Θα καθιερωθεί ενιαία ιεραρχία, η οποία θα περνά από την προεδρία της Β-Ε στο υπουργείο Άμυνας, στον αρχηγό ΓΕΣ, στο διοικητή της επιχειρησιακής διοίκησης και στο διοικητή της διοίκησης στήριξης, και μέσω αυτών στα κατώτερα κλιμάκια.
Biće uspostavljen jedinstveni lanac komande, koji će ići od Predsedništva BiH, preko ministra odbrane, do načelnika generalštaba, zatim komandanta operativne komande i komandanta komande za podršku, i preko njih do podređenih elemenata.