Ο Μπάμπιτς κατηγορήθηκε από το Διεθνές Ποινικό Δικαστήριο για την πρώην Γιουγκοσλαβία (ICTY) το Νοέμβριο του 2003, κατηγορούμενος για εγκλήματα κατά της ανθρωπότητας, για πολιτικές, φυλετικές και θρησκευτικές διώξεις και τέσσερις κατηγορίες για παραβιάσεις νόμων ή θεσμών του πολέμου, συμπεριλαμβανομένης της δολοφονίας, βάναυσης μεταχείρισης, απρόκλητη ή στρατιωτικά περιττής καταστροφής χωριών και καταστροφή ή πρόκληση ζημιών σε εκπαιδευτικά και θρησκευτικά ιδρύματα.
Babiç'e, Kasım 2003'te Eski Yugoslavya Hakkındaki Uluslararası Ceza Mahkemesi (ICTY) tarafından siyasi, ırksal ve dini sebeplerle zulmetmekten insanlığa karşı suçun yanı sıra aralarında cinayet, kötü muamele, köylerin nedensiz ve askeri açıdan gereksiz imhası ve eğitim amaçlı ve dini kurumlara hasar vermenin de yer aldığı dört adet savaş yasa ve geleneklerini ihlal iddiasıyla suçlamada bulunulmuştu.