Το ICTY διώκει ήδη τον πρώτο διοικητή του 3ου Σώματος ARBiH, Στρατηγό Ενβέρ Χαντζηχασάνοβιτς, και τον διοικητή της 7ης Μουσουλμανικής Ταξιαρχίας, Αμρί Κουμπούρα, για εγκλήματα που διεπράχθησαν από τους Ελ-Μουτζαχίντ.
Pred Haškim sudom već je u toku suđenje prvom komandantu Trećeg korpusa ARBiH, generalu Enveru Hadžihasanoviću i komandantu Sedme muslimanske brigade Amiru Kuburi, za zločine koje su počini islamisti iz El-Mudžahida.