Gjatë udhtëimit të saj, Merkel mbajti bisedime gjithashtu me krerë fetarë, duke përfshirë patriarkun ekumenik ortodoks Bartolemeun, myftiun e Stambollit Mustafa Çagriçi dhe kryerabiun turk Isak Haleva.
Ziyaretinde Merkel, Ekümenik Ortodoks Patriği Bartolomeus, İstanbul Müftüsü Mustafa Çağrıcı ve Türkiye Baş Hahamı İzak Haleva olmak üzere dini liderlerle de görüştü.