Në këtë rol, ai ushtroi de facto dhe de jure komandën dhe kontrollin mbi të gjitha forcat kroate të vendosura si pjesë e Operacionit Storm në pjesën jugore të rajonit të Krajinës, pretenduan prokurorët e OKB në një padi të amenduar kundër Gotovinës bërë publike në mars 2004.
U tom svojstvu imao je de fakto i de jure komandu i kontrolu nad svim hrvatskim snagama raspoređenim u sklopu Operacije oluja u južnom delu regiona Krajine, naveli su tužioci u izmenjenoj optužnici protiv Gotovine koja je objavljena u martu 2004. godine.