Τα υπουργεία Άμυνας της οντότητας θα διατηρήσουν μόνο μια διοικητική ιεραρχία για λόγους στρατολόγησης και διοικητικής μέριμνας, ενώ η λειτουργική ιεραρχία θα ιδρυθεί μέσω του κοινού προσωπικού και την υπαγόμενη λειτουργική διοίκηση.
Entitetska ministarstva odbrane zadržaće samo administrativni lanac komande za regrutaciju i u logističke svrhe, dok će operativni lanac komandovanja biti uspostavljan kroz združeni generalštab i podređenu operativnu komandu.