Στη Βοσνία και Ερζεγοβίνη, μαχητές μουτζαχεντίν με διασυνδέσεις με την αλ-Κάιντα, εντάχθηκαν στο Βοσνιακό Στρατό στον αγώνα κατά των Σερβοβόσνιων δυνάμεων.
Bosna-Hersek'te, Kaide ile bağlantılı mücahit savaşçılar Bosnalı Sırp kuvvetlerine karşı savaşta Bosna Ordusu yanında yer aldılar.