Το ICTY εξέδωσε το αρχικό κατηγορητήριο εναντίον του Ζουπλιάνιν, 56 ετών, το Δεκέμβρη του 1999, κατηγορώντας τον πρώην διοικητή του Περιφερειακού Κέντρου Υπηρεσιών Ασφαλείας στη Μπάνια Λούκα για εγκλήματα πολέμου εναντίον μη Σέρβων, κατά τη διάρκεια της σύγκρουσης του 1992-1995 στη Β-Ε.
ICTY, Banja Luka'daki Bölgesel Güvenlik Teşkilatı Merkezinin 56 yaşındaki eski komutanı Zupljanin'i BH'deki 1992-1995 ihtilafı sırasında Sırp harici insanları mağdur eden savaş suçlarından sorumlu tutan ilk iddianamesini Aralık 1999'da yayınladı.