Η συμφωνία DANUBE FAB διευθετεί τη δομή διακυβέρνησης του προγράμματος, καθορίζοντας τους ρόλους και τις ευθύνες όλων των εμπλεκομένων, συμπεριλαμβανομένων των Αρχών υπηρεσιών εναέριας κυκλοφορίας των δυο χωρών, της Βουλγαρικής BULATSA και της Ρουμανικής ROMATSA, του στρατού και των ρυθμιστικών Αρχών.
Sporazumom DUNAV FAB uređuje se upravna struktura projekta, uz preciziranje uloga i odgovornosti svih učesnika, uključujući agencije te dve zemlje za usluge iz oblasti vazdušnog saobraćaja, bugarsku BULATSU i rumunsku ROMATSU, te vojsku i regulatore.