Караџиќ за првпат беше обвинет, заедно со поранешниот воен шеф на босанските Срби, Ратко Младиќ, во јули 1995 година.
Karaciç ilk olarak, eski Bosnalı Sırp ordu komutanı Ratko Mladiç ile birlikte Temmuz 1995'te suçlandı. Aynı yılın Kasım ayında, ikiliyle ilgili ikinci bir iddianame daha doğrulandı.