Međutim, islamistički korijeni AKP-a potpiruju sumnju među moćnom vojskom u zemlji, koja sebe smatra garantom sekularnog poretka u Turskoj, iako su Erdogan i drugi stranački lideri opetovano tvrdili da nemaju nikakvog skrivenog vjerskog dnevnog reda.
Ancak Erdoğan ve diğer parti yöneticilerinin gizli bir gündeme sahip olmadıklarını sürekli olarak belirtmelerine karşın, AKP'nin İslamcı kökleri kendisini Türkiye'de laik düzenin bekçisi olarak gören güçlü ordu içinde şüphelere yol açtı.