Ο Κάραζιτς, μαζί με το στρατιωτικό διοικητή του Ράτκο Μλάντιτς, καταζητούνται από το Διεθνές Ποινικό Δικαστήριο για την πρώην Γιουγκοσλαβία (ICTY).
Karadžić je, zajedno sa svojim vojnim komandantom Ratkom Mladićem, optužen od strane Međunarodnog krivičnog suda za bivšu Jugoslaviju (MKSJ).