Войските бяха под юрисдикцията на двете предимно етнически автономни области на БиХ - Република Сръбска и мюсюлманско-хърватската федерация.
Војниците се под надлежност на двата големи етнички ентитети кои ја сочинуваат БиХ -- Република Српска и муслиманско-хрватската Федерација.