Mesićevi su odnosi s hijerarhijom katoličke crkve stalno su bili zategnuti, budući da je kritizirao njihovo uplitanje u politiku, a oni su njega kritizirali tvrdeći kako ne štiti nacionalne interese.
Односите на Месиќ со хиерархијата на Католичката Црква беа под постојани тензии, бидејќи тој ја критикуваше нивната инволвираност во политиката, а тие го критикуваа него тврдејќи дека не ги штити националните интереси.