Drugo područje na kojemu su već iskrsle poteškoće tijekom postupka screeninga harmonizacija je hrvatskog carinskog režima s acquis communitaireom.
Друга сфера каде веќе се појавија проблеми за време на процесот на тестирање е усогласувањето на царинскиот режим на Хрватска со acquis communitaire.