U optužnici Haškog tribunala navodi se da je Rajić komandovao operativnom grupom Hrvatskog vijeća obrane (HVO), oružanih snaga samoproklamovane hrvatske zajednice Herceg-Bosna i da je 23. oktobra 1993. godine jedinica pod njegovom komandom napala i uništila selo Stupni Dol.
ICTY'nin suçlamalarında, Rajiç'in, kendi kendine ilan edilen Bosna-Hersek Hırvat Topluluğunun silahlı kuvvetleri olan Hırvat Savunma Konseyinin (HVO) bir harekat grubuna komuta ettiği ve komutası altındaki silahlı kuvvetlerin 23 Ekim 1993 tarihinde Stupni Dol'a saldırdığı ve yağmaladığı one suruluyor.