49-годишниот Готовина исчезна во јуни 2001 година, набргу откако МКТЈ го обвини за неговата наводна улога во воените злосторства што ги извршиле војниците под негова команда кон крајот на конфликтот во Хрватска во периодот 1991-1995 година.
49 yaşındaki Gotovina, ICTY'nin kendisini Hırvatistan'daki 1991-1995 ihtilafının sonlarına doğru komutası altındaki askerlerin işlemiş olduğu savaş suçlarında rol oynadığı iddiasıyla suçlamasından kısa bir süre sonra, Haziran 2001'de ortadan kayboldu.