelik sektörel talep kıtlığının yanı sıra işletmelerin araştırma ve geliştirmeye düşük kaynak ayırmaları, beyin göçü, araştırma sisteminin parçalanması ve sanayi ile araştırma sektörleri arasında bağlantı eksikliği de dahil olmak üzere bu alanda bir çok yapısal sorun devraldılar.