Një nga tre më të kërkuarit e gjykatës, ai u fsheh në mes të vititi 2001, menjëherë pasi prokurorët e OKB e akuzuan për krime lufte rreth rolit të tij të dyshuar në vrasjet e 150 serbëve të Krajinës dhe përzënien e 150,000 të tjerëve nga fundi i konfliktit të viteve 1991-1995, në Kroaci.
Gotovina, jedan od najtraženijih optuženika tribunala, u bekstvu je od sredine 2001. godine, neposredno nakon što su tužioci Haškog tribunala podigli optužnicu protiv njega zbog navodne uloge u ubistvu 150 krajiških Srba i proterivanju još 150.000 krajem sukoba u Hrvatskoj (1991-1995).