Οι χώρες της Νοτιοανατολικής Ευρώπης κληρονόμησαν πολλά διαρθρωτικά προβλήματα στον τομέα, συμπεριλαμβανομένης μιας γενικά απαρχαιωμένης υποδομής ερευνών και τεχνολογίας και το θάνατο της βιομηχανικής ζήτησης για εφαρμοσμένες έρευνες, σε συνδυασμό με τις χαμηλές δαπάνες για έρευνα και ανάπτυξη από επιχειρήσεις, τη φυγή εγκεφάλων, τον κατακερματισμό του ερευνητικού συστήματος και την έλλειψη συσχετισμού μεταξύ του κλάδου βιομηχανίας και του κλάδου ερευνών.
Zemlje jugoistočne Evrope nasledile su mnoge strukturne probleme na tom polju, uključujući u velikoj meri zastarelu istraživačku i tehnološku infrastrukturu i oskudicu industrijskih potreba za primenjenim istraživanjima, kombinovanu sa malim finansijskim ulaganjima kompanija u istraživanje i razvoj, odlivom mozgova, rascepkanošću istraživačkog sistema i nedostatkom povezanosti industrijskog i istraživačkog sektora.