Εν τω μεταξύ, σε ότι έχει να κάνει με σημαντικά ζητήματα όπως η καταδίωξη φερόμενων εγκληματιών πολέμου, η EUFOR θα έχει στενή συνεργασία με το ΝΑΤΟ, το οποίο θα διατηρήσει μειωμένη παρουσία στην Β-Ε μετά τη λήξη της θητείας της SFOR.
Bu arada EUFOR, savaş suçu zanlılarının yakalanması gibi kilit meselelerde, SFOR'un görev süresinin sona ermesi sonrasında BH'de azaltılmış bir varlığı sürdürecek olan NATO ile yakın işbirliği içerisinde çalışacak.