Akuzat fillestare të genocidit dhe të pjesëmarrjes në genocid nuk u konfirmuan në një padi të dytë, të amenduar lëshuar kundër Zupljanin në tetor 2004.
Prvobitne optužbe za genocid i saučesništvo u genocidu nisu potvrđene u drugoj, izmenjenoj optužnici koja je protiv Župljanina podignuta u oktobru 2004. godine.