Στις αρχές της δεκαετίας του 1990, ως τμήμα του πρώην Γιουγκοσλαβικού στρατού και υπό την ισχυρή επιρροή της κυβέρνησης Μιλόσεβιτς στη Σερβία, Μαυροβούνιοι στρατιώτες έλαβαν μέρος στο βομβαρδισμό του Ντουμπρόβνικ, ιστορική πόλη υπό την αιγίδα της UNESCO.
1990'ların başlarında, Karadağlı askerler eski Yugoslav ordusunun bir parçası olarak ve Sırbistan'daki Miloseviç hükümetinin de güçlü etkisiyle, UNESCO'nun koruması altındaki tarihi bir kent olan Dubrovnik'in bombalanmasında yer aldılar. 2001 yılında, Karadağ Cumhurbaşkanı Milo Cukanoviç saldırılardan ötürü bütün Hırvat halkından özür diledi.