Tijekom dva mandata Gligorova na mjestu predsjednika, između 1991. i 1999. godine, Makedonija je postala članica Ujedinjenih naroda pod privremenim nazivom "Bivša Jugoslavenska Republika Makedonija", prihvaćenim Privremenim sporazumom s Grčkom 1995. godine te je pokrenula prijepornu gospodarsku tranziciju.
За време на двата мандати на Глигоров како претседател, меѓу 1991 и 1999 година, Македонија стана членка на ОН, под привремената референца „поранешна југословенска република Македонија“, ја прифати Привремената спогодба од 1995 година со Грција и помина низ контроверзна економска транзиција.