Mudžahedinsko je pitanje u BiH vrlo osjetljivo, budući da je nakon napada na Sjedinjene Države 11. rujna 2001. prisutan pojačan strah kako bi neki od ovih ljudi koji su ostali u BiH nakon rata mogli biti povezani s terorističkim grupama.
Темата за муџахедините е многу деликатна во БиХ, со оглед на зголемените стравувања, по терористичките напади на Соединетите Американски Држави од 11-ти септември 2001-та година, дека некои од луѓето кои останаа во БиХ по војната би можеле да се инволвирани во терористички групи.