Επίσης αντιμετωπίζει δυο κατηγορίες γενοκτονίας σχετικά με την πολιορκία του Σεράγεβο, διάρκειας 43 μηνών, και τη σφαγή της Σρεμπρένιτσα το 1995 η οποία στοίχισε τη ζωή 8.000 Βόσνιων Μουσουλμάνων ανδρών και αγοριών.
Protiv Karadžića je takođe podneta optužnica po dve tačke za genocid u vezi sa 43-mesečnom opsadom Sarajeva i masakra u Srebrenici 1995. u kome je ubijeno osam hiljada muslimanskih muškaraca i dečaka.