Pikat e kundërshtimit përfshinin emrin "Maqedoni", yllin e Verxhinës, zbuluar në Greqi por i përdorur ende në një formë të modifikuar si flamuri zyrtar i Maqedonisë, dhe praninë e diskutueshme të një "pakice maqedonase" në Greqinë e Veriut.
Anlaşmazlık noktaları arasında "Makedonya" ismi, Yunanistan'da ortaya çıkarılmasına karşın değiştirilmiş biçimiyle Makedonya'nın resmi bayrağında hâlâ kullanılmakta olan Vergina yıldızı ve kuzey Yunanistan'da bir "Makedon azınlığın" tartışmalı varlığı yer alıyor.