Ono što predstavlja potencijalnu prijetnju sigurnosti u Makedoniji disproporcionalne su prijetnje u vidu mogućih unutarnjih ekstremističko nacionalističkih ispada, rasne i vjerske netrpeljivosti, te aktivnosti vezanih uz međunarodni terorizam, organizirani kriminal i ilegalnu trgovinu drogom, oružjem i ljudima.
Ono što bi moglo da ugrozi makedonsku bezbednost jesu asimetrične pretnje, koje bi mogle da se manifestuju kroz ekstremni nacionalizam na unutrašnjem planu, rasnu i versku netrpeljivost i aktivnosti povezane sa međunarodnim terorizmom, organizovanim kriminalom i trgovinom drogom, oružjem i ljudima.