Mlladiçi ishte akuzuar fillimisht për krime të luftës që rridhnin nga konflikti në BiH në korrik 1995, nën një padi të përbashkët me udhëheqësin politik serb boshnjak të kohës së luftës Radovan Karaxhiç, por kjo padi më pas u nda në dy çështje të veçanta.
Mladiç başlangıçta, savaş zamanı Bosnalı Sırp siyasi lider Radovan Karaciç ile birlikte ortak bir iddianamede Temmuz 1995'te BH'de yaşanan ihtilaftan kaynaklanan savaş suçlarıyla suçlanmasına rağmen, daha sonra bu dava iki ayrı davaya bölünmüştü.