Prema zajedničkoj optužnici, on i još dva bivša generala -- Ante Gotovina i Ivan Čermak -- optuženi su za odgovornost za niz zločina, među kojima je ubistvo najmanje 150 Srba tokom operacije Oluja hrvatskih snaga iz augusta 1995, kojom je ponovo uspostavljena kontrola nad regionom Krajine.
Zajednička optužnica tereti Markača i još dvojicu bivših generala -- Antu Gotovinu i Ivana Čermaka -- za odgovornost za ratne zločine, koji uključuju i ubojstvo najmanje 150 Srba tijekom operacije Oluja u kolovozu 1995. godine tijekom koje su hrvatske snage povratile nadzor nad regijom Krajina.