Същевременно двете автономни области – Република Сръбска и Федерация Босна и Херцеговина – имат собствени дирекции за гражданска авиация в очевидно нарушение на конституцията на БиХ.
Во меѓувреме, двата ентитета на земјата -- Република Српска и Федерацијата на Босна и Херцеговина -- оперираат со свои сопствени директорати за цивилна авијациска навигација, што е очигледно спротивно на Уставот на БиХ.