Në një padi të përbashkët kundër Krajishnik dhe ish presidentes serbe boshnjake Biljana Plavshiç, prokurorët e OKB-së akuzonin se të dy ata, së bashku me të tjerë, duke përfshirë Karaxhiçin dhe ish komandantin e ushtrisë serbe boshnjake Ratko Mlladiç, qenë përfshirë në një sërë krimesh kryer midis 1 korrikut 1991 dhe 30 dhjetorit 1992.
BM savcıları Krajisnik ve eski Bosnalı Sırp Cumhurbaşkanı Biljana Plavsiç için hazırladıkları ortak iddianamede, ikilinin -aralarında Radovan Karadziç ve eski Bosnalı Sırp ordu komutanı Ratko Mladiç'in de yer aldığı diğerleriyle birlikte- 1 Temmuz 1991 ile 30 Aralık 1992 tarihleri arasında işlenmiş bir çok suçta yer aldığını öne sürdüler.