Η Βοσνιακή σύγκρουση του 1992-1995 ρήμαξε τη Μόσταρ με αποτέλεσμα οι Βόσνιοι Μουσουλμάνοι και οι Κροάτες να αποτελέσουν την τοπική πλειονότητα.
Çok sayıda savaş öncesi Ortodoks vatandaş Paskalya kutlamalarında Mostar'daki geri kalan Ortodoks azınlığa yardım etmek üzere geri döndü. 1992-1995 Bosna ihtilafında Mostar harap olmuş ve Bosnalı Müslüman ve Hırvatlar yerel çoğunluk haline gelmişti.