Μια τρίτη τροποποιημένη μήνυση που υπεβλήθη τον Ιούνιο του 2003 τον κατηγορούσε για έξι επί μέρους κατηγορίες για εγκλήματα κατά της ανθρωπότητας.
Nikoliç aleyhine Haziran 2003'te yayınlanan 3. değiştirilmiş iddianamede, sanık sekiz adet insanlığa karşı suçla itham edildi.