Međutim, Gligorov je takođe izazvao gnev u svojoj zemlji 1994. godine kada je rekao grčkim medijima da su Makedonci slovenski narod, koji je došao na Balkan u 6. veku, te da nemaju veze sa Aleksandrom Velikim i njegovom civilizacijom.
Fakat Gligorov, 1984 yılında Yunan medyasına verdiği bir demeçte Makedonların 6. yüzyılda Balkanlar'a gelmiş bir Slav halkı olduğunu ve Büyük İskender ve onun medeniyetiyle hiçbir bağlantısı olmadığını söyleyerek ülkesinde öfkeye de neden olmuştu.