Εν τω μεταξύ, σε ότι έχει να κάνει με σημαντικά ζητήματα όπως η καταδίωξη φερόμενων εγκληματιών πολέμου, η EUFOR θα έχει στενή συνεργασία με το ΝΑΤΟ, το οποίο θα διατηρήσει μειωμένη παρουσία στην Β-Ε μετά τη λήξη της θητείας της SFOR.
Ndërkohë, mbi çështjet kyçe, të tilla si gjurmimi për kriminelët e dyshuar të luftës, EUFOR do të punojë në bashkëpunim të ngushtë me NATO, e cila do të mbajë një prani të reduktuar në BiH pasi të skadojë mandati i SFOR-it.