U izmijenjenoj optužnici iz travnja 2001. godine Janković je optužen za osobnu i zapovjednu kaznenu odgovornost po sedam točaka za zločine protiv čovječnosti i sedam točaka za kršenje pravila i običaja rata, uključujući zlostavljanje i silovanje.
U izmenjenoj optužnici iz aprila 2001. godine Janković je optužen za individualnu i komandnu krivičnu odgovornost po sedam tačaka koje ga terete za zločine protiv čovečnosti i sedam tačaka za kršenje pravila i običaja ratovanja, uključujući mučenja i silovanja.