Най-спорната сред предлаганите реформи касае промени в структурата на Съвета за национална сигурност (СНС), съвместен правителствено-военен орган за вземане на решения.
Најконтроверзната од предложените реформи вклучува промени во структурата на Националниот совет за безбедност (МГК), заедничко владино-воено тело кое донесува одлуки.