Η διαφωνία ονόματος προκύπτει από αξίωση της Ελλάδος ότι το όνομα Μακεδονία, το οποίο επέλεξε η χώρα μετά την ανεξαρτησία της από τη Γιουγκοσλαβία το 1991, υπονοεί εδαφική αξίωση στη βόρεια Ελληνική επαρχία με το ίδιο όνομα.
Mosmarrëveshja për emrin rrjedh nga pretendimi i Greqisë se emri Maqedoni, që vendi zgjodhi pas fitimit të pavarësisë nga Jugosllavia në 1991, nënkupton një pretendim territorial mbi krahinën e Greqisë veriore me të njëjtin emër.