Duke ju referuar mizorive të kryera midis 1 korrikut 1991 dhe 30 nëntor 1995, padia e amenduar pretendon se Karaxhiç "planifikoi, nxiti, urdhëroi, kreu apo përndryshe ndihmoi dhe qe bashkëfajtor në planifikimin, përgatitjen dhe ekzekutimin e shkatërrimit, pjesërisht apo për të tërën, të grupeve etnike, kombëtare, raciale apo fetare muslimane boshnjake dhe kroate boshnjake.
U navodima izmenjene optužnice koji se odnose na zločine počinjene u periodu između 1. jula 1991. i 30. novembra 1995. tvrdi se da je Karadžić "planirao, podsticao, naredio, počinio ili na drugi način pomogao planiranje, pripremu ili izvršenje uništenja, u celini ili delimično, nacionalnih, etničkih, rasnih ili verskih grupa bosanskih Muslimana i bosanskih Hrvata" u brojnim opštinama.