The CEI co-operates with international organisations and institutions such as the Organisation for Economic Co-operation and Development, the Council of Europe, the OSCE, the European Bank for Reconstruction and Development and the World Bank, and different regional structures, such as the Adriatic-Ionian Initiative, the Danube Co-operation Process and the Stability Pact.
CEI bashkëpunon me organizata dhe institucione ndërkombëtare të tilla si Organizata për Bashkëpunimin Ekonomik dhe Zhvillimin, Këshilli i Evropës, OSBE, Banka Evropiane për Rindërtimin e Zhvillimin dhe Banka Botërore si dhe me struktura të ndryshme rajonale si Nisma Adriatiko-Ioniane, Procesi i Bashkëpunimit i Danubit dhe Pakti i Stabilitetit.