Kontrolli i shtetit i siguruar nëpërmjet një hallke të vetme drejtimi që vepron nga presidenti i BH tek ministri i mbrojtjes, pastaj tek shefat e përbashkët të personelit dhe poshtë tek komandantët e funksionimit dhe mbështetjes së trupave. Një buxhet shtetëror mbrojtje i vetëm filloi në 1 Janar 2006. Në 1 korrik 2007, shtabi i përgjithshëm i brigadës së re duhet të krijohet dhe në 31 dhjetor 2007 duhet të përfundojë riorganizimi.
BH Cumhurbaşkanlığı makamından Savunma Bakanlığına, oradan da Ortak Genel Kurmay Başkanlıkları ile Harekat ve Destek Komutanlıklarına uzanan tek bir komuta zinciri oluşturulmuş ve bu zincirde devlet kontrolü esas alınmıştır. 1 ocak 2006’da tek bir devlet savunma bütçesi yürürlüğe koyulmuştur. 1 Temmuz 2007’ye kadar yeni Tugay Karargahı kurulmuş, 31 Aralık 2007’ye kadar ise yeniden yapılanma tamamlanmış olacaktır.