U Bosni i Hercegovini, mudžahedinski borci povezani sa Al Kaidom pridružili su se bosanskoj armiji u borbi protiv snaga bosanskih Srba.
Bosna-Hersek'te, Kaide ile bağlantılı mücahit savaşçılar Bosnalı Sırp kuvvetlerine karşı savaşta Bosna Ordusu yanında yer aldılar.