Sezer vuri veton ndaj disa projekt-ligjeve mbi bazën e asaj se shkelnin parimin e sekularizmit dhe ai gjithashtu vuri veton ndaj emërimeve të së paku 350 zyrtarëve me prirje islamike në pozitat kyçe.
Laiklik ilkesini ihlal ettiği gerekçesiyle pek çok yasa tasarısını veto eden Sezer, İslami eğilimli en az 350 yetkilinin de önemli görevlere getirilmesine de karşı çıktı.