Εισαγγελείς αναφέρουν ότι η Εργκένεκον διαθέτει εκτεταμένο πυρήνα, ο οποίος περιλαμβάνει από προσωπικότητες των ΜΜΕ μέχρι δολοφόνους, ωστόσο δεν έχουν επαφή μεταξύ τους και λαμβάνουν οδηγίες από την ηγεσία.
Tužioci kažu da Ergenekon ima rasprostranjene ćelije, uključujući medijske ličnosti i plaćene ubice, ali da te ćelije nemaju kontakt jedne sa drugima i dobijaju instrukcije sa vrha.