Εισαγγελείς του ΟΗΕ κατηγόρησαν τον Γκοτοβίνα το 2001, για εγκλήματα που προκύπτουν από το φερόμενο ρόλο του σε αγριότητες που διεπράχθησαν κατά τη διάρκεια επίθεσης του Κροατικού Στρατού το 1995 εναντίον Σέρβων αυτονομιστών στην περιοχή Κράινα.
Tužitelji UN-a podignuli su 2001. godine optužnicu protiv njega tereteći ga za navodnu ulogu u zločinima počinjenim 1995. godine tijekom ofenzive Hrvatske vojske protiv srpskih separatista u području Krajine.