Ο Κλαρκ διοίκησε τις δυνάμεις του ΝΑΤΟ κατά τη διάρκεια της Συμμαχικής αποστολής 78 ημερών το 1999, η οποία έδωσε τέλος στην εκστρατεία του καθεστώτος Μιλόσεβιτς για εθνική κάθαρση στο Κοσσυφοπέδιο.
Klark je komandovao snagama NATO-a tokom 78-dnevne akcije Alijanse 1999. godine, kojom je okončana kampanja etničkog čišćenja na Kosovu koju je sprovodio Miloševićev režim.