Gotovina je bio jedan od trojice najtraženijih bjegunaca za ratne zločine iz balkanskih sukoba iz perioda 1990-tih godina, zajedno s bivšim liderom bosanskih Srba Radovanom Karadžićem i njegovim vojnim komandantom Ratkom Mladićem.
Готовина беше еден од најбараните бегалци обвинети за воени злосторства од балканските конфликти во 1990-тите, заедно со поранешниот водач на босанските Срби Радован Караџиќ и неговиот воен командант, Ратко Младиќ.