Entitetska ministarstva zadržat će samo administrativni lanac zapovijedanja u svezi s vojačenjem i logistikom, dok će operativni lanac zapovijedanja biti uspostavljen kroz združeni glavni stožer i podređeno operativno zapovjedništvo.
Entitetska ministarstva odbrane zadržaće samo administrativni lanac komande za regrutaciju i u logističke svrhe, dok će operativni lanac komandovanja biti uspostavljan kroz združeni generalštab i podređenu operativnu komandu.