По време на въздушните нападения на НАТО над Югославия Джуканович заяви, че Черна гора не участва в конфликта -- позиция, която донесе на републиката финансова подкрепа от ЕС и Съединените щати.
Tokom NATO bombardovanja Jugoslavije, Đukanović je izjavljivao da Crna Gora nije strana u sukobu, što je stav koji je njegovoj republici doneo finansijsku podršku EU i Sjedinjenih Država.