CEI sarađuje sa međunarodnim organizacijama i institucijama kao što su Organizacija za ekonomsku saradnju i razvoj, Savet Evrope, OEBS, Evropska banka za obnovu i razvoj i Svetska banka, i različite regionalne strukture, kao što su Jadransko-jonska inicijativa, Proces dunavske saradnje i Pakt za stabilnost.
CEI Ekonomik İşbirliği ve Kalkınma Örgütü, Avrupa Konseyi, AGİT, Avrupa Yeniden Yapılanma ve Kalkınma Bankası ve Dünya Bankası gibi uluslararası örgüt ve kurumlar ve Adriyatik-İyon İnisiyatifi, Tuna İşbirliği Süreci ve İstikrar Paktı gibi farklı bölgesel yapılarla işbirliği yapıyor.