Το 1992 και το 1998 ο Ρουγκόβα εκλέχθηκε πρόεδρος της αυτοαποκαλούμενης "Δημοκρατίας του Κοσσυφοπεδίου", η οποία δεν αναγνωριζόταν από το Βελιγράδι.
LDK Sırp ve federal seçimlerini boykot ederek etnik Arnavut nüfus için paralel bir hastane, okul ve vergi idaresi oluşturulmasına yardım etti. 1992 ve 1998 yıllarında Rugova, Belgrad tarafından tanınmayan kendinden menkul "Kosova Cumhuriyeti"ne cumhurbaşkanı seçildi.