U optužnici ICTY-a navodi se da je Rajić zapovijedao operativnom skupinom Hrvatskog vijeća obrane (HVO), oružanih snaga samoproglašene Hrvatske zajednice Herceg-Bosne te da je 23. listopada 1993. godine postrojba pod njegovim zapovjedništvom napala i uništila selo Stupni Dol.
U optužnici Haškog tribunala navodi se da je Rajić komandovao operativnom grupom Hrvatskog vijeća obrane (HVO), oružanih snaga samoproklamovane hrvatske zajednice Herceg-Bosna i da je 23. oktobra 1993. godine jedinica pod njegovom komandom napala i uništila selo Stupni Dol.