За време на војната, Караџиќ беше претседател на републиката на Босанските Срби и на Националниот совет за безбедност, како и врховен командант на вооружените сили на Босанските Срби и лидер на Српската демократска партија.
Savaş sırasında Karadziç, Bosna Sırp cumhuriyetinin cumhurbaşkanı, Milli Güvenlik Konseyinin başkanı, Bosnalı Sırp silahlı kuvvetlerinin başkomutanı ve Sırbistan Demokrat Partisinin lideriydi.