Një padi e amenduar me 11 akuza lëshuar në maj 2000, që zëvendësoi një tjetër të mëparshme dorëzuar në korrik 1995, e akuzon Karaxhiç me një shumicë krimesh lufte kundër jo-serbëve, duke përfshirë shfarosjen, vdekjen, vrasjen me dashje, persekutimet, deportimet, veprimet shnjerëzore, terrorizimin dhe marrjen e pengjeve.
Temmuz 1995’teki ilk iddianamenin yerini alan Mayıs 2000 tarihli, 11 maddelik değiştirilmiş iddianamede Karadziç, Sırp olmayanları hedef alan ve aralarında imha, cinayet, kasten adam öldürme, işkence, sürgün, insanlık dışı hareketler, korkutma ve rehin alma gibi eylemlerin bulunduğu çok sayıda savaş suçu işlemekle suçlanıyor.