Gotovina u fsheh në qershor 2001, disa javë pasi ICTY e paditi atë për rolin e tij të dyshuar në krimet e luftës të kryera nga trupat nën komandën e tij më 1995, duke përfshirë vrasjen e së paku 150 serbëve të Krajinës.
Gotovina je u bekstvu od juna 2001, nekoliko nedelja nakon što je MKSJ podigao optužnicu protiv njega zbog uloge koju je navodno imao u ratnim zločinima koje su 1995. godine počinile trupe pod njegovom komandom, uključujući ubistvo najmanje 150 krajiških Srba.