Optužnica protiv Gotovine, koji se zajedno sa liderima bosanskih Srba iz ratnog perioda, Radovanom Karadžićem i Ratkom Mladićem, nalazi na vrhu liste najtraženijih optuženika tribunala, podignuta je 2001. godine.
Savaş zamanı Bosnalı Sırp liderleri Radovan Karadziç ve Ratko Mladiç ile birlikte BM mahkemesinin arananlar listesinin başında yer alan Gotovina hakkındaki suçlama Haziran 2001'de yayınlandı.