Η υλοποίηση της Σύμβασης του Βουκουρεστίου, περιλαμβανομένων και των τριών πρωτοκόλλων για τον έλεγχο της μόλυνσης από χερσαίες πηγές, την απόρριψη αποβλήτων και την κοινή δράση σε περίπτωση τυχαίων συμβάντων (όπως πετρελαιοκηλίδες) συντονίζεται από την Επιτροπή της Μαύρης Θαλάσσης, η γραμματεία της οποίας εδρεύει στην Ιστανμπούλ.
Karasal kirlilik kaynakları, atık boşaltma ve (petrol dökülmesi gibi) kazalarda ortak hareket konularındaki üç özel protokolü de içeren Bükreş Anlaşmasının uygulama süreci, genel merkezi İstanbul'da bulunan Karadeniz Komisyonu tarafından koordine ediliyor.