Турската моќна и целосно секуларна војска, која се сомнева во АКП, партија со исламски корени, откако дојде на власт во 2003 година, негира каква било поврзаност со Ергенекон и соработува во истрагата.
Türkiye'nin, İslamcı kökenli AKP'ye 2003 yılında iktidara gelmesinden bu yana şüpheyle yaklaşan güçlü ve laikliğe sadık ordusu Ergenekon ile herhangi bir şekilde bağlantısı olduğunu reddetti ve soruşturmada işbirliği gösterdi.