Ωστόσο, οι Ισλαμικές ρίζες του ΑΚΡ έχουν πυροδοτήσει υποψίες στον ισχυρό στρατό της χώρας, ο οποίος θεωρεί πως ρόλος του είναι η εξασφάλιση της κοσμικής τάξης στην Τουρκία, αν και ο Ερντογάν, καθώς και άλλα κομματικά στελέχη, έχουν επανειλημμένως δηλώσει ότι δεν διαθέτουν μυστική θρησκευτική ατζέντα.
Originile islamiste ale AKP au alimentat însă suspiciuni în rândul armatei puternice a ţării, care se consideră garantul ordinii constituţionale în Turcia, deşi Erdogan şi ceilalţi lideri ai partidului au insistat în mod repetat că nu au obiective religioase secrete.