Οι δυο χώρες διαφωνούν επίσης για τα χωρικά ύδατα στον Κόλπο Πιράν, καθώς επίσης αρκετά άλλα ζητήματα όπως τα μειονοτικά δικαιώματα και τα χρέη που οφείλονται σε Κροάτες πελάτες της Τράπεζας Λιουμπλιάνα.
Acestea sunt de asemenea în dezacord în privinţa graniţei maritime din Golful Piran, precum şi în privinţa unei serii de alte chestiuni precum drepturile minorităţilor şi datoriile băncii Ljubjlana faţă de clienţii croaţi.