Η σύγκρουση μεταξύ των δύο αυτών βασικών θεσμών κορυφώθηκε με την τρέχουσα υπόθεση εναντίον υπερεθνικιστικής, κοσμικής οργάνωσης γνωστή ως Εργκένεκον, τα μέλη της οποίας δικάζονται για φερόμενη απόπειρα ανατροπής της κυβέρνησης.
Bu iki baş kurum arasındaki ihtilaf, üyelerinin hükümeti devirmeye çalıştıkları iddiasıyla yargılanmakta olduğu sözde Ergenekon adlı aşırı milliyetçi ve laik bir gruba karşı devam eden davada zirveye ulaştı.