Η συμφωνία DANUBE FAB διευθετεί τη δομή διακυβέρνησης του προγράμματος, καθορίζοντας τους ρόλους και τις ευθύνες όλων των εμπλεκομένων, συμπεριλαμβανομένων των Αρχών υπηρεσιών εναέριας κυκλοφορίας των δυο χωρών, της Βουλγαρικής BULATSA και της Ρουμανικής ROMATSA, του στρατού και των ρυθμιστικών Αρχών.
Marrëveshja DANUBE FAB vendos strukturën qeverisëse të projektit, përcakton rolet dhe përgjegjësitë e të gjithë të përfshirëve, duke përfshirë autoritetet e shërbimeve të trafikut ajror të të dy vendeve, BULATSA e Bullgarisë dhe ROMATSA e Rumanisë, ushtrinë dhe rregullatorët.