Μαζί με τον Αντισυνταγματάρχη Ντράγκαν Ιόκιτς, ο Μπλαγκόιεβιτς αντιμετωπίζει κατηγορίες συνενοχής σε γενοκτονία, εγκλήματα κατά της ανθρωπότητας και παραβιάσεις των νόμων και θεσμών του πολέμου.
Yarbay Dragan Jokiç'le birlikte Blagojeviç, soykırım, insanlığa karşı suç ve savaş yasaları ve geleneklerinin ihlali suçlamalarıyla karşı karşıya bulunuyor.