Εκείνο το διάστημα, ο Γιοβάνοβιτς ήταν υποδιοικητής της JSO, η οποία συγκροτήθηκε από τις τάξεις των περιβόητων παραστρατιωτικών μονάδων του Μιλόσεβιτς που πολέμησαν κατά τη διάρκεια των βαλκανικών πολέμων τη δεκαετία του 1990.
Miloşeviç'in 1990'larda Balkanlar'da savaşan meşhur yarı sivil silahlı güçlerinden gelen Yovanoviç, bir zamanlar JSO'nun komutan yardımcısıydı.