Ο κρατικός έλεγχος εξασφαλίζεται μέσω μιας ενιαίας διοίκησης η οποία απορρέει από την Προεδρία της Β-Ε, μεταβιβάζεται στο Υπουργείο Άμυνας, κατόπιν στο Γενικό Επιτελείο και τους Διοικητές των Διοικήσεων Επιχειρήσεων και Υποστήριξης.
Kontrolli i shtetit i siguruar nëpërmjet një hallke të vetme drejtimi që vepron nga presidenti i BH tek ministri i mbrojtjes, pastaj tek shefat e përbashkët të personelit dhe poshtë tek komandantët e funksionimit dhe mbështetjes së trupave.