Επίσης αντιμετωπίζει δυο κατηγορίες γενοκτονίας σχετικά με την πολιορκία του Σεράγεβο, διάρκειας 43 μηνών, και τη σφαγή της Σρεμπρένιτσα.
Karadžić se također sučeljava s dvjema točkama optužnice koje ga terete za genocid u svezi sa 43-mjesečnom opsadom Sarajeva i pokoljem u Srebrenici 1995. godine.