Posle toga, između 1996. i 1998. bila je u Gradskom veću Skoplja. Šekerinska je bila član parlamenta između 1998. i 2002, a potpredsednik vlade je postala nakon što je SDSM pobedio na parlamentarnim izborima 2002. godine.
Bundan sonra, 1996-1998 arasında Üsküp İl Meclisinde yer aldı. 1998-2002 yılları arasında milletvekilliği yaparak SDSM'nin 2002 parlamento seçimlerini kazanması sonrasında başbakan yardımcısı oldu.