Ταυτόχρονα με τις προσπάθειές της για ένταξη στο ΝΑΤΟ, η πΓΔΜ έχει σημειώσει πρόοδο και στην προσπάθειά της για ένταξη στην ΕΕ, εφαρμόζοντας σειρά μεταρρυθμίσεων οι οποίες αποσκοπούν στον εναρμονισμό της νομοθεσίας της με αυτή της Ένωσης.
Zajedno sa naporima usmerenim na članstvo u NATO-u, Makedonija je ostvarila napredak i u svojim nastojanjima za pridruživanje EU, sprovodeći niz reformi koje imaju za cilj harmonizaciju zakonodavstva sa standardima Unije.