Ωστόσο, κάποιοι ΜΚΟ, καθώς και οικογένειες των αγνοουμένων, θεωρούν τη δημιουργία του ενιαίου ιδρύματος αγνοουμένων προέκταση της εθνικιστικής πολιτικής της Β-Ε.
Ipak, neke nevladine organizacije, uključujući porodice nestalih, gledaju na stvaranje jedinstvene institucije za nestala lica kao na nastavak etničke politike u BiH.