Οι τέως στρατηγοί που συνελήφθησαν επιμένουν ότι δεν έχουν κάνει τίποτε παράνομο ή ενάντιο στα συμφέροντα της Τουρκίας, ενώ και οι Τουρκικές ένοπλες δυνάμεις αρνούνται οποιαδήποτε σχέση με την Εργκένεκον.
Gözaltına alınan eski generaller yasadışı veya Türkiye'nin çıkarlarına aykırı bir şey yapmadıklarında ısrar ederken, Türk silahlı kuvvetleri Ergenekon ile herhangi bir bağı olduğunu reddediyor.