Skoplje će kao odvojena jedinica lokalne samouprave imati različitu organizacionu strukturu, zato što trenutni način vodi ka nefunkcionalnosti i preklapanju odgovornosti grada i opština.
Ayrı bir yerel özerk idare birimi olan Üsküp ise, mevcut yöntem işlevsizliğe ve şehir ve belediyeler arasındaki sorumlulukların örtüşmesine yol açtığı için farklı bir örgütsel yapıya sahip olacak.