Si i tillë, ai ushtroi de jure dhe de facto komandën dhe kontrollin mbi forcat kroate të dislokuara si pjesë e Operacionit Stuhia në pjesën jugore të rajonit të Krajinës, akuzonin prokurorët e OKB-së në një padi të amenduar kundër Gotovinës bërë publike në mars 2004.
BM savcıları Mart 2004'te kamuoyuna açıkladıkları iddianamede Gotovina'yı bu sıfatla Fırtına Operasyonu kapsamında Krajina bölgesinin güney kısmına gönderilen tüm Hırvat kuvvetlerinin meşru ve fiili kumanda ve kontrolünü elinde tuttuğunu öne sürüyorlardı.