Η ΕΕ σχεδίαζε να αναλάβει την αποστολή από το ΝΑΤΟ με τη λήξη της εντολής, αλλά η διαδικασία καθυστέρησε εξαιτίας μιας διένεξης μεταξύ Ελλάδας και Τουρκίας σχετικά με τη διασφάλιση της πρόσβασης της Ένωσης σε στοιχεία του ΝΑΤΟ σε τομείς όπως ο στρατιωτικός σχεδιασμός, οι πληροφορίες και η διοικητική μέριμνα.
BE ishte duke planifikuar të merrte kontrollin e misionit nga NATO me mbarimin e mandatit, por përparimi u bllokua për shkak të një mosmarrëveshje ndërmjet Greqisë dhe Turqisë në lidhje me sigurimin e mundësisë së disponimit nga Bashkimi të pasurive të NATO-s në fusha të tilla si planifikimi ushtarak, zbulimi dhe logjistika.