Zawahiri je rođen u istaknutoj porodici više srednje klase u Kairu, gdje je školovan za očnog hirurga. Krajem 1970-tih, on je postao jedan od osnivača Egipatskog islamskog džihada (EIJ), organizacije koja se protivila sekularnom režimu u zemlji i išla na njegovo zbacivanje nasilnim sredstvima.
Zevahiri, üst-orta sınıftan tanınmış bir ailenin oğlu olarak Kahire'de dünyaya geldi ve burada göz cerrahisi üzerinde eğitim gördü. 1970'lerin sonunda, ülkedeki laik rejime karşı çıkan ve bunu şiddet yoluyla devirmeye çalışan Mısırlı İslami Cihad (MİC) örgütünün kurucularından birisi oldu.