Наименуван од Слободан Милошевиќ, Павковиќ ги предводеше српските сили за време на кампаоата на Косово во 1998-1999 година и го задржа своето место началник на Генералштабот сé до крајот на јуни 2002 година.
Slobodan Miloşeviç tarafından atanan Pavkoviç 1998 - 1999 yılları arasında Kosova'ya karşı yürütülen kampanya'da Sırbistan güçlerini yönetmiş, 2002 yılının Haziran ayına değin görevde kalmıştı.