Караджич и неговият военновременен военачалник, Ратко Младич, изчезнаха няколко месеца, след като Международният наказателен съд за бивша Югославия (МНСБЮ) издаде през 1995 г. първоначалните си обвинителни актове срещу тях.
Караџиќ, заедно со неговиот воен командант Ратко Младиќ исчезнаа неколку месеци откако Меѓународниот кривичен трибунал за поранешна Југославија (МКТЈ) ги издаде првичните обвиненија против нив во 1995 година.