Новата работа на Лајчак е последна во серијата обврски што го доведоа на Балканот. Во периодот помеѓу 2001-та и 2005-та година, тој беше во Белград како амбасадор на Словачка во Федерална Република Југославија (подоцна Србија и Црна Гора), Албанија и Македонија.
Lajcak’ın yeni görevi, kendisini Balkanlar’a getiren bir dizi görevin sonuncusu. 2001-2005 yılları arasında Slovakya’nın Federal Yugoslavya Cumhuriyeti (daha sonra Sırbistan ve Karadağ adını aldı), Arnavutluk ve Makedonya büyükelçisi olarak hizmet eden Lajcak, 1998-2001 döneminde Slovak Dışişleri Bakanı Eduard Kukan’ın özel kalem müdürü olarak çalıştı.