Διορισθείς από το Σλόμπονταν Μιλόσεβιτς, ο Πάβκοβιτς ηγήθηκε των σερβικών δυνάμεων κατά τη διάρκεια των επιχειρήσεων την περίοδο 1998-1999 στο Κοσσυφοπέδιο και διατήρησε τη θέση του ως αρχηγός του στρατού έως τα τέλη Ιουλίου του 2002.
Pavković, koga je na taj položaj imenovao Slobodan Milošević, bio je na čelu srpskih snaga za vreme kampanje na Kosovu 1998-1999. godine i ostao načelnik do kraja juna 2002. godine.