Въпреки общо взето добрите отношения между Сърбия и Македония, двете страни продължават да бъдат обременени от непризнаването на Македонската православна църква от Сръбската православна църква.
И покрај добрите севкупни односи меѓу Србија и Македонија, двете земји се сé уште оптоварени со непризнавањето на Македонската православна црква од страна на Српската православна црква.