Во тоа својство тој имаше де јуре и де факто команда и контрола врз сите хрватски сили распоредени во рамките на операцијата „Олуја“ во јужниот дел од регионот на Краина, велат обвинителите на ОН во изменетото обвинение против Готовина, кое беше обелоденето во март 2004 година.
BM savcıları Mart 2004'te kamuoyuna açıkladıkları iddianamede Gotovina'yı bu sıfatla Fırtına Operasyonu kapsamında Krajina bölgesinin güney kısmına gönderilen tüm Hırvat kuvvetlerinin meşru ve fiili kumanda ve kontrolünü elinde tuttuğunu öne sürüyorlardı.