Neki smatraju da bi taj protokol mogao tužioce BiH staviti u inferiornu poziciju, tako da oni faktički postanu ogranak srbijanskog tužilaštva.
Некои сметаат дека протоколот може да ги стави обвинителите на БиХ во подредена позиција, правејќи ги -- всушност -- огранок на српското обвинителство.