Međutim, Gligorov je također izazvao ljutnju u svojoj zemlji 1994. godine, kad je za grčke medije izjavio da su Makedonci slavenski narod, koji je na Balkan došao u 6. stoljeću, te da nemaju nikakve veze s Aleksandrom Velikim i njegovom civilizacijom.
Fakat Gligorov, 1984 yılında Yunan medyasına verdiği bir demeçte Makedonların 6. yüzyılda Balkanlar'a gelmiş bir Slav halkı olduğunu ve Büyük İskender ve onun medeniyetiyle hiçbir bağlantısı olmadığını söyleyerek ülkesinde öfkeye de neden olmuştu.