Një konflikt i vazhduar për kufirin që kur të dyja shtetet shpallën pavarësinë nga ish-Jugosllavia në vitin 1991 ka ndikuar periodikisht lidhjet midis Zagrebit dhe Ljubljanës.
İki ülkenin 1991 yılında eski Yugoslavya'dan bağımsızlık ilan etmelerinden bu yana devam eden sınır anlaşmazlığı, Zagreb ile Ljubljana arasındaki ilişkileri düzenli olarak etkiliyor.