Brankoviç nuk komentoi mbi arsyet për veprimin e tij, por në fund të marsit, prokurorët nisën një hetim kundër tij lidhur me shpërdorimin e dyshuar të pushtetit dhe keqpërdorimin në blerjen e një apartmanrti luksoz në Sarajevë. (Fena, BHRT, Onasa, Dnevni avaz, Pincom, BHRT - 26/05/09)
Brankoviç istifa kararının nedenleri konusunda yorum yapmamakla birlikte, Mart ayı sonlarında savcılar Saraybosna'da lüks bir apartman dairesi satın alınmasıyla ilgili olarak kendisi hakkında görevi kötüye kullanma ve zimmete para geçirme soruşturması başlatmışlardı. (Fena, BHRT, Onasa, Dnevni avaz, Pincom, BHRT - 26/05/09)