U tom svojstvu on je de jure i de fakto imao komandu i kontrolu nad svim hrvatskim snagama koje su u sklopu Operacije oluja bile razmeštene u južnom delu regiona Krajine, ustvrdili su tužioci Haškog suda u dopunjenoj optužnici protiv Gotovine koja je objavljena u martu 2004. godine.
BM savcıları Mart 2004'te kamuoyuna açıkladıkları iddianamede Gotovina'yı bu sıfatla Fırtına Operasyonu kapsamında Krajina bölgesinin güney kısmına gönderilen tüm Hırvat kuvvetlerinin meşru ve fiili kumanda ve kontrolünü elinde tuttuğunu öne sürüyorlardı.