On se također sučeljava s dvije točke optužnice za genocid u vezi sa 43-tjednom opsadom Sarajeva te za srebrenički masakr iz 1995. nad 8.000 muškaraca i dječaka bosanskih muslimana.
Protiv Karadžića je takođe podneta optužnica po dve tačke za genocid u vezi sa 43-mesečnom opsadom Sarajeva i masakra u Srebrenici 1995. u kome je ubijeno osam hiljada muslimanskih muškaraca i dečaka.