Disa muaj përpara nisjes zyrtare të bisedimeve të anëtarësimit me Brukselin në tetor 2005, Ankaraja nënshkroi një protokoll që shtrinte marrëveshjen e saj të bashkimit doganor të vitit 1963 me BE për të mbuluar të gjithë anëtarët e rinj të bllokut, duke përfshirë Qipron.
Nekoliko meseci pre zvaničnog pokretanja razgovora o članstvu sa Briselom u oktobru 2005, Ankara je potpisala protokol kojim se njena carinska unija sa EU iz 1963. proširuje kako bi obuhvatila sve nove članove Unije, uključujući Kipar.