Ο Γκοτόβινα κρύβεται από τον Ιούνιο του 2001, λίγες εβδομάδες από τη στιγμή που του ασκήθηκαν κατηγορίες από το ICTY για το φερόμενο ρόλο του σε εγκλήματα πολέμου τα οποία διαπράχθηκαν από στρατεύματα της διοίκησή τους το 1995, συμπεριλαμβανομένης της δολοφονίας τουλάχιστον 150 Σέρβων της Κράινα.
Gotovina je u bekstvu od juna 2001, nekoliko nedelja nakon što je MKSJ podigao optužnicu protiv njega zbog uloge koju je navodno imao u ratnim zločinima koje su 1995. godine počinile trupe pod njegovom komandom, uključujući ubistvo najmanje 150 krajiških Srba.