Tužitelji UN-a podignuli su 2001. godine optužnicu protiv njega tereteći ga za navodnu ulogu u zločinima počinjenim 1995. godine tijekom ofenzive Hrvatske vojske protiv srpskih separatista u području Krajine.
Tužioci tribunala podigli su optužnicu protiv Gotovine 2001. godine, tereteći ga za njegovu navodnu ulogu u zločinima počinjenim tokom ofanzive Hrvatske vojske 1995. protiv srpskih separatista u oblasti Krajine.