Επειδή ο στρατός θεωρείται ως ύστατος φύλακας του κοσμικού συστήματος της Τουρκίας, είχε μια δύσκολη σχέση με το κυβερνών Κόμμα Δικαιοσύνης και Ανάπτυξης (AKP) που είναι βαθιά ριζωμένο στο Ισλάμ.
Meqënse ushtria e sheh veten si rojen e fundit të sistemit laik të Turqisë, ajo ka patur një marrëdhënie jo të lehtë me Partinë për Drejtësi e Zhvillim (AKP) në pushtet, e cila ka rrënjë islamike.