On je jedan od prvih verskih lidera koji su oštro reagovali na papin septembarski govor u Regenzburgu, u Nemačkoj, u kojem je pontifik citirao vizantijskog vladara iz 14. veka koji je učenja proroka Muhameda opisao kao "zla i nehumana".
Bardakoğlu, Papa'nın Eylül ayında Almanya'nın Rosenburg kentinde yaptığı ve bir 14. yüzyıl Bizans imparatorunun Hz. Muhammed'in öğretilerini "kötü ve insanlık dışı" olarak nitelendiren sözlerini aktardığı konuşmasına şiddetli tepki veren ilk dini liderlerden biriydi.