Protiv Kovačevića i još trojice časnika -- generala Jugoslavenske armije Pavla Strugara, umirovljenog viceadmirala Miodraga Jokića i mornaričkog viceadmirala Miodraga Zeca -- je podignuta optužnica 2001. godine zbog ubojstva civila i štete nanesene povijesnom gradu.
Protiv Kovačevića je 2001. godine podignuta optužnica zajedno sa još tri oficira -- generalom jugoslovenske armije Pavlom Strugarom, penzionisanim viceadmiralom Miodragom Jokićem i mornaričkim viceadmiralom Miodragom Zecom -- zbog ubistva civila i štete nanete istorijskom gradu.