Moćna i sasvim sekularna vojska Turske, koja je bila sumnjičava prema islamističkim temeljima AKP-a od njihovog dolaska na vlast 2003., porekla je svaku povezanost s Ergenekonom i surađuje u istrazi.
Moćna i izrazito sekularna turska vojska, koja ima rezerve prema islamistički nastrojenoj AKP od kako je preuzela vlast 2003, negira svaku vezu sa Ergenekonom i sarađuje u istrazi.