Во обвинението се тврди дека Ергенекон се обидела да предизвика хемиска и биолошка војна и дека стои зад трговијата со дрога во Турција.
İddianamede, Ergenekon'un kimyasal ve biyolojik savaş başlatmaya çalıştığı ve Türkiye'deki uyuşturucu kaçakçılığının arkasındaki varlık olduğu da iddia ediliyor.