Ο Στάμπολιτς εξαφανίσθηκε ενώ έκανε το πρωινό του τζόκιν σε πάρκο του Βελιγραδίου στις 25 Αυγούστου του 2000, λίγες εβδομάδες πριν τις προεδρικές εκλογές, στις οποίες αναμενόταν να υπερνικήσει του Μιλόσεβιτς, αλλά ο πρώην σύμμαχος αποδείχτηκε εχθρός.
Stamboliç, sonradan hasmı olan eski yandaşı Miloşeviç'e karşı yarışmasının beklendiği cumhurbaşkanlığı seçimlerinden yalnızca birkaç hafta önce, 25 Ağustos 2000 tarihinde sabah koşusunu yaparken ortadan kaybolmuştu.