Назначен на длъжността от Слободан Милошевич, Павкович командваше сръбските въоръжени сили в периода 1998-1999 г., по време на конфликта в Косово и остана на поста до края на юни 2000 г.
Наименуван од Слободан Милошевиќ, Павковиќ ги предводеше српските сили за време на кампаоата на Косово во 1998-1999 година и го задржа своето место началник на Генералштабот сé до крајот на јуни 2002 година.