MKSJ je prvobitnu optužnicu protiv Župljanina, 56, podigao u decembru 1999. godine, smatrajući tog bivšeg komandanta Regionalnog centra bezbednosne službe u Banja Luci odgovornim za ratne zločine čije su žrtve bili nesrbi, tokom sukoba u BiH 1992-1995.
ICTY, Banja Luka'daki Bölgesel Güvenlik Teşkilatı Merkezinin 56 yaşındaki eski komutanı Zupljanin'i BH'deki 1992-1995 ihtilafı sırasında Sırp harici insanları mağdur eden savaş suçlarından sorumlu tutan ilk iddianamesini Aralık 1999'da yayınladı.