Ο Ντινκ δολοφονήθηκε έξω από τα γραφεία το 2007, δολοφονία που λέγεται ότι συνδέεται με στοιχεία στο "Βαθύ Κράτος" της Τουρκίας. Ο Ντινκ είχε μετατρέψει την εφημερίδα από φερέφωνο της μικρής αρμενικής κοινότητας της Τουρκίας και την χρησιμοποιούσε για την αντιμετώπιση ορισμένων πολύ ευαίσθητων θεμάτων που αφορούν στην σύγχρονη πολιτιστική και εθνοτική ταυτότητα της Τουρκίας.
2007 yılında Türkiye’deki “Derin Devlet” unsurlarıyla bağlantılı olduğu iddia edilen bir suikast sonucunda gazete binasının önünde vurularak öldürülen Dink, Agos’u Türkiye’deki küçük çaplı Ermeni cemaatinin sözcüsü olmaktan çıkarıp, modern Türkiye’nin kültürel ve etnik kimliğiyle ilgili bazı hassas meseleleri ele aldığı bir mecra haline getirdi.