Mesićevi odnosi sa velikodostojnicima Hrvatske katoličke crkve bili su konstantno napeti, pošto je kritikovao njihovo učešće u politici, a oni njemu zamerali da ne štiti nacionalne interese.
Mesiç’in Katolik Kilisesi ile olan ilişkileri sürekli gerilimliydi, çünkü Mesiç Kiliseyi siyasete karışmakla, Kilise ise Mesiç’i ulusal çıkarları korumamakla eleştiriyordu.