Ο Κλαρκ διοίκησε τις δυνάμεις του ΝΑΤΟ κατά τη διάρκεια της Συμμαχικής αποστολής 78 ημερών το 1999, η οποία έδωσε τέλος στην εκστρατεία του καθεστώτος Μιλόσεβιτς για εθνική κάθαρση στο Κοσσυφοπέδιο.
Klark komandoi forcat e NATO-s gjatë aksionit 78-ditor të Aleancës në vitin 1999 i cili i dha fund fushatës së regjimit të Millosheviçit për pastrimin etnik të Kosovës.