Ο Κάρατζιτς, ο οποίος ασκούσε τυπική και ουσιαστική εξουσία και έλεγχο στις δυνάμεις των βοσνιοσέρβων και το ΣΔΚ και τις κυβερνητικές αρχές, προσάγεται σε δίκη σε σχέση με το θάνατο, τον Ιούλιο 1995, μέχρι 8.000 βοσνιομουσουλμάνων ανδρών και αγοριών που συνελήφθησαν σε διαφορετικές τοποθεσίες εντός και γύρω από την χαρακτηρισθείσα από τα ΗΕ «ασφαλή περιοχή» της Σρεμπρένιτσα.
Karadžić, koji je obavljao i formalnu i de facto nadležnost i kontrolu nad snagama bosanskih Srba i svim službama SDS-a i vlade, takođe je optužen u vezi sa ubistvom oko 8.000 muškaraca i dečaka, bosanskih Muslimana, u julu 1995, zarobljenih na nekoliko različitih lokacija u "zaštićenoj zoni" UN-a, Srebrenici i njenoj okolini.