Прилагането на Конвенцията от Букурещ, включително три специфични протокола за контрола на наземните източници на замърсяване, изхвърлянето на отпадъци и съвместните действия в случай на инциденти (като разлив на нефт), се координира от Черноморска комисия, чийто секретариат се намира в Истанбул.
Имплементацијата на Букурешката конвенција, вклучувајќи ги и трите посебни протоколи за контрола на земните извори на загадување, фрлање на отпад, и заедничко дејствување во случај на несреќи (како нафтените дамки) се координирани од страна на Комисијата за Црното Море, чиј секретаријат се наоѓа во Истанбул.