Το 2004, όταν ιδρύθηκε το αρχηγείο, αυτό σήμαινε κοινή προεδρία στην Επιτροπή Αμυντικής Μεταρρύθμισης για εξάλειψη των στρατών της οντότητας, δημιουργία ενιαίας κρατικής ένοπλης δύναμης υπό τη δημοκρατική επίβλεψη πολιτών και σχεδιασμό στρατιωτικής δομής η οποία πληρούσε τις ρεαλιστικές ανάγκες και τις ικανότητες της Β-Ε.
Kada je sjedište uspostavljeno 2004. godine, to je podrazumijevalo supredsjedanje Povjerenstvom za obrambene reforme za ukidanje entitetskih vojski, ustroj jedinstvenih državnih oružanih snaga pod demokratskim civilnim nadzorom i kreiranje vojne strukuture koja ispunjava realne potrebe i sposobnosti BiH.