Турция е недоволна и от това, че е изключена от командването и контролните структури на операциите, водени от ЕС, които се провеждат в рамките на сътрудничеството между НАТО и ЕС, въпреки нейния значителен принос.
Turska je također frustrirana zbog toga što je isključena iz komandnih i kontrolnih struktura u operacijama pod vodstvom EU koje se odvijaju u okviru saradnje između NATO-a i EU, iako je sama dala značajan doprinos.