Според общия обвинителен акт Мърксич е бил командир на 1-ва гвардейска моторизирана бригада на ЮНА, която носи главната отговорност за тримесечната обсада на Вуковар, довела до падането му през ноември 1991 г.
Prema zajedničkoj optužnici, Mrkšić je bio komandant 1. Gardijske motorizirane brigade JNA, koja je snosila osnovnu odgovornost za tromjesečnu opsadu Vukovara, koja je dovela do njegovog konačnog pada u novembru 1991.