Ένας άλλος τομέας όπου ήδη ενέκυψαν δυσκολίες κατά τη διαδικασία ελέγχου αφορά στην εναρμόνιση του τελωνειακού καθεστώτος της Κροατίας με το κοινοτικό κεκτημένο.
Tarama sürecinde karşılaşılan bir diğer sorun ise, Hırvat gümrük rejiminin müktesebat ile uyumlu hale getirilmesi.