Недоволна независност од законодавната и извршната власт, неефикасни судски постапки и оддолжувани судења, заостанати случаи и потреба од поголем професионализам кај судиите и обвинителите се некои од предизвиците со кои се соочува македонското судство, кое мора да биде усогласено со европските стандарди како дел од напорите на земјата за членство.
Yasama ve yürütmeden yeterince bağımsız hareket edilememesi, yargılama usullerinin yetersizliği, uzun süren mahkemeler, birikmiş davalar, hakim ve savcıların yeterince profesyonel bir tutum sergilememesi Makedon yargı sisteminin karşı karşıya olduğu sorunlardan bazıları ve bu sorunlar, ülkenin AB'ye katılma çabalarının bir parçası olarak AB standartları ile uyumlu hale getirilmek zorunda.