Οι επικριτές του πρωτοκόλλου υποστηρίζουν ότι επειδή αρκετοί πολίτες της Β-Ε βρίσκονται υπό έρευνα σύμφωνα με εντολές που έχουν εκδοθεί από τη σερβική υπηρεσία, οι διαδικασίες ενδέχεται να θέσουν σε κίνδυνο τη συμφιλίωση στην περιοχή.
Karşıtlar, çok sayıda BH vatandaşı Sırp savcılığının talimatları uyarınca soruşturma altında olduğu için, işlemlerin bölgede uzlaşmayı tehlikeye atabileceğini savunuyor.