Всъщност често са възниквали противоречия по отношение на специфичните мерки, целящи осъществяването на Лисабонския дневен ред и голяма част от отговорностите остават в ръцете на националните правителства.
Контраверзиите често се јавуваа во поглед на конкретни мерки со цел на спроведување на Лисабонскиот план, а доста од тоа останува во рацете на националните влади на европските земји.