Neki smatraju kako bi protokol mogao staviti tužiteljstvo BiH u inferioran položaj, čineći ga -- u stvari -- ogrankom srpskog tužiteljstva.
Некои сметаат дека протоколот може да ги стави обвинителите на БиХ во подредена позиција, правејќи ги -- всушност -- огранок на српското обвинителство.