Το λιμενικό σώμα είναι οργανωμένο σε δύο σκέλη, το πολιτικό σκέλος το οποίο ελέγχεται από τον υπουργό εσωτερικών και το στρατιωτικό σκέλος το οποίο αποτελεί τμήμα του υπουργείου άμυνας – αυτά τα δύο θα συγχωνευτούν.
Paza de Coastă funcţionează prin două ramuri, o formaţiune civilă coordonată de Ministerul de Interne, şi una militară aflată sub controlul Ministerului Apărării – care urmează să fuzioneze.