Αν και η συμφωνία πιστώνεται ότι σταμάτησε τη βία, οι περισσότεροι παρατηρητές συμφωνούν ότι το πολιτικό σύστημα που δημιουργήθηκε είναι περίπλοκο, αναποτελεσματικό, δαπανηρό και τελικά ασύμβατο με τα πρότυπα της ΕΕ.
Dayton Anlaşması, yaşanan şiddete son vermekle birlikte, pek çok gözlemci, anlaşma ile kurulan siyasi sistemin karmaşık, verimsiz, pahalı ve nihayet AB standartları ile uyumsuz olduğunu düşünüyor.