Граничният спор, който продължава, откакто двете страни обявиха независимост от бивша Югославия през 1991 г., периодично влияе върху отношенията между Загреб и Любляна.
Долготрајниот пограничен спор откако двете земји прогласија независност од поранешна Југославија во 1991 година одвреме навреме ги нарушуваше врските помеѓу Загреб и Љубљана.