Gotovina përballet me katër akuza për krime kundër njerëzimit dhe tre raste shkeljesh të ligjeve ose zakoneve të luftës në lidhje me një ofensivë të ushtrisë kroate, me emrin e koduar Operacioni Stuhia, për rimarrjen e rajonit të Krajinës prej rebelëve serbë.
Gotovina je optužen po četiri tačke zločina protiv čovečnosti i tri tačke kršenja zakona i običaja rata u vezi sa hrvatskom akcijom Oluja koja je imala za cilj preotimanje Krajine od srpskih pobunjenika.