Οι δυο χώρες διαφωνούν επίσης για τα χωρικά ύδατα στον Κόλπο Πιράν, καθώς επίσης αρκετά άλλα ζητήματα όπως τα μειονοτικά δικαιώματα και τα χρέη που οφείλονται σε Κροάτες πελάτες της Τράπεζας Λιουμπλιάνα.
Ato nuk janë dakord gjithashtu në kufirin e tyre detar në gjirin Piran si edhe në një numër të tjera çështjesh të tilla si të drejtat e pakicave dhe borxhet që u detyrohen klientëve kroatë nga Ljubjlana Bank.