Në një garë të ngushtë, Presidenti jugosllav Vojisllav Koshtunica, i konsideruar një nacionalist i moderuar, u rendit përpara reformatorit Miroljub Labus, zëvendëskryeministrit federal, i cili kishte mbështetjen e aleancës serbe në pushtet DOS dhe nacionalistit ekstremist Vojisllav Sheshelj, i cili kandidoi me mbështetjen personale të Millosheviçit.
U tesnoj izbornoj trci, jugoslovenski predsednik Vojislav Koštunica, koji se smatra umerenim nacionalistom, pobedio je reformistu Miroljuba Labusa, potpredsednika savezne vlade, koji je imao podršku srpske vladajuće koalicije DOS i ekstremnog nacionalistu Vojislava Šešelja, koji se kandidovao sa ličnom podrškom Slobodana Miloševića.