Бреговата охрана функционира чрез две подразделения, гражданско звено под контрола на вътрешно министерство и военно звено, което е част от министерството на отбраната, които ще се слеят.
Obalska straža radi u dva ogranka -- civilni deo kojim upravlja ministarstvo unutrašnjih poslova i vojni deo u okviru ministarstva odbrane -- koji će biti spojeni.