Στο πλαίσιο της αμυντικής μεταρρύθμισης του 2003, η Β-Ε διαθέτει ένα υπουργείο Άμυνας κρατικού επιπέδου και ένα για κάθε μια από τις δυο οντότητες της Β-Ε -- RS και Ομοσπονδία της Β-Ε (FBiH).
2003 tarihli savunma reformu uyarınca BH, bir devlet düzeyinde savunma bakanlığına, BH'nin iki tarafı olan SC ve BH Federasyonu (BHF) içinse birer savunma bakanlığına sahip.