Në Bosnje dhe Herzegovinë, luftëtarët muxhahidinë me lidhje me al-Kaedën u bashkuan me ushtrinë boshnjake në luftën kundër forcave serbe boshnjake.
Bosna-Hersek'te, Kaide ile bağlantılı mücahit savaşçılar Bosnalı Sırp kuvvetlerine karşı savaşta Bosna Ordusu yanında yer aldılar.