Въпреки всичко някои НПО, в т. ч. семейства на изчезналите, разглеждат създаването на института за изчезналите лица като продължение на политиката на БиХ, основана на разпределение на етнически принцип.
Сепак, некои невладини организации, вклучувајќи ги и семејствата на исчезнатите, гледаат на формирањето на единствениот институт за исчезнати лица како на проширување на етничката политика на БиХ.