Οι επικριτές της Εργκένεκον ισχυρίζονται ότι ο στρατός δεν σχεδίαζε να κάνει πραξικόπημα και ότι η Εργκένεκον δεν είναι τίποτα άλλο από μια επινοημένη από το ΚΔΑ συνωμοσία προκειμένου να καταδυναστεύσει και "φιμώσει" την αντιπολίτευση.
Kritikët e Ergenekonit argumentojnë se ushtria nuk kishte planifikuar të kryente një grusht shteti dhe se Ergenekoni nuk është asgjë tjetër përveç një konspiraci e sajuar nga AKP për të shtypur dhe heshtur opozitën.