Bit će uspostavljen jedinstven zapovjedni lanac, koji će ići od Predsjedništva BiH, preko ministra obrane, do načelnika glavnog stožera, zatim zapovjednika operativnog zapovjedništva i zapovjednika zapovjedništva za potporu, i preko njih do podređenih struktura.
Biće uspostavljen jedinstveni lanac komande, koji će ići od Predsedništva BiH, preko ministra odbrane, do načelnika generalštaba, zatim komandanta operativne komande i komandanta komande za podršku, i preko njih do podređenih elemenata.