Σκοπός της JDS ήταν να συμβάλλει σε αρκετούς αντικειμενικούς στόχους της ICPDR, όπως: η αναγνώριση και επιβεβαίωση συγκεκριμένων εστιών μόλυνσης, η παρακολούθηση των φορέων μόλυνσης όπως ορίζεται στην προτεινόμενη Κατευθυντήρια Οδηγία της ΕΕ για ένα Πλαίσιο για τα Ύδατα, η παροχή ενός φόρουμ για τη συμμετοχή χωρών στις όχθες ή στην κοιλάδα του ποταμού για ασκήσεις λήψης δειγμάτων και μεταξύ τους συγκρίσεων, η διευκόλυνση συγκεκριμένων αναγκών επιμόρφωσης και βελτίωσης των συνθηκών στις χώρες, και προώθηση της αφύπνισης του κόσμου.
Svrha JDS bila je da se doprinese nekim ciljevima ICPDR, uključujući: pronalaženje i potvrdu određenih izvora zagađenja; analizu polutanata u skladu sa predloženim Smernicama EU za vodene tokove; organizovanje foruma za učešće obalskо/rečnih zemalja u obuci uzimanja uzoraka i međusobnog upoređivanja; omogućavanje posebnih obuka i pojedinačno poboljšavanje ekspertize zemalja; i upoznavanje javnosti sa situacijom.