Kada je 2004. godine ovaj štab prvobitno uspostavljen, to je značilo supredsjedavanje Komisijom za reformu odbrane u cilju ukidanja entitetskih vojski, stvaranje jedinstvenih oružanih snaga na nivou države pod demokratskim civilnim nadzorom, te projektiranje vojne strukture koja je ispunjavala realne potrebe i kapacitete BiH.
Kada je sjedište uspostavljeno 2004. godine, to je podrazumijevalo supredsjedanje Povjerenstvom za obrambene reforme za ukidanje entitetskih vojski, ustroj jedinstvenih državnih oružanih snaga pod demokratskim civilnim nadzorom i kreiranje vojne strukuture koja ispunjava realne potrebe i sposobnosti BiH.