Kovaçeviç u akuzua në vitin 2001 së bashku me tre oficerë të tjerë, gjeneralin e ushtrisë jugosllave Pavle Strugar, nën admiralin në pension Miodrag Jokiç dhe nën admiralin e marinës, Milan Zec, për vrasjen e civilëve dhe shkatërrimin e shkaktuar ndaj qytetit historik.
Protiv Kovačevića je 2001. godine podignuta optužnica zajedno sa još tri oficira -- generalom jugoslovenske armije Pavlom Strugarom, penzionisanim viceadmiralom Miodragom Jokićem i mornaričkim viceadmiralom Miodragom Zecom -- zbog ubistva civila i štete nanete istorijskom gradu.