Zajedno s potpukovnikom Draganom Jokićem, Blagojević se suočava s optužbama za sudionistvo u genocidu, zločine protiv čovječnosti i kršenje zakona i običaja rata.
Заедно со потполковник Драган Џокиќ, Благојевиќ е обвинет за соучество во вршеое геноцид, злосторства против човештвото и прекршуваое на законите и обичаите при водеое војна.