Ωστόσο, κάποιοι ΜΚΟ, καθώς και οικογένειες των αγνοουμένων, θεωρούν τη δημιουργία του ενιαίου ιδρύματος αγνοουμένων προέκταση της εθνικιστικής πολιτικής της Β-Ε.
Kayıp aileleri ve bazı sivil toplum örgütleri, tek bir kayıp kişiler enstitüsü kurulmasını BH'nin etnik tabanlı siyasetinin bir uzantısı olarak görüyor.