Reforma obrane predviđa ukidanje ministarstava obrane i vojnih zapovjedništava RS i FBiH od 1. siječnja 2006. godine i prebacivanje njihovih ovlasti na ministarstvo obrane BiH i glavno zapovjedništvo, koje je uspostavljeno prošle godine.
Reformom odbrane predviđeno je ukidanje ministarstava odbrane i vojnih komandi RS i FBiH od 1. januara 2006. godine i prebacivanje njihovih ovlašćenja na ministarstvo odbrane BiH i glavnu komandu, koja je uspostavljena prošle godine.