Branković nije komentarisao razloge svoje odluke, ali su krajem marta tužioci pokrenuli istragu protiv njega zbog navodne zloupotrebe vlasti i pronevere u vezi sa sticanjem luksuznog stana u Sarajevu. (Fena, BHRT, Onasa, Dnevni avaz, Pincom, BHRT - 26/05/09)
Brankoviç istifa kararının nedenleri konusunda yorum yapmamakla birlikte, Mart ayı sonlarında savcılar Saraybosna'da lüks bir apartman dairesi satın alınmasıyla ilgili olarak kendisi hakkında görevi kötüye kullanma ve zimmete para geçirme soruşturması başlatmışlardı. (Fena, BHRT, Onasa, Dnevni avaz, Pincom, BHRT - 26/05/09)