U ranijim izvještajima o Ergenekonu se navodilo da je on povezan s ubistvom tursko-jermenskog novinara Hranta Dinka, iako to nije izneseno u optužnici.
Basında Ergenekon hakkında çıkan ilk haberlerde, oluşumun Türk-Ermeni gazeteci Hrant Dink cinayetiyle ilgisi olduğu da iddia edilse de, iddianamede böyle bir şeye yer verilmedi.