Gotovina, i cili së bashku me krerët serbë boshnjakë të luftës, Radovan Karaxhiç dhe Ratko Mlladiç, kryeson listën e më të kërkuarve të gjykatës së OKB-së, u padit në qershor 2001.
Savaş zamanı Bosnalı Sırp liderleri Radovan Karadziç ve Ratko Mladiç ile birlikte BM mahkemesinin arananlar listesinin başında yer alan Gotovina hakkındaki suçlama Haziran 2001'de yayınlandı.