Σύμφωνα με το τροποποιημένο κοινό εγκλητήριο από το Σεπτέμβρη του 2003, κατηγορούνταν για επτά παραβιάσεις των νόμων ή θεσμών του πολέμου, για τη δολοφονία ή βάναυση μεταχείριση Κροατών και Σέρβων της Βοσνίας από στρατεύματα της διοίκησής τους, καθώς επίσης για απρόκλητη καταστροφή πόλεων, κωμοπόλεων και χωριών, λεηλασία περιουσιακών στοιχείων και βεβήλωση θρησκευτικών χώρων.
Izmijenjena zajednička optužnica iz rujna 2003. godine teretila ih je po sedam točaka za kršenja zakona i običaja rata, za ubojstva ili nehumano postupanje prema brojnim bosanskim Hrvatima i Srbima od strane snaga pod njihovim zapovjedništvom, kao i za bezobzirno razaranje gradova, mjesta i sela, pljačku imovine i uništavanje vjerskih objekata.