Провеждането на разследването срещу "Ергенекон", при което някои заподозрени бяха задържани без наличие на достатъчно доказателства, както и продължителния им престой в затвора преди процеса, бяха широко критикувани от светските и националистическите медии.
Sprovođenje istrage Ergenekona, koja je uključivala i pritvaranje osumnjičenih pre predstavljanja bilo kakvih jasnih dokaza i dugo držanje u zatvoru pre suđenja, naišla je na velike kritike sekularnih i nacionalističkih medija.