Ταυτόχρονα με τις προσπάθειές της για ένταξη στο ΝΑΤΟ, η πΓΔΜ έχει σημειώσει πρόοδο και στην προσπάθειά της για ένταξη στην ΕΕ, εφαρμόζοντας σειρά μεταρρυθμίσεων οι οποίες αποσκοπούν στον εναρμονισμό της νομοθεσίας της με αυτή της Ένωσης.
Zajedno s naporima u smjeru članstva u NATO-u, Makedonija je također ostvarila napredak u svojim naporima za priključenje EU, provodeći niz reformi koje za cilj imaju harmonizaciju njezina zakonodavstva s zakonodavstvom Unije.