Το νομοσχέδιο ορίζει επίσης ότι τα πανεπιστήμια θα είναι αυτόνομα επιστημονικά, διοικητικά και οικονομικά, και ότι το νέο συντονιστικό συμβούλιο ανώτερης εκπαίδευσης θα είναι υπεύθυνο για τις πειθαρχικές ποινές στα πανεπιστήμια.
Projekt ligji nxit gjithashtu universitetet të bëhen të pavarur në çështjet shkencore, administrative dhe financiare dhe se bordi i ri i bashkërendimit të arsimit të lartë do të jetë përgjegjës për dënimet disiplinore në universitete.