Ο Τζίντζιτς δολοφονήθηκε από πυρά ελεύθερου σκοπευτή την ώρα που έβγαινε από το αυτοκίνητό του, έξω από τα κεντρικά γραφεία της Σερβικής κυβέρνησης στις 12 Μαρτίου του 2003.
Đinđić je ubijen snajperom po izlasku iz svojeg automobila pred sjedištem srpske vlade 12. svibnja 2003.