Një akuzë e tretë e ndryshuar u ngrit ndaj tij në qershor 2003 duke e ngarkuar me tetë akuza për krime kundër njerëzimit.
Nikoliç aleyhine Haziran 2003'te yayınlanan 3. değiştirilmiş iddianamede, sanık sekiz adet insanlığa karşı suçla itham edildi.