Много политически анализатори и наблюдатели обаче смятат, че основната причина за освобождаването на Трайков е била неговата съпротива срещу изпадналия в застой проект за атомна електроцентрала (АЕЦ) "Белене" с Русия.
Но, многу политички аналитичари и набљудувачи сметаат дека главната причина за смената на Трајков е неговото противење на заглавениот проект за нуклеарната електрична централа (НЕЦ) Белене со Русија.