Η υλοποίηση της Σύμβασης του Βουκουρεστίου, περιλαμβανομένων και των τριών πρωτοκόλλων για τον έλεγχο της μόλυνσης από χερσαίες πηγές, την απόρριψη αποβλήτων και την κοινή δράση σε περίπτωση τυχαίων συμβάντων (όπως πετρελαιοκηλίδες) συντονίζεται από την Επιτροπή της Μαύρης Θαλάσσης, η γραμματεία της οποίας εδρεύει στην Ιστανμπούλ.
Sprovođenjem Bukureške konvencije, kao i trima posebnim protokolima o kontroli zagađenja sa kopna, bacanju otpada i zajedničkog delovanja u slučaju nesreća (poput izlivanja nafte) koordinira Crnomorska komisija, čiji sekretarijat ima sedište u Istanbulu.