Οι επικριτές της Εργκένεκον ισχυρίζονται ότι ο στρατός δεν σχεδίαζε να κάνει πραξικόπημα και ότι η Εργκένεκον δεν είναι τίποτα άλλο από μια επινοημένη από το ΚΔΑ συνωμοσία προκειμένου να καταδυναστεύσει και "φιμώσει" την αντιπολίτευση.
Kritičari sudskih procesa tvrde da vojska nije planirala da izvrši puč i da je Ergenekon samo izmišljena zavera pomoću koje AKP namerava da potlači i ućutka opoziciju.