Turska je također frustrirana zbog toga što je isključena iz komandnih i kontrolnih struktura u operacijama pod vodstvom EU koje se odvijaju u okviru saradnje između NATO-a i EU, iako je sama dala značajan doprinos.
Türkiye, yaptığı bunca önemli katkıya rağmen NATO-AB işbirliği çerçevesinde gerçekleştirilen AB liderliğindeki operasyonlarda komuta ve kontrol yapılarından dışlanmasına da kızdı.