Međutim, islamski koreni AKP-a izazvali su sumnju među moćnom vojskom zemlje, koja sebe smatra garantom sekularnog uređenja Turske, mada su Erdogan i drugi lideri stranke više puta isticali da nemaju prikrivene verske ciljeve.
Ancak Erdoğan ve diğer parti yöneticilerinin gizli bir gündeme sahip olmadıklarını sürekli olarak belirtmelerine karşın, AKP'nin İslamcı kökleri kendisini Türkiye'de laik düzenin bekçisi olarak gören güçlü ordu içinde şüphelere yol açtı.