Ο Κάραζιτς, μαζί με τον στρατιωτικό διοικητή του εν καιρώ πολέμου, Ράτκο Μλάντιτς, εξαφανίστηκαν αρκετούς μήνες μετά την έκδοση αρχικού κατηγορητηρίου εναντίον τους το 1995 από το Διεθνές Ποινικό Δικαστήριο για την πρώην Γιουγκοσλαβία.
Karadzic, împreună cu comandantul său militar din timpul războiului, Ratko Mladic, a dispărut la câteva luni după ce, în 1995, Tribunalul Penal Internaţional pentru Fosta Iugoslavie (ICTY) a emis actele iniţiale de inculpare împotriva acestora.