Στο πλαίσιο της αμυντικής μεταρρύθμισης του 2003, η Β-Ε διαθέτει ένα υπουργείο Άμυνας κρατικού επιπέδου και ένα για κάθε μια από τις δυο οντότητες της Β-Ε -- RS και Ομοσπονδία της Β-Ε (FBiH).
Sipas reformës së mbrojtjes të vitit 2003, BiH ka një ministri të mbrojtjes në nivel shtetëror dhe nga një për çdo dy njësitë e BiH, RS dhe Federatën e BiH (FBiH).