The conduct of the Ergenekon probe, which included detention of suspects before presentation of any clear evidence and their prolonged jailing before trial, received widespread criticism from secular and nationalist media.
Provedba istrage Ergenekona, koja je uključivala i pritvaranje osumnjičenika prije predstavljanja bilo kakvih jasnih dokaza i dugo držanje u zatvoru prije suđenja, naišla je na velike kritike sekularnih i nacionalističkih medija.