Fatmir Limaj ishte i nivelit më të lartë të të katërve dhe dyshohet se ka luajtur një rol drejtues në mizoritë e kryera gjatë konfliktit të vitit 1998-1999 në Kosovë.
Fatmir Limaj je u odnosu na ostalu trojicu obavljao najznačajniju funkciju i sumnja se da je imao vodeću ulogu u zločinima počinjenim tokom sukoba na Kosovu 1998-1999.