Ο Γκοτόβινα αντιμετωπίζει τέσσερις κατηγορίες για εγκλήματα κατά της ανθρωπότητας και τρεις κατηγορίες παραβιάσεων κανόνων και ηθών πολέμου σε σχέση με τις επιχειρήσεις του κροατικού στρατεύματος, που έφεραν τον κωδικό «Επιχείρηση Καταιγίδα», για την ανακατάληψη, από τους σέρβους αντάρτες, της περιοχής Κραϊίνα.
Gotovina përballet me katër akuza për krime kundër njerëzimit dhe tre raste shkeljesh të ligjeve ose zakoneve të luftës në lidhje me një ofensivë të ushtrisë kroate, me emrin e koduar Operacioni Stuhia, për rimarrjen e rajonit të Krajinës prej rebelëve serbë.