Споровете по редица въпроси, включително определянето на националното въздушно пространство и на границите на териториалните води в Егейско море, както и разделеният остров Кипър, са някои от проблемите, по които има най-големи разногласия.
Несогласувањето за серија прашања, вклучително и ограничувањето на националниот воздушен простор и одбележувањето на територијалните води во Егејското Море, како и поделениот остров Кипар, се меѓу најспорните прашања.