Παρότι η Κροατία είχε αναγνωριστεί επίσημα ως υποψήφια προς ένταξη χώρα, οι ενταξιακές της διαπραγματεύσεις είχαν εκτροχιαστεί για μήνες λόγω της συνεχόμενης φυγοδικίας του, παρά το γεγονός ότι η κροατική κυβέρνηση ισχυριζόταν ότι έκανε ότι μπορούσε για να τον βρει.
Uprkos tome što je zvanično dobila status kandidata, pregovori o članstvu odloženi su na nekoliko meseci zbog nehapšenja Gotovine, iako je Zagreb sve vreme insistirao da radi sve što je u njegovoj moći da ga pronađe.