Babiç u padit nga Gjykata Penale Ndërkombëtare për ish Jugosllavinë (ICTY) në nëntor 2003 me një akuzë të krimeve kundër njerëzimit për ndjekje mbi baza politike, raciale e fetare dhe katër akuza të shkeljes së ligjeve apo rregullave të luftës, duke përfshirë vrasjen, trajtimin mizor, shkatërrimin e kotë apo ushtarakisht të panevojshëm të fshatrave dhe shkatërrimin ose dëmtimin e institucioneve arsimore e fetare.
Babiç'e, Kasım 2003'te Eski Yugoslavya Hakkındaki Uluslararası Ceza Mahkemesi (ICTY) tarafından siyasi, ırksal ve dini sebeplerle zulmetmekten insanlığa karşı suçun yanı sıra aralarında cinayet, kötü muamele, köylerin nedensiz ve askeri açıdan gereksiz imhası ve eğitim amaçlı ve dini kurumlara hasar vermenin de yer aldığı dört adet savaş yasa ve geleneklerini ihlal iddiasıyla suçlamada bulunulmuştu.